RNA id: TCONS_00031294


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00031294
length 110
RNA type miRNA
GC content 0.64
exon number 1
gene id XLOC_015713
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 36753649 ~ 36753758 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CGGCGAGCAATACTCATAACTCCCAAGCGCCTGCGAACGCAAGCTCTCCTTACCCCGGTGCAGATGGAGCTCGTGTCCCAAGGCGCCTCCAGGCCTAAACCCGGGCCTGC

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000119162

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00033282 lncRNA upstream 9737 36742343 ~ 36743912 (+) True XLOC_015712
TCONS_00031290 lncRNA upstream 106098 36646499 ~ 36647551 (+) True XLOC_015708
TCONS_00033612 lncRNA upstream 110887 36638931 ~ 36642762 (+) True XLOC_015707
TCONS_00033609 lncRNA upstream 170374 36180243 ~ 36583275 (+) False XLOC_015702
TCONS_00033611 lncRNA upstream 170374 36521895 ~ 36583275 (+) True XLOC_015702
TCONS_00031301 lncRNA downstream 186184 36939942 ~ 36941479 (+) True XLOC_015717
TCONS_00031310 lncRNA downstream 423092 37176850 ~ 37182269 (+) False XLOC_015720
TCONS_00031311 lncRNA downstream 423125 37176883 ~ 37182269 (+) False XLOC_015720
TCONS_00031320 lncRNA downstream 491679 37245437 ~ 37258241 (+) True XLOC_015723
TCONS_00033613 lncRNA downstream 547650 37301408 ~ 37305390 (+) False XLOC_015725
TCONS_00031293 mRNA upstream 21686 36721357 ~ 36731963 (+) True XLOC_015711
TCONS_00031292 mRNA upstream 32360 36701322 ~ 36721289 (+) True XLOC_015710
TCONS_00031291 mRNA upstream 58505 36691771 ~ 36695144 (+) True XLOC_015709
TCONS_00031289 mRNA upstream 94493 36646451 ~ 36659156 (+) False XLOC_015708
TCONS_00031287 mRNA upstream 116783 36616830 ~ 36636866 (+) False XLOC_015706
TCONS_00031295 mRNA downstream 74485 36828243 ~ 36854500 (+) False XLOC_015714
TCONS_00031296 mRNA downstream 74500 36828258 ~ 36831491 (+) False XLOC_015714
TCONS_00031297 mRNA downstream 74988 36828746 ~ 36853834 (+) True XLOC_015714
TCONS_00031298 mRNA downstream 108715 36862473 ~ 36892883 (+) True XLOC_015715
TCONS_00031299 mRNA downstream 145224 36898982 ~ 36905195 (+) True XLOC_015716
TCONS_00031283 other upstream 628832 36124755 ~ 36124817 (+) True XLOC_015701
TCONS_00031282 other upstream 629367 36124223 ~ 36124282 (+) True XLOC_015700
TCONS_00031281 other upstream 629718 36123871 ~ 36123931 (+) True XLOC_015699
TCONS_00031280 other upstream 630534 36123056 ~ 36123115 (+) True XLOC_015698
TCONS_00031279 other upstream 630985 36122605 ~ 36122664 (+) True XLOC_015697
TCONS_00031307 other downstream 386716 37140474 ~ 37143617 (+) True XLOC_015719
TCONS_00031312 other downstream 438683 37192441 ~ 37201587 (+) True XLOC_015720
TCONS_00031331 other downstream 1082861 37836619 ~ 37836920 (+) False XLOC_015734
TCONS_00031335 other downstream 1121013 37874771 ~ 37878304 (+) False XLOC_015735
TCONS_00031374 other downstream 3303141 40056899 ~ 40057016 (+) True XLOC_015768