RNA id: TCONS_00031331



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00031331
length 302
RNA type ribozyme
GC content 0.55
exon number 1
gene id XLOC_015734
representative False

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 37836619 ~ 37846849 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


AGCGAAAGGAAGCTCACTGTAGAGGTCACTTACTGAGTGCTCGTCACTCGCCAACACCTCGGGGAAGGTCTGAGACAGGAGCTCCTCGCTGACCTAGCAGGACATCATCTGAATGATGAGCGAGTGCACAGAAAATCGGGTCACGCGCGCGACTCTCGCAGCAGACGTTGATGCTCGCACACATTCAGCGGATCAACTGAATGACGCGCGCAGACTTGGAAACACTCGCGGCTGGCGAATGAGTGCGATGTGTGAGCTAGCATAACATGCTAGAACCCAATTCAGACTACTCTCCCTCCGCT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000120061

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00031330 lncRNA upstream 9580 37826734 ~ 37827039 (+) True XLOC_015733
TCONS_00031328 lncRNA upstream 24656 37811030 ~ 37811963 (+) True XLOC_015731
TCONS_00033614 lncRNA upstream 529048 37301424 ~ 37307571 (+) False XLOC_015725
TCONS_00033615 lncRNA upstream 529048 37301522 ~ 37307571 (+) False XLOC_015725
TCONS_00033616 lncRNA upstream 529048 37301542 ~ 37307571 (+) True XLOC_015725
TCONS_00031339 lncRNA downstream 89460 37926380 ~ 37927412 (+) True XLOC_015737
TCONS_00033283 lncRNA downstream 131065 37967985 ~ 37971044 (+) True XLOC_015738
TCONS_00033284 lncRNA downstream 136018 37972938 ~ 37973738 (+) True XLOC_015739
TCONS_00033285 lncRNA downstream 138076 37974996 ~ 37978500 (+) False XLOC_015740
TCONS_00033286 lncRNA downstream 138659 37975579 ~ 37981058 (+) True XLOC_015740
TCONS_00031329 mRNA upstream 12192 37815687 ~ 37824427 (+) True XLOC_015732
TCONS_00031327 mRNA upstream 24434 37804235 ~ 37812185 (+) False XLOC_015731
TCONS_00031326 mRNA upstream 66288 37762924 ~ 37770331 (+) True XLOC_015730
TCONS_00031325 mRNA upstream 81491 37750016 ~ 37755128 (+) True XLOC_015729
TCONS_00031324 mRNA upstream 333610 37480669 ~ 37503009 (+) True XLOC_015728
TCONS_00031333 mRNA downstream 329 37837249 ~ 37846849 (+) False XLOC_015734
TCONS_00031334 mRNA downstream 1339 37838259 ~ 37841561 (+) True XLOC_015734
TCONS_00031336 mRNA downstream 38869 37875789 ~ 37878304 (+) False XLOC_015735
TCONS_00031337 mRNA downstream 38895 37875815 ~ 37878292 (+) True XLOC_015735
TCONS_00031338 mRNA downstream 60159 37897079 ~ 37906118 (+) True XLOC_015736
TCONS_00031312 other upstream 635032 37192441 ~ 37201587 (+) True XLOC_015720
TCONS_00031307 other upstream 693002 37140474 ~ 37143617 (+) True XLOC_015719
TCONS_00031294 other upstream 1082861 36753649 ~ 36753758 (+) True XLOC_015713
TCONS_00031283 other upstream 1711802 36124755 ~ 36124817 (+) True XLOC_015701
TCONS_00031282 other upstream 1712337 36124223 ~ 36124282 (+) True XLOC_015700
TCONS_00031335 other downstream 37851 37874771 ~ 37878304 (+) False XLOC_015735
TCONS_00031374 other downstream 2219979 40056899 ~ 40057016 (+) True XLOC_015768
TCONS_00031377 other downstream 3199156 41036076 ~ 41036191 (+) True XLOC_015775
TCONS_00031413 other downstream 4586764 42423684 ~ 42423799 (+) True XLOC_015799
TCONS_00031414 other downstream 4749818 42586738 ~ 42587035 (+) True XLOC_015800

Expression Profile


//