RNA id: TCONS_00031374


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00031374
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.48
exon number 1
gene id XLOC_015768
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 40056899 ~ 40057016 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

tgccacagccatatcaccctgcagctcaagaccggttactcactgaagctaaccAGGACTGAGtactggtcagtacctgaatggaagaccacatggaaaaactaggttgctgttgtaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000119459

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00033619 lncRNA upstream 264453 39785747 ~ 39792446 (+) True XLOC_015767
TCONS_00031371 lncRNA upstream 986591 39059635 ~ 39070308 (+) True XLOC_015764
TCONS_00033289 lncRNA upstream 1004670 39051887 ~ 39052229 (+) True XLOC_015763
TCONS_00031370 lncRNA upstream 1010715 39036182 ~ 39046184 (+) True XLOC_015762
TCONS_00031365 lncRNA upstream 1204243 38846743 ~ 38852656 (+) False XLOC_015758
TCONS_00033620 lncRNA downstream 161548 40218564 ~ 40222006 (+) True XLOC_015770
TCONS_00033621 lncRNA downstream 207609 40264625 ~ 40274510 (+) False XLOC_015771
TCONS_00033291 lncRNA downstream 207609 40264625 ~ 40274510 (+) False XLOC_015771
TCONS_00033290 lncRNA downstream 207776 40264792 ~ 40274512 (+) True XLOC_015771
TCONS_00033622 lncRNA downstream 713056 40770072 ~ 40772051 (+) True XLOC_015773
TCONS_00031373 mRNA upstream 435796 39618951 ~ 39621103 (+) True XLOC_015766
TCONS_00031372 mRNA upstream 501232 39108339 ~ 39555667 (+) True XLOC_015765
TCONS_00031369 mRNA upstream 1028847 39021282 ~ 39028052 (+) True XLOC_015761
TCONS_00031368 mRNA upstream 1079601 38924975 ~ 38977298 (+) True XLOC_015760
TCONS_00031367 mRNA upstream 1147498 38892631 ~ 38909401 (+) True XLOC_015759
TCONS_00031375 mRNA downstream 124617 40181633 ~ 40184687 (+) True XLOC_015769
TCONS_00031376 mRNA downstream 237297 40294313 ~ 40514151 (+) True XLOC_015772
TCONS_00031379 mRNA downstream 1467222 41524238 ~ 41530598 (+) False XLOC_015777
TCONS_00031380 mRNA downstream 1467222 41524238 ~ 41543762 (+) False XLOC_015777
TCONS_00031382 mRNA downstream 1469888 41526904 ~ 41542043 (+) True XLOC_015777
TCONS_00031335 other upstream 2178595 37874771 ~ 37878304 (+) False XLOC_015735
TCONS_00031331 other upstream 2219979 37836619 ~ 37836920 (+) False XLOC_015734
TCONS_00031312 other upstream 2855312 37192441 ~ 37201587 (+) True XLOC_015720
TCONS_00031307 other upstream 2913282 37140474 ~ 37143617 (+) True XLOC_015719
TCONS_00031294 other upstream 3303141 36753649 ~ 36753758 (+) True XLOC_015713
TCONS_00031377 other downstream 979060 41036076 ~ 41036191 (+) True XLOC_015775
TCONS_00031413 other downstream 2366668 42423684 ~ 42423799 (+) True XLOC_015799
TCONS_00031414 other downstream 2529722 42586738 ~ 42587035 (+) True XLOC_015800
TCONS_00031429 other downstream 2941786 42998802 ~ 42998919 (+) True XLOC_015810
TCONS_00031434 other downstream 3222585 43279601 ~ 43303082 (+) True XLOC_015812