RNA id: TCONS_00031411


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00031411
length 240
RNA type mRNA
GC content 0.48
exon number 2
gene id XLOC_015793
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 42260021 ~ 42334707 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ATGGCAGAATCCAGTGTTTCTTTGGCTCAGGAGCATCAGTTTAACTGTTCAATCTGTGTGGATCTACTGAAGGATCCAGTGGCCATTCCCTGTGGACACAGTTACTGTATGAGCTGTATTTCAGGCTACTGGGATCAGGATGAGCAGAAGGGAGTCTACAGCTGCCCTCAGTGCAGACAGACCTTCACTCCAAGACCTGCTTTAAGGAAAAACACCATGCTGGCTGAAGTGGAACAATGA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000193783

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00031392 lncRNA upstream 148448 42176922 ~ 42182380 (+) False XLOC_015787
TCONS_00033295 lncRNA upstream 317478 42013076 ~ 42013350 (+) True XLOC_015783
TCONS_00031384 lncRNA upstream 448668 41876622 ~ 41882160 (+) True XLOC_015780
TCONS_00033637 lncRNA upstream 535259 41771346 ~ 41795569 (+) True XLOC_015779
TCONS_00033294 lncRNA upstream 558787 41771111 ~ 41772041 (+) False XLOC_015779
TCONS_00033638 lncRNA downstream 77177 42410888 ~ 42422644 (+) False XLOC_015798
TCONS_00033639 lncRNA downstream 86092 42419803 ~ 42422644 (+) True XLOC_015798
TCONS_00033640 lncRNA downstream 283150 42616861 ~ 42624890 (+) True XLOC_015802
TCONS_00033296 lncRNA downstream 311677 42645388 ~ 42645994 (+) True XLOC_015803
TCONS_00031425 lncRNA downstream 439638 42773349 ~ 42774516 (+) False XLOC_015807
TCONS_00031409 mRNA upstream 9674 42318012 ~ 42321154 (+) True XLOC_015796
TCONS_00031408 mRNA upstream 22404 42294944 ~ 42308424 (+) True XLOC_015795
TCONS_00031407 mRNA upstream 31600 42294944 ~ 42299228 (+) False XLOC_015795
TCONS_00031406 mRNA upstream 57720 42271830 ~ 42273108 (+) True XLOC_015794
TCONS_00031405 mRNA upstream 57957 42271830 ~ 42272871 (+) False XLOC_015794
TCONS_00031412 mRNA downstream 10593 42344304 ~ 42345571 (+) True XLOC_015797
TCONS_00031415 mRNA downstream 258861 42592572 ~ 42600113 (+) False XLOC_015801
TCONS_00031416 mRNA downstream 259140 42592851 ~ 42600087 (+) True XLOC_015801
TCONS_00031417 mRNA downstream 374963 42708674 ~ 42710206 (+) False XLOC_015804
TCONS_00031418 mRNA downstream 374973 42708684 ~ 42713902 (+) True XLOC_015804
TCONS_00031377 other upstream 1294637 41036076 ~ 41036191 (+) True XLOC_015775
TCONS_00031374 other upstream 2273812 40056899 ~ 40057016 (+) True XLOC_015768
TCONS_00031335 other upstream 4452524 37874771 ~ 37878304 (+) False XLOC_015735
TCONS_00031331 other upstream 4493908 37836619 ~ 37836920 (+) False XLOC_015734
TCONS_00031312 other upstream 5129241 37192441 ~ 37201587 (+) True XLOC_015720
TCONS_00031413 other downstream 89973 42423684 ~ 42423799 (+) True XLOC_015799
TCONS_00031414 other downstream 253027 42586738 ~ 42587035 (+) True XLOC_015800
TCONS_00031429 other downstream 665091 42998802 ~ 42998919 (+) True XLOC_015810
TCONS_00031434 other downstream 945890 43279601 ~ 43303082 (+) True XLOC_015812
TCONS_00031447 other downstream 2018962 44352673 ~ 44353567 (+) False XLOC_015820