RNA id: TCONS_00031429


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00031429
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_015810
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 42998802 ~ 42998919 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

tattgcggcagctagctctctgcaactctcatatggtcgcccactgaatCTATGCAGGGCTGTGCCTAGTCAgttcctggatgggagaccatataggaaagctaggttggtgctagaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000120825

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00031426 lncRNA upstream 217548 42773384 ~ 42781254 (+) True XLOC_015807
TCONS_00031425 lncRNA upstream 224286 42773349 ~ 42774516 (+) False XLOC_015807
TCONS_00033296 lncRNA upstream 352808 42645388 ~ 42645994 (+) True XLOC_015803
TCONS_00033640 lncRNA upstream 373912 42616861 ~ 42624890 (+) True XLOC_015802
TCONS_00033638 lncRNA upstream 576158 42410888 ~ 42422644 (+) False XLOC_015798
TCONS_00033642 lncRNA downstream 139636 43138555 ~ 43163518 (+) True XLOC_015811
TCONS_00033644 lncRNA downstream 654701 43653620 ~ 43659284 (+) False XLOC_015814
TCONS_00033643 lncRNA downstream 654701 43653620 ~ 43659284 (+) False XLOC_015814
TCONS_00033645 lncRNA downstream 655969 43654888 ~ 43659284 (+) False XLOC_015814
TCONS_00033646 lncRNA downstream 655974 43654893 ~ 43659284 (+) False XLOC_015814
TCONS_00031427 mRNA upstream 62293 42871831 ~ 42936509 (+) False XLOC_015808
TCONS_00031428 mRNA upstream 72479 42872661 ~ 42926323 (+) True XLOC_015808
TCONS_00031424 mRNA upstream 250145 42724404 ~ 42748657 (+) True XLOC_015806
TCONS_00031423 mRNA upstream 276762 42715995 ~ 42722040 (+) True XLOC_015805
TCONS_00031422 mRNA upstream 279987 42715995 ~ 42718815 (+) False XLOC_015805
TCONS_00031430 mRNA downstream 206000 43204919 ~ 43388816 (+) False XLOC_015812
TCONS_00031431 mRNA downstream 206058 43204977 ~ 43330059 (+) False XLOC_015812
TCONS_00031432 mRNA downstream 206058 43204977 ~ 43389248 (+) False XLOC_015812
TCONS_00031433 mRNA downstream 206102 43205021 ~ 43329698 (+) False XLOC_015812
TCONS_00031435 mRNA downstream 470322 43469241 ~ 43493562 (+) False XLOC_015813
TCONS_00031414 other upstream 411767 42586738 ~ 42587035 (+) True XLOC_015800
TCONS_00031413 other upstream 575003 42423684 ~ 42423799 (+) True XLOC_015799
TCONS_00031377 other upstream 1962611 41036076 ~ 41036191 (+) True XLOC_015775
TCONS_00031374 other upstream 2941786 40056899 ~ 40057016 (+) True XLOC_015768
TCONS_00031335 other upstream 5120498 37874771 ~ 37878304 (+) False XLOC_015735
TCONS_00031434 other downstream 280682 43279601 ~ 43303082 (+) True XLOC_015812
TCONS_00031447 other downstream 1353754 44352673 ~ 44353567 (+) False XLOC_015820
TCONS_00031458 other downstream 1565459 44564378 ~ 44564494 (+) True XLOC_015827
TCONS_00031468 other downstream 1924880 44923799 ~ 44924676 (+) True XLOC_015830
TCONS_00031495 other downstream 2566294 45565213 ~ 45565811 (+) True XLOC_015853