RNA id: TCONS_00032769


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00032769
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_016694
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 39370811 ~ 39370927 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

agccacagccatatcaacctgcagctcaagaccggttactcactgaagctaagcagggctgagcctggttagtacctggataggagaccacatgggaaaaccagGTTGCTGTTGAAT

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000177266

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00032767 lncRNA downstream 284237 39082296 ~ 39086574 (-) False XLOC_016693
TCONS_00032761 lncRNA downstream 355707 39012920 ~ 39015104 (-) True XLOC_016690
TCONS_00032760 lncRNA downstream 372050 38998048 ~ 38998761 (-) False XLOC_016690
TCONS_00032745 lncRNA downstream 1145438 38216345 ~ 38225373 (-) True XLOC_016682
TCONS_00033892 lncRNA downstream 1176332 38192959 ~ 38194479 (-) True XLOC_016681
TCONS_00033386 lncRNA upstream 239394 39610321 ~ 39612464 (-) True XLOC_016697
TCONS_00032775 lncRNA upstream 363642 39734569 ~ 39737898 (-) False XLOC_016698
TCONS_00033893 lncRNA upstream 363642 39734569 ~ 39752556 (-) False XLOC_016698
TCONS_00033894 lncRNA upstream 455777 39826704 ~ 39827511 (-) True XLOC_016699
TCONS_00033895 lncRNA upstream 459758 39830685 ~ 40033026 (-) False XLOC_016700
TCONS_00032765 mRNA downstream 280525 39063324 ~ 39090286 (-) False XLOC_016693
TCONS_00032768 mRNA downstream 280553 39082921 ~ 39090258 (-) True XLOC_016693
TCONS_00032766 mRNA downstream 284271 39068321 ~ 39086540 (-) False XLOC_016693
TCONS_00032763 mRNA downstream 334207 39028337 ~ 39036604 (-) True XLOC_016692
TCONS_00032762 mRNA downstream 352973 39016066 ~ 39017838 (-) True XLOC_016691
TCONS_00032770 mRNA upstream 178449 39549376 ~ 39558643 (-) False XLOC_016695
TCONS_00032771 mRNA upstream 185331 39556258 ~ 39558643 (-) False XLOC_016695
TCONS_00032772 mRNA upstream 185686 39556613 ~ 39558643 (-) True XLOC_016695
TCONS_00032773 mRNA upstream 213139 39584066 ~ 39675829 (-) True XLOC_016696
TCONS_00032774 mRNA upstream 360357 39731284 ~ 39759059 (-) False XLOC_016698
TCONS_00032764 other downstream 302265 39062754 ~ 39068546 (-) False XLOC_016693
TCONS_00032743 other downstream 1166018 38203941 ~ 38204793 (-) False XLOC_016682
TCONS_00032691 other downstream 1961654 37405351 ~ 37409157 (-) True XLOC_016651
TCONS_00032658 other downstream 2696892 36670656 ~ 36673919 (-) False XLOC_016631
TCONS_00032657 other downstream 2699653 36664770 ~ 36671158 (-) False XLOC_016631
TCONS_00032776 other upstream 364625 39735552 ~ 39752556 (-) True XLOC_016698
TCONS_00032777 other upstream 556034 39926961 ~ 40026622 (-) False XLOC_016700
TCONS_00032778 other upstream 637811 40008738 ~ 40026622 (-) True XLOC_016700
TCONS_00032779 other upstream 696881 40067808 ~ 40069852 (-) False XLOC_016701
TCONS_00032787 other upstream 1174019 40544946 ~ 40545061 (-) True XLOC_016707