RNA id: TCONS_00032784


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00032784
length 3582
RNA type mRNA
GC content 0.33
exon number 5
gene id XLOC_016702
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 40181633 ~ 40191603 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CACGTGGTTACATTCACGTGCACGAGCGGCGCTTAGCAAACTTATTTGAACTTGAAGCTGTTTCGAGAGGAGGCACATTACCTTAAGCCTTCATTTGCTGTGATTTTGCCTAATCAAACGAACAACGCAGTATTTTGACAAATTATCCACAAACAGTGGAAAATGGGGTCATTTCTTTCGATCCCAGTAACGCAAAAGCCTGAAATATATGAGCTTCCGAGTCAGGTGCAAAGAGACGATGATGAGATATTCCAAGAATTCAATGAGAACATTTGTAAAACCATGCGTCGCCAGAATTTGCGCTCCAGACAGGAACTGAACCTCTTGAATGcatatagACGTAACTGGAGTTCAGTGGTTGAAAAACTGATGAAAAAATACCCCAAGTGGTCTTCTGAAGACATCTTGAACCTTAGATATCGATATGAGATTGTGGCCAAACGTTATGGCTATCTTCTTCACTTCTGTAATTTCAATGAGCTGCTTGACTCCATTTCTGATGAGTCTTCTCCTGAGCAGCGCAGAGAGATGTTTAGCAGTGTAGACACCCATCACTTCTACGCACTCAACTTCAAGGAATATCTTCAGATAATGGATAAAATAGGCATTGAAACACCAGTACCTAGGCCTCCAGGAGTTGATGAAGACAGAGATGAGATTATGGTCTTAATTGATGATTTATTACAATGTCACATGAGTACCCAGATGGTCTATAAAGTATTCTAAATTTCAGGCTGATCCTTTCGGtaatgaagctcagctgcagttCTTTTAATCCTTAGTTTTGTTTACTCTCCCAACTGGGTTTAACTTTTAAGTAGCatacaaagatttgttttgtttttattgtatttaatttttttcagtattgCTGTTTAAGACAAATCTGTACTGCATCTCAAACTAAAtatattagaaaaaatatataattctgtgaaaaaaacaaaatggagatttattattaaagatgAATAGTCAGAATATATTTAATGCATGATAAAAATAATCAGTGATTAATTCAGTCAATTATATGCTTTGTTCAAAGCCACATTTATCTGTAAAAGCTTCATGGGCTGTTGGTGGTATTTGTTTGAATCACACTATTCGGTCCAGCAGTGGTGAGGCGTAAAGATGCCTTGTTCTCCAGTTTAGCAATTTTAGACCTATACAAAAAAAGGTATAAAATCAGGTCAGGCCTCATAAATAGAAAATCAATAAATGTTTCAGTTGGTCACACTATTCACCAGTCAGTGATGATAAATGTTACCTAGAATGTTTATGGTACATTTGCCACACAATTTAGGtcgtttgtttttaaaatgtcacaCACTTTGGCTGCTTACCTCAGATGTGCGAGTGCAGCTCTCACCCACTGATCCTCAATGCTCGCACATATCTTCTTATTTTTCTGGGTGATAAAACTGAAgagaaagataaaaataaatgtttttggagacagtagtttgttttattttcttctaAAAGTGGCTGAAAGTACGttttttttattaaggtcaaCTGCCTTTTAAAGTGACATCAAAAGTCTGAAACCAGTAAGTTTAGGTCGGTTTGAATATATTCCTTGACACACACTAGTATtcgaaaatatatttaaaaagtatgtgtgtgcgtgcgtgcgtgtgtgtgtgtataaaaatagAATACAAGTATTTAAAATAGAATTAAGTTAAGTGATACAGtagtacttttttttaaaacaatgaataaatattcaTAGCTCCACTAAttgtatcacactgtaaaaatgctcagTTTCACGCAATCTCtccatgttgtccaaacacaaaccaattaagtgaatttaatagtttttacaagtagtttacaacagtttttaaatggattaaacataaacaattaagtcctcgcaaaaaaataagaattgtctctttaaactacttatttaaaatgagcaaaaacaaGCAGCGAACGTCttttatgtatttaatgttttatatttatatgtaatattacaaaatacactTCTATTTAAAAGTAAAGGGGAgctatgatttatttattttatgtttttgaaaaagTGTCTTTTGTTCACTAACCAATATAaagcattttatatttatatgtcaTGTTAAATTGCTttaatcattcttttttttagatttctATGCAAATTGTTACATTAACACAACACTTGAAAATTGAAACATGAACATTCATTTGACTTCTTCTGTATTTTgcccattttattttaatgtcagtAGTTAGCTCAGCTTCTATCTGCATGAAAATGATGCTCTACGCATGATTTCAGAATGATACACTAGAAAAATTCTTGCTTCCTTaaattttttgttgaatcaaattaacttttttcaGTCATCGCAACTTACAGtaatcaaaatgacaaaaaaataattatatatatatatattatatatatataataaattatatactaTAAAAATTTTAAACCTGGTTAGCTTATTAAAGTAAGTTAAAGCAACACACTcacatttgttgtcttgactaATTGTCATAATTTTAACTGAGAGCCTCTAATttgtcctttttaaaaatatataatctacaaattatggatatttttacaactttaatgtttaaacaatagttgttttattttttattaaataatgtcaTCTATTTTTTATAGCATCACTTTACAGTGTACTCGGTGTTAATACCAcgggaacttttttttttgcatccgcTGTTCACCCTCATATTTAAATGCATGGTTAAATGTGCCTATTTTGGTACAAGTGTGGGTGAGTGGGTGAACCTTGATTCTTTCTTGCGGTCAGATAATGGTGACTCACATGATGGCATCTATACGGCACACCTCAAGGGAGCTCTGCTCAATGAAGCCTGCGATCACACCGAAGGGCAAAGGAGTCCGAGTGTATTTCACACAGCAGGCATAGTTCAGCGGCCCATCTGACATcaaacacaacattttttttaaagtcatataCTGATAGATCCATAAACTTAGTATGTTACTCTACTACAGTATATGTTCAAATATTAACAGAAAGGTAACAGCAATCACAATCACAACATATTTATATCTATTAGAAACTTACATGCTTTTGGAGTATGAGGAAGTAGGCTTAGAAAAACGATGCTGATGAGAGTGATTGAAACCAGAGACATTATGGAGCGTGTTTCAGATACACAGAGATGCGTGTTGAGGCTGTGCAGGGTCTTATATATGTACTAGTGAGCGATAAGATCAGTTGCACACGTTCAATAGAATGTCAAATCAGATGCAGTTTTCAAAATGAGGACAGCAACCACGGGAAAAACAGAGGACAGGAAAGCCAATATTGACGATGTTACAAGACTCCAACCACAAATGTGGTGCAGAGTTATAAAAGACTTCTTTCTTAGTATCTCGAGCAAATACACACATCCCATATAAGATGTTACGCtagttttagtatttatttttgtttacattttgtgcCATGTCTGACTGATTGATGTTGTAATTGATGTAactgaataatgaaaaataattactgaaaaaaaaaaaacttgaaattcTGTTTAATTCTGTTTTCCTGAGAcccctttttc

Function

GO: NA

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-070912-34 No description available

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000180691

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00033896 lncRNA downstream 148575 39830685 ~ 40033058 (-) False XLOC_016700
TCONS_00033898 lncRNA downstream 148575 39936564 ~ 40033058 (-) False XLOC_016700
TCONS_00033900 lncRNA downstream 148606 40008087 ~ 40033027 (-) False XLOC_016700
TCONS_00033895 lncRNA downstream 148607 39830685 ~ 40033026 (-) False XLOC_016700
TCONS_00033897 lncRNA downstream 148607 39846697 ~ 40033026 (-) False XLOC_016700
TCONS_00032785 lncRNA upstream 2464 40194067 ~ 40196570 (-) True XLOC_016703
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TCONS_00032786 lncRNA upstream 7214 40198817 ~ 40199780 (-) True XLOC_016704
TCONS_00033901 lncRNA upstream 14305 40205908 ~ 40211792 (-) True XLOC_016705
TCONS_00033902 lncRNA upstream 342360 40533963 ~ 40534863 (-) True XLOC_016706
TCONS_00032781 mRNA downstream 45609 40069639 ~ 40136024 (-) False XLOC_016701
TCONS_00032780 mRNA downstream 45615 40067821 ~ 40136018 (-) False XLOC_016701
TCONS_00032783 mRNA downstream 45615 40131692 ~ 40136018 (-) True XLOC_016701
TCONS_00032782 mRNA downstream 45691 40069956 ~ 40135942 (-) False XLOC_016701
TCONS_00032774 mRNA downstream 422574 39731284 ~ 39759059 (-) False XLOC_016698
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TCONS_00032792 mRNA upstream 639165 40830768 ~ 40889465 (-) False XLOC_016712
TCONS_00032794 mRNA upstream 639165 40830768 ~ 40890264 (-) False XLOC_016712
TCONS_00032795 mRNA upstream 641371 40832974 ~ 40890004 (-) True XLOC_016712
TCONS_00032796 mRNA upstream 710394 40901997 ~ 41123797 (-) False XLOC_016713
TCONS_00032779 other downstream 111781 40067808 ~ 40069852 (-) False XLOC_016701
TCONS_00032777 other downstream 155011 39926961 ~ 40026622 (-) False XLOC_016700
TCONS_00032778 other downstream 155011 40008738 ~ 40026622 (-) True XLOC_016700
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TCONS_00032769 other downstream 810706 39370811 ~ 39370927 (-) True XLOC_016694
TCONS_00032787 other upstream 353343 40544946 ~ 40545061 (-) True XLOC_016707
TCONS_00032788 other upstream 403772 40595375 ~ 40595494 (-) True XLOC_016708
TCONS_00032799 other upstream 1020375 41211978 ~ 41212094 (-) True XLOC_016715
TCONS_00032800 other upstream 1230003 41421606 ~ 41421722 (-) True XLOC_016717
TCONS_00032808 other upstream 1425604 41617207 ~ 41620112 (-) True XLOC_016721

Expression Profile

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