RNA id: TCONS_00034036



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00034036
length 93
RNA type mRNA
GC content 0.51
exon number 3
gene id XLOC_017042
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 172162 ~ 187142 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


cagatcctcttcaccatgtctacatgtctgaatgcagtgagctgctgccatgtagggagcagttggacaggtgtacctaataaagtggccggt

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000168765

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00036532 lncRNA downstream 494705 681847 ~ 682292 (+) False XLOC_017056
TCONS_00036533 lncRNA downstream 494711 681853 ~ 682292 (+) True XLOC_017056
TCONS_00034068 lncRNA downstream 566726 753868 ~ 757069 (+) True XLOC_017058
TCONS_00036534 lncRNA downstream 709763 896905 ~ 900380 (+) True XLOC_017061
TCONS_00036535 lncRNA downstream 1013150 1200292 ~ 1203603 (+) False XLOC_017065
TCONS_00034035 mRNA upstream 58845 106481 ~ 113317 (+) True XLOC_017041
TCONS_00034034 mRNA upstream 66150 98179 ~ 106012 (+) True XLOC_017040
TCONS_00034033 mRNA upstream 81907 88168 ~ 90255 (+) True XLOC_017039
TCONS_00034031 mRNA upstream 95862 25370 ~ 76300 (+) False XLOC_017038
TCONS_00034032 mRNA upstream 96219 66857 ~ 75943 (+) True XLOC_017038
TCONS_00034037 mRNA downstream 2886 190028 ~ 194621 (+) False XLOC_017043
TCONS_00034038 mRNA downstream 2886 190028 ~ 194622 (+) False XLOC_017043
TCONS_00034039 mRNA downstream 5028 192170 ~ 193071 (+) True XLOC_017043
TCONS_00034040 mRNA downstream 31744 218886 ~ 259965 (+) True XLOC_017044
TCONS_00034043 mRNA downstream 75914 263056 ~ 277689 (+) False XLOC_017045
TCONS_00034041 other downstream 75853 262995 ~ 318105 (+) False XLOC_017045
TCONS_00034042 other downstream 75914 263056 ~ 277689 (+) False XLOC_017045
TCONS_00034086 other downstream 1198607 1385749 ~ 1392655 (+) True XLOC_017071
TCONS_00034116 other downstream 2721409 2908551 ~ 2908665 (+) True XLOC_017093
TCONS_00034146 other downstream 4887782 5074924 ~ 5075054 (+) True XLOC_017116