RNA id: TCONS_00034424



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00034424
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_017290
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 23076201 ~ 23076317 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GGCCACGACCATATTACCCTGCAGCCCCTGAccggttacttactgaagctaagcagggctgagcctgttcAATATCTGGATGGCAGgacacatgggaaaactaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000174689

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00034423 lncRNA upstream 44465 23026257 ~ 23031736 (+) True XLOC_017289
TCONS_00034415 lncRNA upstream 879034 22194193 ~ 22197167 (+) True XLOC_017285
TCONS_00034414 lncRNA upstream 895693 22179916 ~ 22180508 (+) True XLOC_017284
TCONS_00036584 lncRNA upstream 1339416 21730947 ~ 21736785 (+) True XLOC_017281
TCONS_00034403 lncRNA upstream 1530222 21478028 ~ 21545979 (+) False XLOC_017279
TCONS_00034430 lncRNA downstream 178160 23254477 ~ 23268687 (+) True XLOC_017296
TCONS_00034440 lncRNA downstream 465861 23542178 ~ 23572789 (+) False XLOC_017299
TCONS_00036585 lncRNA downstream 585689 23662006 ~ 23662547 (+) True XLOC_017301
TCONS_00034447 lncRNA downstream 610731 23687048 ~ 23688804 (+) True XLOC_017302
TCONS_00034451 lncRNA downstream 778738 23855055 ~ 23855897 (+) True XLOC_017305
TCONS_00034422 mRNA upstream 54808 23007470 ~ 23021393 (+) True XLOC_017288
TCONS_00034419 mRNA upstream 54922 22799641 ~ 23021279 (+) False XLOC_017288
TCONS_00034421 mRNA upstream 58789 23007470 ~ 23017412 (+) False XLOC_017288
TCONS_00034420 mRNA upstream 168268 22799857 ~ 22907933 (+) False XLOC_017288
TCONS_00034417 mRNA upstream 335526 22666548 ~ 22740675 (+) False XLOC_017287
TCONS_00034425 mRNA downstream 7483 23083800 ~ 23111727 (+) True XLOC_017291
TCONS_00034426 mRNA downstream 97393 23173710 ~ 23181762 (+) True XLOC_017292
TCONS_00034427 mRNA downstream 109213 23185530 ~ 23192298 (+) True XLOC_017293
TCONS_00034429 mRNA downstream 162516 23238833 ~ 23244193 (+) True XLOC_017295
TCONS_00034431 mRNA downstream 238925 23315242 ~ 23422345 (+) False XLOC_017297
TCONS_00034397 other upstream 1881437 21194649 ~ 21194764 (+) True XLOC_017276
TCONS_00034393 other upstream 2059302 21008353 ~ 21016899 (+) True XLOC_017272
TCONS_00034381 other upstream 2380404 20672224 ~ 20695797 (+) True XLOC_017268
TCONS_00034361 other upstream 3718429 19357658 ~ 19357772 (+) True XLOC_017256
TCONS_00034359 other upstream 3858172 19217898 ~ 19218029 (+) True XLOC_017255
TCONS_00034428 other downstream 156373 23232690 ~ 23232804 (+) True XLOC_017294
TCONS_00034433 other downstream 319477 23395794 ~ 23406524 (+) False XLOC_017297
TCONS_00034449 other downstream 690636 23766953 ~ 23767069 (+) True XLOC_017304
TCONS_00034463 other downstream 2160692 25237009 ~ 25237124 (+) True XLOC_017317
TCONS_00034470 other downstream 2390253 25466570 ~ 25469149 (+) True XLOC_017320