RNA id: TU665732



Basic Information


Item Value
RNA id TU665732
length 755
RNA type TUCP
GC content 0.37
exon number 2
gene id G583605
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048571.1
NCBI id CM023225.2
chromosome length 90918291
location 20238911 ~ 20239797 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome
species rainbow trout
(Oncorhynchus mykiss)

Sequence


CCCCTGGAACTTTCCTGTGCATGTAATAGTCTATGCCATATTTTTCTCCGTAGCCCACACCTTTTCAATATTTAAATTGATTTATCACAATGCTACAGGAGGCAAATAATGACAATGTGCTCAGTTTTGATATTTCTATGCAATATGGTACTGTGTTATGAATGCTGATGGGTCAATATGGTACTGTGTTATGAATGCTGATGGGTCAATATGGTACTGTGTTATGAATGTTGATGGGTCAATATAGTACTGTGTTATGAATGCTTATGGATCAATATGGTACTGTGTTATGAATGATGATGGGTCAATATAGTACTGTGTTATGAATGCTTATGGATCAATATGGTACTGTGTTATGAATGCTGATGGATCAATATTGTACTGTGTTATGAATGCTGATGGGTCAATATGGTACTGTGTTATGAATGCTGATGGGTCAATATGGTACTGTGTTATGAATGCTGATGGGTCAATATGGTACTGTGTTATGAATGCTGATGGGTCAATATGGTACTGCGTTATGAATGTTGATGGGTCAATATGGTACTGTGTTATGAATGCTGATCAATCAATATGGTACTGTGTTATGAATGCTGATGGGTCAATATGGTACTGTGTTATGAATGCTGATGGGTCAATATGGTACTGTGTTATGAATGTTGATGGGTCAATATGGTACTGTGTTATGAATGTTGATGGGTCAATATGGTACTGTGTTATGAATGTTGATGGGTCAACATGGTACTGTGTTATGA

Function


GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU665730 lncRNA upstream 2329 20235661 ~ 20236582 (+) True G583603
TU665727 lncRNA upstream 5497 20231581 ~ 20233414 (+) True G583600
TU665721 lncRNA upstream 11047 20225712 ~ 20227864 (+) False G583598
TU665723 lncRNA upstream 11270 20225712 ~ 20227641 (+) True G583598
TU665618 lncRNA upstream 120804 20117782 ~ 20118107 (+) True G583498
TU665754 lncRNA downstream 27098 20266895 ~ 20267139 (+) True G583626
TU665763 lncRNA downstream 38546 20278343 ~ 20278589 (+) True G583634
TU665779 lncRNA downstream 61490 20301287 ~ 20310070 (+) True LOC110527457
TU665783 lncRNA downstream 72076 20311873 ~ 20312177 (+) True G583654
TU665954 lncRNA downstream 203642 20443439 ~ 20443982 (+) True G583818
LOC118965349 mRNA upstream 76016 20162080 ~ 20162895 (+) True LOC118965349
XM_021608729.2 mRNA upstream 140848 20093794 ~ 20098063 (+) False LOC110527453
XM_021608730.2 mRNA upstream 140848 20093803 ~ 20098063 (+) True LOC110527453
XM_021608728.2 mRNA upstream 173931 20062976 ~ 20064980 (+) True LOC110527452
XM_036982865.1 mRNA upstream 210136 20019482 ~ 20028775 (+) False LOC110528807
XR_002474135.2 mRNA downstream 70266 20310063 ~ 20315887 (+) False LOC110527457
XM_036982877.1 mRNA downstream 287631 20527428 ~ 20539663 (+) False LOC110527460
XM_036982876.1 mRNA downstream 288898 20528695 ~ 20539663 (+) False LOC110527460
XM_036982875.1 mRNA downstream 289149 20528946 ~ 20539663 (+) True LOC110527460
XM_036982879.1 mRNA downstream 394338 20634135 ~ 20655294 (+) False LOC110527464
TU665478 other upstream 217184 20017855 ~ 20021727 (+) False LOC110528807
TU664011 other upstream 1261912 18976678 ~ 18976999 (+) True G581976
TU662969 other upstream 1746002 18492227 ~ 18492909 (+) True G580997
TU662252 other upstream 2422063 17813342 ~ 17816848 (+) True G580365
TU662189 other upstream 2558243 17670275 ~ 17680668 (+) True G580315
TU666895 other downstream 841031 21080828 ~ 21082615 (+) True G584643
TU667948 other downstream 1713232 21953029 ~ 21953269 (+) True G585573
TU668464 other downstream 2116786 22356583 ~ 22360227 (+) True c7h10orf53
TU668616 other downstream 2446692 22686489 ~ 22687846 (+) False LOC110527523
TU668622 other downstream 2461397 22701194 ~ 22703821 (+) True LOC110527523

Expression Profile