RNA id: TU846544


Basic Information

Item Value
RNA id TU846544
length 14306
lncRNA type antisense_over
GC content 0.42
exon number 3
gene id G745770
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 74628791 ~ 74643321 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome
species rainbow trout
(Oncorhynchus mykiss)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU846531 lncRNA upstream 79079 74542839 ~ 74549712 (+) True G745760
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TU846688 lncRNA downstream 36009 74679330 ~ 74679543 (+) True G745907
TU846689 lncRNA downstream 37016 74680337 ~ 74680554 (+) True G745908
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TU846701 lncRNA downstream 51391 74694712 ~ 74694912 (+) True G745920
TU846716 lncRNA downstream 84448 74727769 ~ 74728646 (+) True G745932
XM_021613779.2 mRNA upstream 94774 74530674 ~ 74534017 (+) True LOC110530584
XM_036986220.1 mRNA upstream 127669 74480508 ~ 74501122 (+) False LOC110530582
XM_036986228.1 mRNA downstream 54028 74697349 ~ 74712803 (+) True LOC110530591
XM_021613790.2 mRNA downstream 69769 74713090 ~ 74717411 (+) False LOC110530590
XM_021613791.2 mRNA downstream 69773 74713094 ~ 74717411 (+) True LOC110530590
XM_021614268.1 mRNA downstream 152095 74795416 ~ 74796285 (+) True LOC110530985
XM_021613807.2 mRNA downstream 161380 74804701 ~ 74812569 (+) False LOC110530598
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TU845352 other upstream 1760409 72867101 ~ 72868382 (+) True G744697
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TU847942 other downstream 684451 75327772 ~ 75328195 (+) True G746936

Expression Profile