RNA id: TU868630



Basic Information


Item Value
RNA id TU868630
length 990
RNA type TUCP
GC content 0.35
exon number 3
gene id G763587
representative False

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 1962973 ~ 1978231 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome
species rainbow trout
(Oncorhynchus mykiss)

Sequence


ccctaacttcaactctaaccctaacttcgactctaactctaaccctaacttcgACTCTAACTCTaacttcaactctaaccctaaccctaacttcaactctaaccctaacttcaactctaaccctaacttcaactctaaccctaactttaactctaaccctaacttcgactctaactctaaccctaacttcaactctaaccctaacttcaactctaaccctaacttcaactctaaccctaacttcaactctaaccctaacttcaactctaaccctaacttcaactctaaccctaacttcaaCTCTaaccctaacttcaactctaaccctaacccttcaacTCTAACTTCAAAATGAAgtgttgtgttatgaatgatgtagcgtgttgtgttatgaatgatgtagcatgttgtgttgtgaatgatgtagcatgttgtgtttgttatgaatgatgtagcatgttgtgttatgagtgatgtagcatgttgtgttatgaatgatgtagcttgttgtgtttgttatgaatgatgtagcatgttgtgttatgaatgatgtagcatgttgtgtcatgaatgatgtagcatgttgtgatatgaatgatgtagcatgttgtgttatgaatgatgtagcatgttgtgatatgaatgatgtagcatgttgtgtcatgaatgatgtagcatgttgtgatatgaatgatgtagcatgttgtgttatgaatgatgtagcatgttgtgatatgaatgatgtagcatgttgtgatatgaatgatgtagcatgttgtgtcatgaatgatgtagcatgttgtgatATGAATGATGTAAcatgttgtgttatgaatgatgtaaCATGTTGTGATATGAATGATGTAAGATGTgtttgttatgaatgatgtagcatgttgtgtttgtcATGAATGATGTAACATGTTGTGATATGAATGATGTAACATGTTGTGatatgaatgatgtagcatgttgtgttatgaatgatgt

Function


GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU868612 lncRNA downstream 7963 1954509 ~ 1955010 (-) False G763579
TU868604 lncRNA downstream 16743 1943254 ~ 1946230 (-) False G763579
TU868608 lncRNA downstream 17736 1941559 ~ 1945237 (-) False G763579
TU868613 lncRNA downstream 20735 1941559 ~ 1942238 (-) False G763579
TU868593 lncRNA downstream 36703 1906656 ~ 1926270 (-) True G763569
TU868626 lncRNA upstream 39468 2017699 ~ 2022827 (-) False G763586
TU868628 lncRNA upstream 39468 2017699 ~ 2022656 (-) True G763586
TU868664 lncRNA upstream 40673 2018904 ~ 2032254 (-) True G763619
TU868678 lncRNA upstream 70083 2048314 ~ 2053279 (-) True G763633
TU868679 lncRNA upstream 77806 2056037 ~ 2091389 (-) True G763634
XM_036987022.1 mRNA downstream 184508 1744643 ~ 1778465 (-) True LOC110517376
XM_036987016.1 mRNA downstream 225435 1642134 ~ 1737538 (-) False LOC110515190
XM_036987017.1 mRNA downstream 225441 1642135 ~ 1737532 (-) False LOC110515190
XM_036987018.1 mRNA downstream 225442 1642136 ~ 1737531 (-) False LOC110515190
XM_036987019.1 mRNA downstream 225447 1642136 ~ 1737526 (-) False LOC110515190
XR_005053090.1 mRNA upstream 91690 2069921 ~ 2074891 (-) True LOC118965962
XR_005053091.1 mRNA upstream 105031 2083262 ~ 2084414 (-) False LOC118965963
XR_005053079.1 mRNA upstream 179751 2157982 ~ 2158681 (-) True LOC118965955
XM_036989226.1 mRNA upstream 183530 2161761 ~ 2162609 (-) False LOC118966148
XM_036987011.1 mRNA upstream 234043 2212274 ~ 2354313 (-) False LOC110535267
TU867065 other downstream 1096541 861374 ~ 866432 (-) False G762459
TU867058 other downstream 1097861 861374 ~ 865112 (-) False G762459
TU867062 other downstream 1097861 861374 ~ 865112 (-) False G762459
TU867066 other downstream 1097861 861374 ~ 865112 (-) False G762459
TU866637 other downstream 1526473 429600 ~ 436500 (-) True G762118
TU868794 other upstream 494867 2473098 ~ 2486901 (-) False G763719
TU868793 other upstream 496843 2475074 ~ 2486901 (-) True G763719
TU869128 other upstream 1318071 3296302 ~ 3299103 (-) True G763961
TU869858 other upstream 1873740 3851971 ~ 3858893 (-) False LOC110498423
TU870731 other upstream 2035603 4013834 ~ 4016409 (-) False LOC118966151

Expression Profile