RNA id: TU909635



Basic Information


Item Value
RNA id TU909635
length 869
lncRNA type inter_gene
GC content 0.47
exon number 2
gene id G799200
representative False

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048573.1
NCBI id CM023227.2
chromosome length 79455637
location 36446170 ~ 36459418 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome
species rainbow trout
(Oncorhynchus mykiss)

Sequence


gtgtgtggtgtgtgttgtgtgctgtgttgtgtgttgtgttgtgtgttgtgttgtgtgtgtgtggtgtgtgtgtgtgttgtgtgtgttgtgtttggtgtgtgttgtggtgtgttgttgtgttgtgttgttgtgtgttgtgtgttgtgtgttgtgtgttgtgttgttgtgtggtgtgtggtgtgttgtggtgtgtgtggtgttgtgtgtggtgtctgttgtgttgtgtctggtgtgttgtgtggtgttgtgtgtggtgttgtgtgtttgtgttgtgtgtttgtgttgtgtgtttgtgtgtggtgtggtgtgtggtgtggtgttttgtgtgtgttgtgttgtgtgtgtgtgtgtggtgttgtgtgtgttgtgtgtggtgtgttgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtgtttggtgtgtgtgtgtggtgttgtgtgttgttgtgttgtgtgttgttgtgttgtgtgttgtgtgttgtgtggtgtgttgtttagtgtgttgtgtgttgtgtggtgttgtggtgtgtggtttggtgtgttgtgttgtgttgtgtggtgtgttgttgtgtggtggtgtgtgttgtgtgtgtggtgtgtgtgttgtgtgtgtgtttgtgtggtgtggtgtggggtgtgtggtgtgtggtctgttgtgtgtgtgtgtggtgtgttgtgtgtgtgttgtgtgtgtgtggtgtgtgtggtgtggggttgtgttgtgttgttgtgttgtgtggtgtggtttttggtgtgtggtgtgttgtgttgtgtgttgtgttgtgtggtgtgtggtgtgttgtttggtgtgttgtgtggtgtgtgttgtgtggtttggtttggtgtgtgttgtgtgctgtgttgtgtgtgtgtgttgtgtg

Function


GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU909524 lncRNA upstream 36781 36410613 ~ 36410817 (+) True G799101
TU909511 lncRNA upstream 44609 36399824 ~ 36402989 (+) False G799094
TU909515 lncRNA upstream 44609 36402044 ~ 36402989 (+) True G799094
TU909512 lncRNA upstream 44859 36402044 ~ 36402739 (+) False G799094
TU909519 lncRNA upstream 48225 36398201 ~ 36399373 (+) True G799096
TU909654 lncRNA downstream 23062 36476096 ~ 36495052 (+) True G799214
TU909656 lncRNA downstream 70350 36523384 ~ 36523664 (+) True G799216
TU909658 lncRNA downstream 83204 36536238 ~ 36536482 (+) True G799218
TU909659 lncRNA downstream 85264 36538298 ~ 36538499 (+) True G799219
TU909661 lncRNA downstream 110358 36563392 ~ 36585315 (+) True G799221
XM_021615449.2 mRNA upstream 51504 36386918 ~ 36396094 (+) True si:dkey-7l6.3
XM_021615464.2 mRNA upstream 184674 36249344 ~ 36262924 (+) False LOC110531941
trnap-agg-57 mRNA downstream 19873 36472907 ~ 36472978 (+) True trnap-agg-57
trnap-agg-58 mRNA downstream 21102 36474136 ~ 36474207 (+) True trnap-agg-58
trnap-agg-59 mRNA downstream 23736 36476770 ~ 36476841 (+) True trnap-agg-59
trnap-agg-60 mRNA downstream 24967 36478001 ~ 36478072 (+) True trnap-agg-60
trnap-agg-61 mRNA downstream 26196 36479230 ~ 36479301 (+) True trnap-agg-61
TU909468 other upstream 130793 36313129 ~ 36316805 (+) True G799053
TU908119 other upstream 1075450 35364988 ~ 35372148 (+) True G797932
TU907166 other upstream 1890976 34555931 ~ 34556622 (+) True G797056
TU906563 other upstream 2325858 34121422 ~ 34121740 (+) True G796495
TU904694 other upstream 3860210 32583606 ~ 32587388 (+) True G794886
TU910049 other downstream 581384 37034418 ~ 37035918 (+) True G799578
TU910348 other downstream 1114211 37567245 ~ 37570411 (+) True G799858
TU911427 other downstream 1617182 38070216 ~ 38071433 (+) False G800834
TU912414 other downstream 2335027 38788061 ~ 38788354 (+) True G801778
TU912489 other downstream 2479918 38932952 ~ 38933868 (+) True G801851

Expression Profile