RNA id: TCONS_00042008


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00042008
length 15317
lncRNA type antisense_over
GC content 0.36
exon number 1
gene id XLOC_019927
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007133.7
NCBI id CM002906.2
chromosome length 39133080
location 923511 ~ 938827 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GCGGCCCCTGCAGAACATCACATGAGTGAGACTCATTTACACTCAGCCGGAGCTTCTTTCTGCCACAGAATAAAATGATGAACAAGGTGATGGAGACTTTCAATTGAGAGATCCCTCATTAAACTCTTATAAaagtgataataatataatagttccTCTATAAATCTCACAATTTCACTCTGGGAATTCAGTTTTTTTCATTCTTGCAATCTGTActtaattaatctttttttttttttttttttttacaaaattttgacagaatttttttcagatttatgcaTGTATATCTTGCAATTATCACTTTTTAAAGATCTGTTATgaatatttttcatttcataaataataatatgaaaattggttttaaaatgtaacaaagtaaTATGTATTTTTCCAGCACTCTCACAAATCAGActttatagttattttttttttccatggtgGAAATAAGTTTTCATATAAATCATCCTGAAACCAAAATGGACAATATTTGCTTTCTTAAAACACATTCTTGGTATTATAATGCAAGCTAAATATGAAACACAAAATTCTTTCAAAAATCTTTCACCTTTCTTCACctttaaaatatatgatcaatccctatttatttaaataaaagtacatTGTTCCCCTCATTGAATAACATTGTAAAAAGTGTTGTGGTTGTCATTTTCTATGCATTTTAAAGCCGTCTGCAGTAGTGTAGTTTATCTTACGTGGCCTCGGGGTCGTATTCAGCCCAGATCTTCTTAAACTCGTCTAAATGTTGCGGACCCAGAATCGACCAATCGCGGGTCAGATAGTCGAAGTTGTCCATGATCACAGCGACAAACAAGTTTATGATCTGCAAGAGAGCGCATTCAGCATTCAACATTACTTTCGTGTACAAAAACATTAGTAGCCACTAATCAAACTTgttagattacacatttatgcTAATGTGCTCTGagctacttttggattacatttagattacttttagagTAGTGTAATTTGACTATTTTTAgaatacatttagattactttatggtAGTGTAATCTGACAACTTTTGGAttgcatttagattacttttatagtaTTGTAATCacactacttttggattacatttaggtTGCTTTTATGGTAGTGTAATCTGACCTAtctttggattacatttagattacttttatgatagtgtaatctgactacttttggattatttttacattacttttattgtAGTGTAATCTAACTATTTTTGgaatacatttagattactttagtaTAATTGacaacttttggattacattgAGATTACTTTTTGGTAGTGTAATCAGACTACTTTTGGCATAAATTTAGATTACGTTTATGGTAGCGTAATCTGACTACCTTTGAATTACATTTAGCTTACTTTATCATAGAGTTATTTGACTACTTTTGGGTTAAATTTACATTGCTTGTATCGTAGCACTatctgactacatttggattacatttagattacttttatgatgaaataatctgACAACCTTTGAATttcatttagattactttatcaTTGAGTAATTTgaatacttttggattacatttagattacttttatggtagtGTAATGTggctacttttggattacatttagattacttttataggAGTGTGatctgattacttttggattacatttagattactttatcaTAGAGTAatttgactacttttggattacacttagattacttttgtggGAGTGTGatctgattacttttggattacatttagattacttttatgggaGTGTGatctgattacttttggattacatttagattactttatcaTAGAGTAatttgactacttttggattacatttagattacttttatcgTAGTGTAATCTGTCTacctttggattacatttagattatattagtgtaatctgactacatttagatgtaaaaaataatttactcTGATTACAACTACTTGATTTCTGGAACTTCATTATGTAATCCAGATTACACGTAATACAATATTACCCAGCATCTTTGCATGTATGAAGCGATACTCACTAGAAAAGCACAGAGCATGTAAAAGCTCATGAAGTAGAGGATGGCGAATCCAGATCCACACGTGTACTCTTCTCCGGGCAGATATTCTGACTTTGGGTCGCATCGCTGACCGTATAAACAACCCAACATGATCTCATGCCAGCCTTCACCTGTGGCACACCTGTTAACACACACCAGAatttactgcactgtaaaaaatgaaaacGTCAACAAATTAAACCTAATAGAACTCAGTTTTTTCGAATGTagttttcattaataaattaagttgaaaaaaTGTCTTTCTTTTAGGTGTAACAAGCTGAAGTAACATGTTTAAGTTGAtccagttttatttttaagtgtagaGATGCATCAATCGATGGAAAAGAAATCTGAATTGTACTTTATTGTGCTAAATGCGCATTCAGTAACTGCTATTTTCTCTTAATTACTAAATTCAGCTGATTTCTTTTCTAGACTTGCATATAAACTGCATTGCATTGGATTTTATAGAAAGTTTTACTCTTGTGGTTTGAATCTTGTGATGTTTTCaagattaaatataaaaatactgttACAATAAATGCTGTCATAACAATGAAAGACATCATCAGACCACAGCTATAACAATAAAGATGTAGAGAAATGATGTCATAACTTAATCACTTTCTGAACACTGTTAAAGGCGCCACCTACTGGAAATCATTGAATTTGCACCTATGTTCAGTCTGTCTACTGTTTTTGTTTCATACAGGTTATGTAGCAGAATTTTAGAAAGCTAAATGTCATAATGTGTTTAGTTACGTTTTGAAATTAAAAtagcaatttataaaaacatacaaaaaattcTGATATTTATTGGAATCAACCAATTTGCTGGTGTAAAAAATGATCCATGATACATCATGATCGGTGCGTCTTCACAAACTTTCTTATTTACGAATTTATTAAAGCGTTTGCACTTCTATGGTAGCGTAATCTGAcaacttttagattacatttagattacttttatgttagtgtaatctgactacttttggattacatttagattacttttatgataGTGTAAtaagactacttttggattacatttagattacttttatgataccataatctgactacttttggattacatttagattagttTTATGATACCATAATCTGACtaattttggattacatttagattacttttatgataTTGTAAtaagactacttttggattacatttagattacttttatgataCCGTAATCTGACtaattttggattacatttagattttatgATAGCGTAATCAGACAACTTTTGGATTACACTTAGTTTACTTTTATGATAGTGTAATCTGacaacttttggattacatttagaataCTTTTATGATACCGTAATCTGACTGCTTTTGGATTACACCTAGCTTAATTTTACAGTAGCGTAATCTCACTACTTTTTGATTACAGTTAGATTAATTCCATCGTACTGTAATCGGActacttttgcattaatttagattacttttaagaTGTTGTAATCTGACTATTGGATTACATTGAGATTATTTTATGGTAGCGTAATCTGActtcttttggattacatttagattacttttatggttgtgtaatcagactacttttgggttacatttagattacttttatggttgtgtaatcagactacttttggattacatttaaattacttttacgaTAGCGTGATCTGActattggattacatttagattacttcatGGTAGCATAATCTCACTACTTCGGATTGAATTTAGATTACCTTTATGTtagtgtaatctgactacttttggattacaccTAGCTTAATTTTACAGTAGCGTAATCTCACTACTTTTGAATTACAGTTAGATTAATTCCATGGTAGTGTAATCGGActacttttgcattaatttagattacttttaagaTATTGTAATCTGACTATTGGATTACATTGAGATTATTTTATGGTAGCGTAATCTGACTTCTTTTGGATTACAtctagattacttttatggttgtgtaatcagactacttttggattacatttagattacttttacgaTAGCGTAATCTGActattggattacatttagattacttcatCTTACTACTTTTAGATCGAATTTAGATTCCTTTATGTTAGTGTAATCTGACTATTTTTGGATTATATTTAGATTACTCTGATAATACATCTTGATTGGTGCATCTCCAGTCTTTGCAAACATTCTTATGAATGAATTCAGCAAATCGTTCGCACTTCATACCGGAACAGCAGTAAAACGGCTTGAGGAAATGTCTGGAAGTTGTTGTTACGGTTGATTATGGTGCCATCTAGTAAAGCAATTTTGCCAAACACCTGACAGGAGAAGACAGCCATGTTATTATGTAGTGTAACGTTAAATAAATCATAACTATTGTGCATATTTTACCTGCATCCCAATGACGGCGTATATAAAGAAGAGCATAACGATGAGGAGAGCCACGTATGGCAAAGCCTGAAAAACACACCaacttttaaaacacatttcaatcATGCGCATTTCGTTAAAATGAGACATTTTCCTGCCTAGCATTCGTCTGTATATTCATATAATCAATAAACATGAATAATATCAGTTTATAAGATcaattttctattaaaaatgtacagGGTCACTGCCGACCTGAGATATGTAATCATGTAGTTTTTCCTCCTTCCTATATAGTTTAGTTCTATAACGAATCCTAATCAATCTTAATTTCGGTGAAGCGACTATGTAAAGAGCTAAAATATATGAAGTTAAGTTGGCGATCAGTCTCTCAGCACAGTTTAAGACATCTTCATTATATAATCATAAAGACGCAGCAGTTCATTAAACCTGGAATGATTTGATGAAGGTCCACAGCAGGTTACGAATGCCTTCAAAACGGTTGAGGAGTTTCACCAAACGCATGACGCGGAAGAGCCGGAAGAGTGTGATGGAAACACTCATGTTCTCCGAGTCCTGAAGAACAGACACAGTGCTTTAAACACCAGTGTAGAGGCTTTTATTATCGTGAAAACTTTTATTAAATCTCCACTTACTGCTATAGCCTGCATTGGATTCACTTCCTGAAAGGAAAGAGAAAATACAGTTTTGGTCAGAATTATTCTTTTtcagtatttcccaaatgatgcttaacagagcaaggaatttttcacagtataaatgtttgtgtgtatttacagAGCAGCCGGTGAGGCAGTAGAGTCCGCCCTGAGCCGCGAGAGCCGCCTGGAGAAGAAGAAAGTACAGAAAAGAGGAATAAATACACACATCCACAGTCACTGAGAACAGTAGAACAGGTAAAGCCcactatttttaactgtactTATGAAGAAGTTTGTGAAACTTACGTCAATTTCACTGAGTATTACGTCAACAATACTGCCGACCACAATCACAAAATCAAAGACGTTCCAGGGGTCTCCGAAGTATCCCTATGAGAGAAAGATTTAAGGCTGTATGTGCGCCGTGTATACTTATGtacttttatacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaaacacacaaacacacacaaaaacatgtatatacttttatatttacaaatttacatatattttttatttatattattgcttttaacaattaatcacaattaaacaaatacaaaataaagtttgtctatatatttttatatatttaaatacatagagttaaaatttttacataaatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttcattcattcattttcttgtcggcttaatccctttattaatccggggtcgccacagcggaataaaccgccaacttatccagcaagtttttacacagcggatgcccttccagccgcaacccgtctctgggaaagtgtatatatatatatatatatataagtgtattatatatatatataaacacacacacacacacacacacacacacacacacacatacatgtatatatatatatatatatacacacacacactctctcaaatgattaatcgtgattaatcgcctcaaaaataaaagtttgtatttactatacacacacacacacacacacgcacacacacacacaaatctagaaaaacaaatatattagcaTATATATCTATATCAATTAAAATATGTAGATGTTTTATATCTATGTATAACCAAATTTTCTGAAATATATGCATCTACATTTATATACACAACTATATACAGTACACAGAAATATTATGCAAATGAAAACTTGTGGTTTATTGTTTACCAGTACTAAAAGGCAGTGCTCAGCGGTTAATCGTGTCAGAAATATAAGAGGTATTTTCAGAAGTTGTGTCTCACCTTTGCTTTAAATGCGCCAAGTTTGAGGATCATCTCCACTGTGAACAGGACGGTGAAGATGACGTTCAGCGTGTCTGCCAGATCAGTGATGTGATCAGACTGCTTACAGTGCTGAAGGGCAGAGAAATCGCAGATTCAATGTatgaaatatcttttaaaaagcctttaaatgtcactttaagctgtatagaagtgtcttgaagaatatctagtctaatattattcactgtcatcatgacgaagagaaaataaatcagttattagagttattaacactattatgattagaaatgggtTAAATCTTTActtcgttaaatagaaattggggaaaaatatacatgagggctaataattctgaatttaactgtatatatgtatgggtATATATATCCTTTTTCCTTTTTATATGTTACAAAACAATCTATAAAAACtaagtgaataataataacaatattgataATAAAGTGAAAGTTCATCATTTGCatcattattgttcattattgttgtttttttttagaggTCATGAACTGAGAACCCAAAATCTTCTTGACATATAAGAGCTCTCGGTACTATTAAATACACGAACACACTTTGTGGTTGCTCTAAAATCAGCTGATACTGaagactaagggctctattttgacgcagggcgcaaacgcttttagggcatgtcaggacgcatttttgctaatttaaggacgggaaatctgccttgtgtTGCGGcgtatggtctaaaagggttgagtttattttcttaatgagttagaGGTGTGTTTTTAGAagctttaagagccagctgcgtctcgccaagagcgcattcaccatttacaggacgcaaagtaagtctaagtggaaaaaatgagcatttcacaagcaaacagttcacagtttattaacagaaaactgttaaacagagcatctactgcgtgagaatgagaggtaaatgatctactttcactttcgctcttggatagggaaacctttacgcacagacaccaattagcctataaataattaattgcgtttgttaagcgcaaatattcatttcaaaactatttctaaattcagttctaatttccagcaaacgaataaatgaataataataatgaagtgtgctcaaaaacctgagttatatcctaatacacacatgctgtgccccacatggtctaaaacctgcagatgggcaaatctaagcttgtttttaataaaacaaatataaatatggatataataaataatactgctaataataataacattatacaaaagcaaattgttatgaatgaactgaaaaagcccgagatgaagaagacataaaagcagtgattttcatatttatgtaggctagaaaataatgttttgtaatattttaatcctttatatttatattctatatctattcttattatatcctctatatatccttaatatttaaatgttttcatatgtaaagatatttgcctattgctctcttgtgtgtattaagcagtgtgtaagcgaggcgcagctctgcgctggagtttagaccgggtttgttttggtctaatgaaaaatctattatagtttctcaaaatagcaacgcgccagcggtccacctcagagCGCCtactttttagagcagaacgcctatgagcacacaaatgagcgctaatgcatttgctatttaaacagcgtagcgcaacgcctcaaaaccctAAATGTACGGCTGTCTTTTCATACCTGCATCCCGAGGCACATGGTGTTGAGCATGATGAGGAGGAACATCAGGTACTCAAAGTAGCAGGAGGTGACGATGTACCAGACCTGGTACTGGTAGGGGTTTTTGGGGATGTAGCACCTCAGGGGTCGAGCTTTGAGGGCGTACTGGACACACTGACGCTAGCCAAGACAACAGAACGACACATTAGACAGCATTTGATGCCATTTTCATTTGAAAGGAGACCTATTCTGCCACTAAATGCATCTCTGCTGTctctatagtgtgtgtgtttgagtctgagctgagaacagcacacagatgatgtcctccagctctctgaaactgaccctttcaggctttgatcctaattgtggcgttttggtgactgtcgctttaaatgcaaatgagattgtgctctattCGGAAGAGGGAAGAGCTACAGAGGCCTGTGATGtaaagcagcagtgtgtgtgttgcgAGTGCTGGTCATGTGTGAGTTtgttgatgcttctgtcagtctatgtctctgttcatctagaactccacatctatcatcctcttagtctatgctgacatcatcttcagcagctcaaacactctaatggcgaatggacagtcggctgcttctcactcagggctgctggagatgctaatgaggaagagaaaTGCATgacaaaacatgtttatgttAAGAGATGCTGAGTCTGTTTAAATTGCGATGCACTTCTTGTCTTGTAAATCGTGGGTGATGATAGGTCTCCTCTACGATGCGGCACAGTATTGTAATGGATTACCTGGTTTTTGTCCAGTTCGCAGTTCTTGTACTCCTGCTCGCCCTGTTCCTGGAAGGTGACGATGACGAAGCCCACAAAGATGTTCATCATGAAGAAGGCGATGAGGATCAGGTAGACGATGAAGAAGATGGAGATCTCGATGTGGTTGTTGTAAACAGGGCCCATGTTTTCCAGATTCGAGTCGATGGCTTTGTAGAGCAAGCTGCGGATACAGGTACAGTTAGGAgagcatatatgtgtgtgtgtatatacagtgctcagcatatacagttgaagtcagaattattagcccacatgtttatttgttttcctcaGTTTCTTTTTACCGGAGAGAAggtttttttcaatacattttcagTCATAATACACTctaaaactattgttatacaaaacaaaacaaaaaatgaatgcaACAGTGTGCATTAATAGTTGTTtaagttgtttaattttttatttgttttcaaatttactgttcatgcttgtTAGAAATGCATTTAACAACATTCTTgtttttaggtttatttttatttgtattaaacccaacacaatctcacggcaattcgtaactttttcatttagtggctaattcgtatgaattcgtacgatgtAATTCGTaccatttagtacgatttgctcatcccccaatgacagttggggttaggggtggggttaggtgccacgcctcttttttaaaatcgtaccatttcgtacgactaaactcgtacgaattcgtacgaattagccactgaactggcaaaacgtaaaatacttacattttctcgtgagatcaggctaattaaaccacaggttttcattgttttacaaaacaaaaacatgtactgtctcatattatcaatataaaaaataacaacgaACATCAGTGTAtagacttaaaaatacaaaacaactccattagtgtggaaaaactgagttatcaacccaatttctttgggttgctGCAAGTTAGATATTGTTTTAGAGAAACTGACAGATaaatttacctttaaattagccgcatttttaaattgatatcattatcaatattttcctgttttaaaaacttaataaaagtattctggcaacttaaaagttttaatgtaatcagcattttagaatttttaagttacaataatgcATTAAGCTATAGTGCTAACAATGTTtggagttattttttttttagagtgtttaATAAAAGTCTCTATCtaagactagatattcttcaagacacctctatacagcttaaagtgacgtttaaaggcttcactagggtaattagtttagctaggcaggttagggtaattaggcaagttactgtataacgatggtttgttctggagactatcgaaaaaagatacagcttaaagaggctaataatatagaccttaaaatggtgtttaaacaatttaaaactgcttttattctagctgaaataaaacaaataagactttctccagaagaacaaatattatcggaaatactgtgaacatttcctgaatctgttcaacatcatttgggaaatatttaaaatagaaaaaaaatcaaaaggggggtgaataattctgacttcaactgtatgtgtgcaccccgtcacaaatctctcttttgtttaataggaagctttacaatattgtatttgtgcatatacattagattagtcagtactgaagccaaatctggagctcatctaacaaataacttacaataacgctCCAAAAACATCAGCCAAATTTATAtggtatagaaaaatattaaatgcacattttaaaaaaagaggaaaaatcgaGAGAACAAAAAAGgggaaaaatttagttgaaattttgtaggttgtattttttgcaatattttgcttgaatttaattgtattatctttccattttccAGTTCGATTTGCTGAACTAGTTCAACTGGTTCACTTaaaagatccggttaaaaagatttgtttgcgatcgcgatacagaaataaaacccaatATTGGGCACAAacgtgttaaagtaatagtttaagtgtctgtatttaatgctgtcaccgtgctgctgtcatgtccactcgttgtttttgtgGCGGGAGCAACAGagaggatgactggaggagaaccggcacgatctggccaatggcagcaggattacagactctgaggtgccgtacaggtcaaacacctgcagcgcgaaTTATATTTAACGTTACTTCTAAAGGgtttacagtaagattatgcattaaatacatttacaaagacgaaaatgaaggaggtttttgctataatttgagctagtttcagttagttttgtatgtacacaacaCAGTTTccgttctagttttttttttttaaactctcgtttttatttcagttaacgacaattatttagcattttagttTACGTGTTTTCGTTTgttttgttaactataataaccttgcaaTGGAGTAAGAGAAACAATCTTGTGTTTCCTTTGGACAGAAGATTATTTTGTGCAGATTTCTATGCGTGCAGATTCCTCGTGGGCCTACTAATCACATCACGTTTGTAACTATCTGACTGGGAGCACAGTGTTTGTCTAGTGCGTACTCTGGCCATCCCTCGAATGTGGACACGGTGAAGAGAGCCAGCATGCCGTTCAGAACGTTGTCGAAGTTCAGGTCGCTGTTCATCCACAAGCGTTGACTGACCACCATATCATGAAGAGCGTTCTCCTGATGTTGAATAAACGTTCCCCTGAGAGCGTCACCAAAGCACAGGAGAATGATTTGGAGACTTTAACATTGTGGAGTGAAAGAATAAATACAATGAACGTTTAACCATACTGGCATTCCTCTGCCGTCATTTTCAGCGGGTCTGTGCAGTATAGGAATTTCCCCTGCCAAAAACGAAACACagattaaaggggtagttcacacaaaaatgatcaATTCAGTTATAATTACTTTCCATAATGTCGTGTCAATCCCCTGAGAGCTTCGTTCCTCGTCAGAacacaaaataaagatattttagatgaaatcctggagctctctcatcctccatagaacTAATTTTGTGGAACTATTCTTTAAGTCTAGAAATAATAACTAAGTTGAAGTGTCTGTGTGAACTTCCTGACCTTGAAAAGTTGGACGCCGATGCAGGCGAACATGAAATCCAGGAGCATGGTGACTAAAACGATGTTGCCGATGGTCTTGATggccacaaacacacactggacCACATGCTGAATGAAAGCAGAGACAGAGATGGATGAACAGAGGATTAACGTTTCTATTGTAGCACTCCCTAATCTGTAAGAGAACTTACTTTGAGGCCTTTGGCTCGATTGATAGCCCTTAAAGGCCTCAATACTCTCAAGACCCTCAAGATCTTCACTACTGAGATGGCACTTGATCTGCGGAGAAACGTCAGGACTTTGGAACAGCGTCATTTTGTCACTACAAAGTTGTTTGTACTCTAGTGCCTTGCTTCCACTGAGCGggcagtacagtacagtacaattcCCTACAGGAAGGCTCGTGCTTTCACTCCCTCTGACTTTATTCTGCAATGCGGAAGGGTGCTCGTTTTAGTGACTGCTTTAGAACTTCCGAATCAGTCAAAAGTTTTACTTTGGATGTAATAAATTGTGATGTATTTgcatattgtttgcaaatatttgagaaatgcacCAACATTATAGCCTCcttcaatagcccctttcacacatacacatctttccagaaaattaccagcaattttccggaaaggtctgtatgtgtgaacaggccctttttaaaaataccagtaaatccaacccaggctcaatctgaaaacgtagtccggcggacatttctggagacccgggaggtacatatttgtgcagtttttgttttcgcgaatctgcgaGAGTCCGCTGTGCGTGatttttcgtatctcgaacgtctctcgcgagtgccgttcgcacccgcgatgttctcgcgtcaacccaccagaggccgctgtctgactgaccgaatgattgactgcgcgaccggcttatcggctgacccaccctcctccttccctgaacccaaccagttttatcgattgacccgcccgcccgctcacgtccctaaacccgagcaacaatttagaaaagccgtctagaaaaagaaaaaccctcgtctgtttttcagatttcaccgcattctcaccctgttatgaactcgttcgctttaatttttggattctgtttttgtcttacctgatttctggaaccgctcttccctgcaCTCGAACCCGGACACCTTTGTCAAcccctcctctctgcatctgaagtccgccaaTGCACACgatgagctaaccggacaaactgactgcagcgggaaagccctccacacggaggtaagcggtcagccggcaagcgcgaaagggaacggcgtcacaccgccccgtagcgttcgcccGTGacatattttgcggtctccagaaacgtccgctggactacgttttcagaatgagcctgggttgggtaaATCAGTtatggctattttccggaaagagaagttgtaacattaccagtaattttccggaatgctgcgctgtgtgaacgcagaaggaagattgccggaaagagcgcgttcacgtctagaacgtgctgaagtgagacatctactttagccaatcggAACAGTCAGACGCACTCATGTCCATTTGgttcatgaaaataaaagcctttgaatgttCTTCCATACACATTTTTGTTAGCCAGATAACGTTTTTATGTTGCTtcctaatgccaactgtgtaaataattatctaTTCGATGCTTAtcataagccgttgtttgtttacctttaagcccTGCTTCCTTCAGTTTCTTGACGTGTGTGCCCGTAAAgcagcccgtgagcgccagcacacatgTATTacgaacatctcgacatgcgaaagtgtccctctatatatttttatcaaagttgtttacaatactgatcaatccacagagtttgtgatgtagtcaaatgtttacaaatacaagcgcagccgtttagagctcttttctggttaatgatgacagaatttactggtattttggaatggttGTGTGAATGGTCTTTCCAAAACATCCGTAACGTCCTCGCTTGTgtaaacagcacttttttgaagttACCGGTAAAATCGtccggaaattttctggatatttaccgatatcactgtgtgaaaggggcttttgtgtTCCCGCTTGACTTGAATCATTTGCATGGTTTCGTCACTTCAGTTTGGGTCCTCGCATTCCGAATTGTTGCTGAAGAACCAATCGCAATAGTCTCTTTCGAAATGCCTGACTCTACATATTGAATAAGGCAAAATCTTCACATTATTCTGCTGTACATTTCACTTTTTGTAAGGCTTCTACACAAATTCTATGAATCAGACCCCTGCTCTTTCCAGAAGAGTGCCAAAAAAAGTGGTACAGATTACTTTTTTACTCCTAACCCTTACTTTGACAGTAAATGGAAATAAATTCACACCATATTGTACTGTACCGAACCGTAACACTCAGTGTAAATGAGCCTTAAGTCTGCTTTATGTGTCAACACAAGACTGGACTGCTTTAAAATCTCACTCCATTCCCATTGACAGCAGCGAGACGCCGACCACAATCAGGTCCAGGATGTTGAAGGAGTTTCGGCAGAAGGAACCCTTGTGTAGGAACGCACCGTACGTTGTCATCTACAAGAGACGGAGTACTCAACAACTCGCAGAACACAAAGGCTAGCTACGCAgaacacacaccaaacacaccaTCCCCACCTTCAGCACAATCTCTGCAGTAAAGACTGAAGTGAAGACGTAATCAGCGTAGGCCAGGACCTGCGGGGTAGAGGAGAGCATCATGTTGAAGACAATGGCAAGTTAAGTTGTGACAAAGACTAAGGAAATCACAAGACATGTCAGTCATATTGACTTTATTCTGCGATGTGGAAGTGTGCTCGCTTTTGCGATCGTTTTAGTACTTCCGATTCGTTTTCCGATAGAGAAATGACTATGAACGGTTAcactgcttgctctacaaactaGTTTGTTCATGACTACACGTAAAAAGTGCAAtaatatagtaagaaaatatCGGCAGCAGAATGAGCggttttaatgttaaataatcaATAGAAGTGAATAAGAGCAGAAGCCTTGAGCCCGAAAAAACTCCAATGCCTGCACCTACTTGAACAAGGTCAATATTTTTTAATGAGGGAAAGTGTAACGTCAACATCCCTAATGAAGTGCGGCTACTACAGCAGCCAATCTTCGACTGAGGGAAGGGTGTTGGTGAAGACGTGTTTAggacagtttctgcagcttcattatGAATCCTCTggggtcaacaaacacactggtatATTAGTGAACACTTGCTTCAAGCACATGATTTAGCTGGCATcttgctctctgcaactctcacatgg

Function

GO:

id name namespace
GO:0006397 mRNA processing biological_process
GO:0051276 chromosome organization biological_process
GO:1903047 mitotic cell cycle process biological_process
GO:0008380 RNA splicing biological_process
GO:0000793 condensed chromosome cellular_component
GO:0044422 obsolete organelle part cellular_component
GO:0044424 obsolete intracellular part cellular_component
GO:0044428 obsolete nuclear part cellular_component
GO:0070013 intracellular organelle lumen cellular_component
GO:0044446 obsolete intracellular organelle part cellular_component
GO:0032991 protein-containing complex cellular_component
GO:0005622 intracellular anatomical structure cellular_component
GO:0005634 nucleus cellular_component
GO:0005654 nucleoplasm cellular_component
GO:0031974 membrane-enclosed lumen cellular_component
GO:0031981 nuclear lumen cellular_component
GO:0043226 organelle cellular_component
GO:0043227 membrane-bounded organelle cellular_component
GO:0043229 intracellular organelle cellular_component
GO:0043231 intracellular membrane-bounded organelle cellular_component
GO:0043233 organelle lumen cellular_component

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00042007 lncRNA upstream 105884 811600 ~ 817627 (+) True XLOC_019924
TCONS_00042006 lncRNA upstream 115054 803504 ~ 808457 (+) False XLOC_019923
TCONS_00039751 lncRNA upstream 115054 807453 ~ 808457 (+) True XLOC_019923
TCONS_00039739 lncRNA upstream 259657 662103 ~ 663854 (+) True XLOC_019919
TCONS_00042005 lncRNA upstream 614307 240168 ~ 309204 (+) True XLOC_019910
TCONS_00039763 lncRNA downstream 116891 1055718 ~ 1058553 (+) False XLOC_019931
TCONS_00039764 lncRNA downstream 124024 1062851 ~ 1066844 (+) True XLOC_019931
TCONS_00042009 lncRNA downstream 256044 1194871 ~ 1195348 (+) True XLOC_019937
TCONS_00039777 lncRNA downstream 322898 1261725 ~ 1267820 (+) True XLOC_019938
TCONS_00042010 lncRNA downstream 377925 1316752 ~ 1364861 (+) True XLOC_019944
TCONS_00039753 mRNA upstream 24866 883678 ~ 898645 (+) True XLOC_019926
TCONS_00039752 mRNA upstream 66625 835728 ~ 856886 (+) True XLOC_019925
TCONS_00039746 mRNA upstream 114229 789795 ~ 809282 (+) False XLOC_019923
TCONS_00039745 mRNA upstream 114229 789795 ~ 809282 (+) False XLOC_019923
TCONS_00039749 mRNA upstream 114610 797105 ~ 808901 (+) False XLOC_019923
TCONS_00039754 mRNA downstream 40040 978867 ~ 987388 (+) False XLOC_019928
TCONS_00039755 mRNA downstream 41463 980290 ~ 996521 (+) False XLOC_019928
TCONS_00039756 mRNA downstream 48961 987788 ~ 994500 (+) True XLOC_019928
TCONS_00039757 mRNA downstream 59011 997838 ~ 1018752 (+) False XLOC_019929
TCONS_00039758 mRNA downstream 67746 1006573 ~ 1018598 (+) False XLOC_019929
TCONS_00039750 other upstream 115997 803504 ~ 807514 (+) False XLOC_019923
TCONS_00039759 other downstream 79774 1018601 ~ 1019152 (+) True XLOC_019929
TCONS_00039761 other downstream 100721 1039548 ~ 1039749 (+) True XLOC_019930
TCONS_00039775 other downstream 310961 1249788 ~ 1262272 (+) False XLOC_019938
TCONS_00039776 other downstream 311412 1250239 ~ 1251660 (+) False XLOC_019938
TCONS_00039784 other downstream 384687 1323514 ~ 1329146 (+) True XLOC_019943

Expression Profile

//