RNA id: TCONS_00039803



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00039803
length 243
RNA type mRNA
GC content 0.43
exon number 3
gene id XLOC_019958
representative False

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007133.7
NCBI id CM002906.2
chromosome length 39133080
location 1526040 ~ 1606312 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


CGTGATGACGTCATCAGTGACGCGATTATgcagcgtcgagtcttcagagctgagatttctctgtttgttctcctgaagctctgccaccatcagtgaaagacaaagacagagtttattgaaggacagtgagaagatgagtgatccagaaccctgcagaattaaacaggaagagactgaagaactaatagATGTGAAGGTGAAAAGTGAAGaactgagtgaagatgaggagaaacatcatgtcaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000164089

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00039787 lncRNA upstream 141971 1377331 ~ 1384069 (+) True XLOC_019947
TCONS_00042010 lncRNA upstream 161179 1316752 ~ 1364861 (+) True XLOC_019944
TCONS_00042011 lncRNA upstream 196890 1317461 ~ 1329150 (+) False XLOC_019943
TCONS_00039777 lncRNA upstream 258220 1261725 ~ 1267820 (+) True XLOC_019938
TCONS_00042009 lncRNA upstream 330692 1194871 ~ 1195348 (+) True XLOC_019937
TCONS_00041847 lncRNA downstream 128296 1660187 ~ 1665471 (+) False XLOC_019971
TCONS_00041848 lncRNA downstream 195159 1727050 ~ 1732110 (+) True XLOC_019977
TCONS_00042012 lncRNA downstream 374111 1906002 ~ 1909424 (+) True XLOC_019993
TCONS_00039862 lncRNA downstream 421259 1953150 ~ 1954788 (+) False XLOC_019999
TCONS_00039863 lncRNA downstream 421930 1953821 ~ 1960320 (+) False XLOC_019999
TCONS_00039802 mRNA upstream 1365 1517318 ~ 1524675 (+) True XLOC_019957
TCONS_00039797 mRNA upstream 11020 1481307 ~ 1515020 (+) True XLOC_019954
TCONS_00039800 mRNA upstream 14859 1502561 ~ 1511181 (+) False XLOC_019956
TCONS_00039801 mRNA upstream 16928 1508545 ~ 1509112 (+) True XLOC_019956
TCONS_00039799 mRNA upstream 22907 1501566 ~ 1503133 (+) False XLOC_019956
TCONS_00039805 mRNA downstream 7482 1539373 ~ 1540981 (+) False XLOC_019959
TCONS_00039806 mRNA downstream 8958 1540849 ~ 1555366 (+) False XLOC_019959
TCONS_00039807 mRNA downstream 9192 1541083 ~ 1546196 (+) False XLOC_019959
TCONS_00039808 mRNA downstream 13145 1545036 ~ 1547201 (+) True XLOC_019959
TCONS_00039809 mRNA downstream 25057 1556948 ~ 1557773 (+) True XLOC_019960
TCONS_00039784 other upstream 196894 1323514 ~ 1329146 (+) True XLOC_019943
TCONS_00039775 other upstream 263768 1249788 ~ 1262272 (+) False XLOC_019938
TCONS_00039776 other upstream 274380 1250239 ~ 1251660 (+) False XLOC_019938
TCONS_00039761 other upstream 486291 1039548 ~ 1039749 (+) True XLOC_019930
TCONS_00039759 other upstream 506888 1018601 ~ 1019152 (+) True XLOC_019929
TCONS_00039812 other downstream 44972 1576863 ~ 1577746 (+) True XLOC_019963
TCONS_00039818 other downstream 98795 1630686 ~ 1633449 (+) False XLOC_019968
TCONS_00039821 other downstream 118237 1650128 ~ 1653938 (+) True XLOC_019970
TCONS_00039822 other downstream 128524 1660415 ~ 1661346 (+) False XLOC_019971
TCONS_00039823 other downstream 129375 1661266 ~ 1665471 (+) True XLOC_019971

Expression Profile


//