RNA id: TCONS_00041199


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00041199
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.56
exon number 1
gene id XLOC_020940
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007133.7
NCBI id CM002906.2
chromosome length 39133080
location 10763933 ~ 10764047 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GCTGGCAGctcgctctctgcaactctcacatggtcgcccacttaagttaagcagggctgtgcctggtcagtacctgaataggtggccacatgggaaagctaggttgctcctggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000181223

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00042346 lncRNA downstream 52402 10706775 ~ 10711531 (-) True XLOC_020938
TCONS_00042345 lncRNA downstream 52522 10706775 ~ 10711411 (-) False XLOC_020938
TCONS_00041197 lncRNA downstream 88338 10673169 ~ 10675595 (-) True XLOC_020937
TCONS_00041195 lncRNA downstream 102936 10658018 ~ 10660997 (-) True XLOC_020935
TCONS_00041176 lncRNA downstream 395608 10361730 ~ 10368325 (-) False XLOC_020921
TCONS_00041204 lncRNA upstream 131916 10895963 ~ 10900976 (-) True XLOC_020943
TCONS_00041205 lncRNA upstream 139463 10903510 ~ 10917793 (-) True XLOC_020944
TCONS_00042347 lncRNA upstream 158718 10922765 ~ 10926958 (-) True XLOC_020945
TCONS_00042348 lncRNA upstream 318895 11082942 ~ 11097837 (-) True XLOC_020948
TCONS_00042349 lncRNA upstream 323357 11087404 ~ 11089700 (-) True XLOC_020949
TCONS_00041198 mRNA downstream 11462 10735909 ~ 10752471 (-) True XLOC_020939
TCONS_00041194 mRNA downstream 122060 10639440 ~ 10641873 (-) True XLOC_020934
TCONS_00041193 mRNA downstream 158888 10592641 ~ 10605045 (-) True XLOC_020933
TCONS_00041192 mRNA downstream 159407 10591958 ~ 10604526 (-) False XLOC_020933
TCONS_00041191 mRNA downstream 172057 10586296 ~ 10591876 (-) True XLOC_020932
TCONS_00041200 mRNA upstream 7068 10771115 ~ 10774735 (-) True XLOC_020941
TCONS_00041201 mRNA upstream 50157 10814204 ~ 10891213 (-) False XLOC_020942
TCONS_00041203 mRNA upstream 50210 10814257 ~ 10883394 (-) False XLOC_020942
TCONS_00041202 mRNA upstream 50210 10814257 ~ 10883394 (-) True XLOC_020942
TCONS_00041206 mRNA upstream 163323 10927370 ~ 11054244 (-) True XLOC_020946
TCONS_00041196 other downstream 95959 10667858 ~ 10667974 (-) True XLOC_020936
TCONS_00041173 other downstream 605827 10156402 ~ 10158106 (-) True XLOC_020918
TCONS_00041160 other downstream 684264 10076578 ~ 10079669 (-) False XLOC_020914
TCONS_00041139 other downstream 937464 9824521 ~ 9826469 (-) True XLOC_020903
TCONS_00041137 other downstream 1049602 9714214 ~ 9714331 (-) True XLOC_020901
TCONS_00041246 other upstream 1820792 12584839 ~ 12584954 (-) True XLOC_020969
TCONS_00041251 other upstream 1843286 12607333 ~ 12611301 (-) False XLOC_020970
TCONS_00041252 other upstream 1853102 12617149 ~ 12626105 (-) False XLOC_020970
TCONS_00041253 other upstream 1860219 12624266 ~ 12626079 (-) False XLOC_020970
TCONS_00041266 other upstream 2169438 12933485 ~ 12934589 (-) False XLOC_020979