RNA id: TCONS_00041289


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00041289
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_020995
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007133.7
NCBI id CM002906.2
chromosome length 39133080
location 13945953 ~ 13946067 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ACTGGCAGCTAGTTCTCTataactctcacatggtcacctactgaagctaagcagggttgcacctggtcagtacttggatggaagaccacatgggaaagctgggttgctgctggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000182962

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00042361 lncRNA downstream 252326 13668985 ~ 13693627 (-) True XLOC_020992
TCONS_00042360 lncRNA downstream 296349 13638850 ~ 13649604 (-) True XLOC_020991
TCONS_00041944 lncRNA downstream 338390 13606281 ~ 13607563 (-) True XLOC_020990
TCONS_00041276 lncRNA downstream 514649 13422568 ~ 13431304 (-) False XLOC_020988
TCONS_00042362 lncRNA upstream 329679 14275746 ~ 14298602 (-) False XLOC_021001
TCONS_00041301 lncRNA upstream 329756 14275823 ~ 14295103 (-) True XLOC_021001
TCONS_00042363 lncRNA upstream 353733 14299800 ~ 14301873 (-) True XLOC_021002
TCONS_00042364 lncRNA upstream 386383 14332450 ~ 14334135 (-) True XLOC_021004
TCONS_00042365 lncRNA upstream 818931 14764998 ~ 14773881 (-) False XLOC_021009
TCONS_00041287 mRNA downstream 88224 13846130 ~ 13857729 (-) False XLOC_020994
TCONS_00041288 mRNA downstream 94656 13847136 ~ 13851297 (-) True XLOC_020994
TCONS_00041279 mRNA downstream 296365 13638586 ~ 13649588 (-) False XLOC_020991
TCONS_00041277 mRNA downstream 401709 13458735 ~ 13544244 (-) False XLOC_020989
TCONS_00041278 mRNA downstream 479707 13462984 ~ 13466246 (-) True XLOC_020989
TCONS_00041291 mRNA upstream 137662 14083729 ~ 14115292 (-) False XLOC_020997
TCONS_00041292 mRNA upstream 137969 14084036 ~ 14115316 (-) False XLOC_020997
TCONS_00041294 mRNA upstream 181405 14127472 ~ 14128716 (-) True XLOC_020998
TCONS_00041295 mRNA upstream 199443 14145510 ~ 14161309 (-) True XLOC_020999
TCONS_00041296 mRNA upstream 232746 14178813 ~ 14272699 (-) False XLOC_021000
TCONS_00041282 other downstream 229368 13711434 ~ 13716585 (-) False XLOC_020993
TCONS_00041281 other downstream 229368 13711434 ~ 13716585 (-) False XLOC_020993
TCONS_00041286 other downstream 229551 13715455 ~ 13716402 (-) True XLOC_020993
TCONS_00041280 other downstream 229556 13711434 ~ 13716397 (-) False XLOC_020993
TCONS_00041284 other downstream 229886 13715376 ~ 13716067 (-) False XLOC_020993
TCONS_00041290 other upstream 73537 14019604 ~ 14019722 (-) True XLOC_020996
TCONS_00041293 other upstream 142286 14088353 ~ 14089062 (-) True XLOC_020997
TCONS_00041297 other upstream 277054 14223121 ~ 14247242 (-) False XLOC_021000
TCONS_00041309 other upstream 747045 14693112 ~ 14693228 (-) True XLOC_021008
TCONS_00041310 other upstream 818931 14764998 ~ 14773300 (-) False XLOC_021009