RNA id: TCONS_00041309


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00041309
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_021008
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007133.7
NCBI id CM002906.2
chromosome length 39133080
location 14693112 ~ 14693228 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

AGCCACAACCATAtcatcctgcagcccaagactggttactcactgtagctaagcagggctgagcctggtcagtacctcgATGGGAtcccacatgggaaaactaggtctctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000178582

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00042364 lncRNA downstream 358977 14332450 ~ 14334135 (-) True XLOC_021004
TCONS_00042363 lncRNA downstream 391239 14299800 ~ 14301873 (-) True XLOC_021002
TCONS_00042362 lncRNA downstream 394510 14275746 ~ 14298602 (-) False XLOC_021001
TCONS_00041301 lncRNA downstream 398009 14275823 ~ 14295103 (-) True XLOC_021001
TCONS_00042361 lncRNA downstream 999485 13668985 ~ 13693627 (-) True XLOC_020992
TCONS_00042365 lncRNA upstream 71770 14764998 ~ 14773881 (-) False XLOC_021009
TCONS_00041945 lncRNA upstream 80508 14773736 ~ 14781192 (-) False XLOC_021009
TCONS_00042366 lncRNA upstream 81755 14774983 ~ 14786979 (-) False XLOC_021009
TCONS_00042367 lncRNA upstream 81755 14774983 ~ 14787062 (-) False XLOC_021009
TCONS_00041946 lncRNA upstream 89079 14782307 ~ 14785082 (-) False XLOC_021009
TCONS_00041306 mRNA downstream 217185 14363952 ~ 14475927 (-) False XLOC_021007
TCONS_00041305 mRNA downstream 325146 14363952 ~ 14367966 (-) False XLOC_021007
TCONS_00041304 mRNA downstream 332090 14350839 ~ 14361022 (-) True XLOC_021006
TCONS_00041303 mRNA downstream 346537 14338178 ~ 14346575 (-) True XLOC_021005
TCONS_00041302 mRNA downstream 383295 14304677 ~ 14309817 (-) True XLOC_021003
TCONS_00041311 mRNA upstream 315940 15009168 ~ 15010688 (-) True XLOC_021011
TCONS_00041312 mRNA upstream 558299 15251527 ~ 15280638 (-) True XLOC_021014
TCONS_00041313 mRNA upstream 691228 15384456 ~ 15385442 (-) True XLOC_021015
TCONS_00041314 mRNA upstream 735871 15429099 ~ 15437242 (-) True XLOC_021017
TCONS_00041315 mRNA upstream 858797 15552025 ~ 15562933 (-) True XLOC_021018
TCONS_00041297 other downstream 445870 14223121 ~ 14247242 (-) False XLOC_021000
TCONS_00041293 other downstream 604050 14088353 ~ 14089062 (-) True XLOC_020997
TCONS_00041290 other downstream 673390 14019604 ~ 14019722 (-) True XLOC_020996
TCONS_00041289 other downstream 747045 13945953 ~ 13946067 (-) True XLOC_020995
TCONS_00041286 other downstream 976710 13715455 ~ 13716402 (-) True XLOC_020993
TCONS_00041310 other upstream 71770 14764998 ~ 14773300 (-) False XLOC_021009
TCONS_00041327 other upstream 1005246 15698474 ~ 15699853 (-) False XLOC_021022
TCONS_00041329 other upstream 1012834 15706062 ~ 15717893 (-) False XLOC_021023
TCONS_00041332 other upstream 1088380 15781608 ~ 15781724 (-) True XLOC_021027
TCONS_00041333 other upstream 1088666 15781894 ~ 15782009 (-) True XLOC_021028