RNA id: TCONS_00042519



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00042519
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_021383
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 412542 ~ 412659 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TACcgcagccatatcaccctgctgcctaagagcggttactcactgaagctaagcagggctgaggctGGTCAGTGTCTGAATGAGAGACAAAAagaggaaagctaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000121248

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00042511 lncRNA upstream 99186 309117 ~ 313356 (+) False XLOC_021378
TCONS_00044763 lncRNA downstream 132604 545263 ~ 597603 (+) True XLOC_021385
TCONS_00042530 lncRNA downstream 620746 1033405 ~ 1042817 (+) True XLOC_021391
TCONS_00042533 lncRNA downstream 734503 1147162 ~ 1150348 (+) False XLOC_021393
TCONS_00042534 lncRNA downstream 734503 1147162 ~ 1152058 (+) True XLOC_021393
TCONS_00044764 lncRNA downstream 1225630 1638289 ~ 1638981 (+) True XLOC_021396
TCONS_00042517 mRNA upstream 5652 404975 ~ 406890 (+) True XLOC_021381
TCONS_00042516 mRNA upstream 15242 384850 ~ 397300 (+) True XLOC_021380
TCONS_00042515 mRNA upstream 18006 383782 ~ 394536 (+) False XLOC_021380
TCONS_00042513 mRNA upstream 44849 354418 ~ 367693 (+) False XLOC_021379
TCONS_00042514 mRNA upstream 44895 355021 ~ 367647 (+) True XLOC_021379
TCONS_00042521 mRNA downstream 140737 553396 ~ 567183 (+) True XLOC_021386
TCONS_00042522 mRNA downstream 165559 578218 ~ 588248 (+) True XLOC_021387
TCONS_00042523 mRNA downstream 167234 579893 ~ 676264 (+) True XLOC_021388
TCONS_00042524 mRNA downstream 229342 642001 ~ 653333 (+) False XLOC_021389
TCONS_00042525 mRNA downstream 229393 642052 ~ 646787 (+) False XLOC_021389
TCONS_00042509 other upstream 99223 309063 ~ 313319 (+) False XLOC_021378
TCONS_00042508 other upstream 163442 240604 ~ 249100 (+) True XLOC_021377
TCONS_00042520 other downstream 29578 442237 ~ 442352 (+) True XLOC_021384
TCONS_00042596 other downstream 3308382 3721041 ~ 3735009 (+) False XLOC_021425
TCONS_00042666 other downstream 5864516 6277175 ~ 6304274 (+) True XLOC_021459
TCONS_00042675 other downstream 6413029 6825688 ~ 6825802 (+) True XLOC_021466
TCONS_00042706 other downstream 8894915 9307574 ~ 9308561 (+) True XLOC_021488

Expression Profile


//