RNA id: TCONS_00042520



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00042520
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.55
exon number 1
gene id XLOC_021384
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 442237 ~ 442352 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TTCACAGCCATATTAACCAGCAACCCAAGAGCGCtccctcactgaagctaagcagggctgaggctggtcagtgtctggatgggagaccacacgggaacactaggctgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000178683

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00042511 lncRNA upstream 128881 309117 ~ 313356 (+) False XLOC_021378
TCONS_00044763 lncRNA downstream 102911 545263 ~ 597603 (+) True XLOC_021385
TCONS_00042530 lncRNA downstream 591053 1033405 ~ 1042817 (+) True XLOC_021391
TCONS_00042533 lncRNA downstream 704810 1147162 ~ 1150348 (+) False XLOC_021393
TCONS_00042534 lncRNA downstream 704810 1147162 ~ 1152058 (+) True XLOC_021393
TCONS_00044764 lncRNA downstream 1195937 1638289 ~ 1638981 (+) True XLOC_021396
TCONS_00042518 mRNA upstream 22796 409578 ~ 419441 (+) True XLOC_021382
TCONS_00042517 mRNA upstream 35347 404975 ~ 406890 (+) True XLOC_021381
TCONS_00042516 mRNA upstream 44937 384850 ~ 397300 (+) True XLOC_021380
TCONS_00042515 mRNA upstream 47701 383782 ~ 394536 (+) False XLOC_021380
TCONS_00042513 mRNA upstream 74544 354418 ~ 367693 (+) False XLOC_021379
TCONS_00042521 mRNA downstream 111044 553396 ~ 567183 (+) True XLOC_021386
TCONS_00042522 mRNA downstream 135866 578218 ~ 588248 (+) True XLOC_021387
TCONS_00042523 mRNA downstream 137541 579893 ~ 676264 (+) True XLOC_021388
TCONS_00042524 mRNA downstream 199649 642001 ~ 653333 (+) False XLOC_021389
TCONS_00042525 mRNA downstream 199700 642052 ~ 646787 (+) False XLOC_021389
TCONS_00042519 other upstream 29578 412542 ~ 412659 (+) True XLOC_021383
TCONS_00042509 other upstream 128918 309063 ~ 313319 (+) False XLOC_021378
TCONS_00042508 other upstream 193137 240604 ~ 249100 (+) True XLOC_021377
TCONS_00042596 other downstream 3278689 3721041 ~ 3735009 (+) False XLOC_021425
TCONS_00042666 other downstream 5834823 6277175 ~ 6304274 (+) True XLOC_021459
TCONS_00042675 other downstream 6383336 6825688 ~ 6825802 (+) True XLOC_021466
TCONS_00042706 other downstream 8865222 9307574 ~ 9308561 (+) True XLOC_021488
TCONS_00042716 other downstream 9175861 9618213 ~ 9618335 (+) True XLOC_021493

Expression Profile


//