RNA id: TCONS_00042835


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00042835
length 246
RNA type mRNA
GC content 0.43
exon number 13
gene id XLOC_021577
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 17437554 ~ 17465232 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CAGGAGAACAGACAGGGCATAAAActtaaagtgacatttaaaggtttaaccagaGACAACATATCAAGATTACCAGAAGCAGAAAACACCCGAAGAATCAAGCCTGGAGGGAGAGTCCCAGGACTCACAGCTGCTGCGCCTCTCTCTTCAGAATTTGAGTTGACATatatcagagaagaAATTAACATTttaagAAATGTACTCTCAGCTGCTGAGGCTTATGGGTCGAACTGGAAACGTAAGCTC

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000184282

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00044805 lncRNA upstream 16118 17412525 ~ 17421436 (+) False XLOC_021576
TCONS_00044668 lncRNA upstream 182797 17254498 ~ 17254757 (+) True XLOC_021573
TCONS_00044804 lncRNA upstream 226280 17146315 ~ 17211274 (+) False XLOC_021571
TCONS_00044803 lncRNA upstream 536318 16889209 ~ 16901236 (+) False XLOC_021567
TCONS_00042815 lncRNA upstream 538764 16889209 ~ 16898790 (+) False XLOC_021567
TCONS_00044806 lncRNA downstream 7887 17473119 ~ 17477448 (+) True XLOC_021578
TCONS_00042840 lncRNA downstream 77487 17542719 ~ 17546078 (+) False XLOC_021580
TCONS_00044807 lncRNA downstream 81880 17547112 ~ 17550653 (+) True XLOC_021580
TCONS_00042841 lncRNA downstream 191604 17656836 ~ 17659102 (+) True XLOC_021581
TCONS_00044808 lncRNA downstream 305192 17770424 ~ 17776345 (+) True XLOC_021582
TCONS_00042833 mRNA upstream 33543 17387325 ~ 17404011 (+) True XLOC_021575
TCONS_00042831 mRNA upstream 52305 17354154 ~ 17385249 (+) False XLOC_021574
TCONS_00042832 mRNA upstream 81941 17354951 ~ 17355613 (+) True XLOC_021574
TCONS_00042830 mRNA upstream 91299 17220986 ~ 17346255 (+) True XLOC_021572
TCONS_00042826 mRNA upstream 323462 17102960 ~ 17114092 (+) True XLOC_021570
TCONS_00042837 mRNA downstream 44562 17509794 ~ 17520775 (+) False XLOC_021580
TCONS_00042838 mRNA downstream 46805 17512037 ~ 17523384 (+) False XLOC_021580
TCONS_00042839 mRNA downstream 57635 17522867 ~ 17549145 (+) False XLOC_021580
TCONS_00042844 mRNA downstream 335485 17800717 ~ 17815253 (+) False XLOC_021585
TCONS_00042845 mRNA downstream 335607 17800839 ~ 17814778 (+) True XLOC_021585
TCONS_00042829 other upstream 225748 17187884 ~ 17211806 (+) True XLOC_021571
TCONS_00042828 other upstream 226280 17146561 ~ 17211274 (+) False XLOC_021571
TCONS_00042827 other upstream 290563 17146315 ~ 17146991 (+) False XLOC_021571
TCONS_00042824 other upstream 492113 16937629 ~ 16945441 (+) True XLOC_021568
TCONS_00042818 other upstream 536548 16898325 ~ 16901006 (+) False XLOC_021567
TCONS_00042836 other downstream 36082 17501314 ~ 17501428 (+) True XLOC_021579
TCONS_00042843 other downstream 318181 17783413 ~ 17783541 (+) True XLOC_021584
TCONS_00042853 other downstream 408294 17873526 ~ 17873598 (+) True XLOC_021588
TCONS_00042854 other downstream 408840 17874072 ~ 17874147 (+) True XLOC_021587
TCONS_00042869 other downstream 823842 18289074 ~ 18289201 (+) True XLOC_021598