RNA id: TCONS_00043158


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00043158
length 97
RNA type miRNA
GC content 0.45
exon number 1
gene id XLOC_021747
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 28536361 ~ 28536457 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GTGGACTGTGGGATGAGGTAGTAGTTTGTATAGTTTTAGGATCACACCAGATCTGGGAGATAACTATACAGTCTACTGTCTTTCCCACGGTTACCGC

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000118863

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00044838 lncRNA upstream 115777 28390669 ~ 28420584 (+) False XLOC_021745
TCONS_00044837 lncRNA upstream 115777 28390669 ~ 28420584 (+) False XLOC_021745
TCONS_00044839 lncRNA upstream 115777 28390685 ~ 28420584 (+) False XLOC_021745
TCONS_00044840 lncRNA upstream 115777 28390713 ~ 28420584 (+) False XLOC_021745
TCONS_00044841 lncRNA upstream 115777 28390765 ~ 28420584 (+) False XLOC_021745
TCONS_00043168 lncRNA downstream 233865 28770322 ~ 28773116 (+) True XLOC_021754
TCONS_00044676 lncRNA downstream 359318 28895775 ~ 28896080 (+) True XLOC_021758
TCONS_00043175 lncRNA downstream 407857 28944314 ~ 28960309 (+) False XLOC_021761
TCONS_00044843 lncRNA downstream 407991 28944448 ~ 28960309 (+) False XLOC_021761
TCONS_00044844 lncRNA downstream 417048 28953505 ~ 28960309 (+) True XLOC_021761
TCONS_00043157 mRNA upstream 3981 28494201 ~ 28532380 (+) True XLOC_021746
TCONS_00043146 mRNA upstream 147848 28377360 ~ 28388513 (+) False XLOC_021744
TCONS_00043151 mRNA upstream 147855 28378006 ~ 28388506 (+) False XLOC_021744
TCONS_00043152 mRNA upstream 148042 28378543 ~ 28388319 (+) False XLOC_021744
TCONS_00043149 mRNA upstream 148050 28377428 ~ 28388311 (+) False XLOC_021744
TCONS_00043160 mRNA downstream 46408 28582865 ~ 28681775 (+) False XLOC_021749
TCONS_00043162 mRNA downstream 112407 28648864 ~ 28681775 (+) True XLOC_021749
TCONS_00043163 mRNA downstream 156821 28693278 ~ 28713982 (+) True XLOC_021751
TCONS_00043164 mRNA downstream 182406 28718863 ~ 28727106 (+) True XLOC_021752
TCONS_00043165 mRNA downstream 194922 28731379 ~ 28732313 (+) True XLOC_021753
TCONS_00043142 other upstream 210520 28323080 ~ 28325841 (+) False XLOC_021743
TCONS_00043140 other upstream 387408 28140317 ~ 28148953 (+) True XLOC_021742
TCONS_00043115 other upstream 1532380 26979174 ~ 27003981 (+) False XLOC_021726
TCONS_00043112 other upstream 1607503 26928743 ~ 26928858 (+) True XLOC_021724
TCONS_00043098 other upstream 2541220 25995027 ~ 25995141 (+) True XLOC_021714
TCONS_00043159 other downstream 208 28536665 ~ 28536778 (+) True XLOC_021748
TCONS_00043161 other downstream 78370 28614827 ~ 28614942 (+) True XLOC_021750
TCONS_00043169 other downstream 260969 28797426 ~ 28797548 (+) True XLOC_021755
TCONS_00043170 other downstream 263646 28800103 ~ 28800219 (+) True XLOC_021756
TCONS_00043173 other downstream 366873 28903330 ~ 28903456 (+) True XLOC_021759