RNA id: TCONS_00043192



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00043192
length 362
RNA type mRNA
GC content 0.49
exon number 3
gene id XLOC_021770
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 29908348 ~ 29938201 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ATGGCGGAGACCAAAATTATATACCATATCGACGAAGAAGAAACCCCTTATTTAGTGAAGCTGTCGGTTTCTCCGGAAAAAGTCACGTTGGCGGATTTTAAAAATGTCCTCAACAACCGACCGGTCAACAGTTATAAATTCTTTTTCAAGTCTATGGATCAGGATTTCGGAGTCGTCAAAGAAGAAATCTCCGACGATAATGCCAAGCTGCCCTGCTTCAACGGCAGAGTGGTGGCCTGGTTGGTGTTGGCTGAAGGCACACACTCGGATGGGGGATCTCAGTGCACAGAGAGCCACAAAGAGCTGCTGCCCCCCTTGGAGAGAACCGGAGGGATTGGAGATTCCAGACCCCCCTCTTTCCA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000150174

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00044848 lncRNA upstream 61469 29840859 ~ 29846879 (+) True XLOC_021767
TCONS_00044847 lncRNA upstream 325069 29580543 ~ 29583279 (+) True XLOC_021765
TCONS_00043183 lncRNA upstream 333994 29572078 ~ 29574354 (+) True XLOC_021764
TCONS_00044846 lncRNA upstream 506252 29396181 ~ 29402096 (+) True XLOC_021763
TCONS_00044845 lncRNA upstream 547483 29358666 ~ 29360865 (+) True XLOC_021762
TCONS_00043195 lncRNA downstream 68005 30006206 ~ 30009399 (+) False XLOC_021772
TCONS_00043197 lncRNA downstream 68005 30006206 ~ 30010042 (+) False XLOC_021772
TCONS_00043198 lncRNA downstream 68035 30006236 ~ 30009190 (+) True XLOC_021772
TCONS_00044849 lncRNA downstream 464113 30402314 ~ 30433385 (+) True XLOC_021774
TCONS_00043203 lncRNA downstream 826086 30764287 ~ 30772886 (+) True XLOC_021777
TCONS_00043190 mRNA upstream 2185 29889129 ~ 29906163 (+) True XLOC_021769
TCONS_00043189 mRNA upstream 13090 29889089 ~ 29895258 (+) False XLOC_021769
TCONS_00043188 mRNA upstream 19555 29885019 ~ 29888793 (+) True XLOC_021768
TCONS_00043186 mRNA upstream 20870 29883216 ~ 29887478 (+) False XLOC_021768
TCONS_00043193 mRNA downstream 28265 29966466 ~ 29992458 (+) False XLOC_021771
TCONS_00043194 mRNA downstream 35736 29973937 ~ 29992458 (+) True XLOC_021771
TCONS_00043196 mRNA downstream 68005 30006206 ~ 30009773 (+) False XLOC_021772
TCONS_00043199 mRNA downstream 110648 30048849 ~ 30055719 (+) True XLOC_021773
TCONS_00043200 mRNA downstream 769636 30707837 ~ 30724909 (+) True XLOC_021775
TCONS_00043184 other upstream 319790 29588444 ~ 29588558 (+) True XLOC_021766
TCONS_00043178 other upstream 545503 29357790 ~ 29362845 (+) False XLOC_021762
TCONS_00043179 other upstream 545815 29357952 ~ 29362533 (+) False XLOC_021762
TCONS_00043174 other upstream 982308 28925923 ~ 28926040 (+) True XLOC_021760
TCONS_00043173 other upstream 1004892 28903330 ~ 28903456 (+) True XLOC_021759
TCONS_00043209 other downstream 1041184 30979385 ~ 30979499 (+) True XLOC_021782
TCONS_00043219 other downstream 1495072 31433273 ~ 31433348 (+) True XLOC_021790
TCONS_00043220 other downstream 1495378 31433579 ~ 31433663 (+) True XLOC_021791
TCONS_00043223 other downstream 1729228 31667429 ~ 31667543 (+) True XLOC_021793
TCONS_00043229 other downstream 1995474 31933675 ~ 31940874 (+) True XLOC_021797

Expression Profile


//