RNA id: TCONS_00043264


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00043264
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_021816
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 33119010 ~ 33119124 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

gccagcagctagctctctacaactctcacatggccgcctattgaagctaagcagggctgcacctggtcagtacctggatgagagaccacatggtaAAGCTAGGATGtagttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000182540

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00044856 lncRNA upstream 539576 32577050 ~ 32579434 (+) True XLOC_021815
TCONS_00044677 lncRNA upstream 556196 32562610 ~ 32562814 (+) True XLOC_021814
TCONS_00044855 lncRNA upstream 631284 32480330 ~ 32487726 (+) True XLOC_021812
TCONS_00044854 lncRNA upstream 700186 32392493 ~ 32418824 (+) False XLOC_021809
TCONS_00043257 lncRNA upstream 709083 32406356 ~ 32409927 (+) False XLOC_021810
TCONS_00044857 lncRNA downstream 336439 33455563 ~ 33459265 (+) True XLOC_021820
TCONS_00043283 lncRNA downstream 859587 33978711 ~ 33983432 (+) True XLOC_021831
TCONS_00043285 lncRNA downstream 868331 33987455 ~ 33991280 (+) False XLOC_021832
TCONS_00043291 lncRNA downstream 920270 34039394 ~ 34043302 (+) True XLOC_021834
TCONS_00044859 lncRNA downstream 928292 34047416 ~ 34185014 (+) False XLOC_021835
TCONS_00043263 mRNA upstream 586398 32499916 ~ 32532612 (+) True XLOC_021813
TCONS_00043262 mRNA upstream 684077 32426954 ~ 32434933 (+) True XLOC_021811
TCONS_00043261 mRNA upstream 688892 32426954 ~ 32430118 (+) False XLOC_021811
TCONS_00043255 mRNA upstream 695662 32392612 ~ 32423348 (+) False XLOC_021809
TCONS_00043254 mRNA upstream 695662 32392612 ~ 32423348 (+) False XLOC_021809
TCONS_00043267 mRNA downstream 177464 33296588 ~ 33309622 (+) True XLOC_021818
TCONS_00043269 mRNA downstream 264459 33383583 ~ 33444055 (+) False XLOC_021819
TCONS_00043270 mRNA downstream 294680 33413804 ~ 33444055 (+) True XLOC_021819
TCONS_00043272 mRNA downstream 599478 33718602 ~ 33729552 (+) True XLOC_021822
TCONS_00043273 mRNA downstream 633151 33752275 ~ 33757742 (+) True XLOC_021823
TCONS_00043260 other upstream 697260 32412534 ~ 32421750 (+) True XLOC_021809
TCONS_00043259 other upstream 709083 32407195 ~ 32409927 (+) True XLOC_021810
TCONS_00043247 other upstream 1011529 32101211 ~ 32107481 (+) False XLOC_021804
TCONS_00043240 other upstream 1080791 32032765 ~ 32038219 (+) False XLOC_021802
TCONS_00043229 other upstream 1178136 31933675 ~ 31940874 (+) True XLOC_021797
TCONS_00043265 other downstream 171149 33290273 ~ 33290361 (+) True XLOC_021817
TCONS_00043266 other downstream 175509 33294633 ~ 33309585 (+) False XLOC_021818
TCONS_00043268 other downstream 262030 33381154 ~ 33420840 (+) False XLOC_021819
TCONS_00043271 other downstream 418927 33538051 ~ 33538169 (+) True XLOC_021821
TCONS_00043274 other downstream 640623 33759747 ~ 33760665 (+) True XLOC_021824