RNA id: TCONS_00043278


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00043278
length 313
RNA type mRNA
GC content 0.46
exon number 2
gene id XLOC_021828
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 33934228 ~ 33953106 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

gtttttttttctgtggaagaCTCTCGGACAGGAGGTTGAGATACAGCACAAATAAATTAGCATTCGACAATTACAACGGAATATGGAGTCCGTACACTGCAACTGGAGGAATGTATCACGAGCTAATCAGATCTCTAAAAGATCAAGACCCATGTCCGAAACCTTATCCAAACTGGCTCAGCTCATCACCTGCATGGAGTACAAACCAAAATCACAAACGTCTTCCTCCATCTGCAAGGACGCCAGCCAGAAACCCTCCGAAATGAACGCTCTTGTGCGTCACCAGCAAAAAGAGCGCACCCTGCAAAAACTC

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000134237

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00044857 lncRNA upstream 474963 33455563 ~ 33459265 (+) True XLOC_021820
TCONS_00044856 lncRNA upstream 1354794 32577050 ~ 32579434 (+) True XLOC_021815
TCONS_00044677 lncRNA upstream 1371414 32562610 ~ 32562814 (+) True XLOC_021814
TCONS_00044855 lncRNA upstream 1446502 32480330 ~ 32487726 (+) True XLOC_021812
TCONS_00043257 lncRNA upstream 1524301 32406356 ~ 32409927 (+) False XLOC_021810
TCONS_00043283 lncRNA downstream 26880 33978711 ~ 33983432 (+) True XLOC_021831
TCONS_00043285 lncRNA downstream 35624 33987455 ~ 33991280 (+) False XLOC_021832
TCONS_00043291 lncRNA downstream 87563 34039394 ~ 34043302 (+) True XLOC_021834
TCONS_00044859 lncRNA downstream 95585 34047416 ~ 34185014 (+) False XLOC_021835
TCONS_00044858 lncRNA downstream 95585 34047416 ~ 34185014 (+) False XLOC_021835
TCONS_00043277 mRNA upstream 5912 33907899 ~ 33928316 (+) True XLOC_021827
TCONS_00043275 mRNA upstream 32891 33777519 ~ 33901337 (+) True XLOC_021825
TCONS_00043273 mRNA upstream 176486 33752275 ~ 33757742 (+) True XLOC_021823
TCONS_00043272 mRNA upstream 204676 33718602 ~ 33729552 (+) True XLOC_021822
TCONS_00043269 mRNA upstream 490173 33383583 ~ 33444055 (+) False XLOC_021819
TCONS_00043280 mRNA downstream 5519 33957350 ~ 33961989 (+) True XLOC_021829
TCONS_00043281 mRNA downstream 11788 33963619 ~ 33975156 (+) False XLOC_021830
TCONS_00043282 mRNA downstream 11816 33963647 ~ 33976116 (+) True XLOC_021830
TCONS_00043284 mRNA downstream 35551 33987382 ~ 34005296 (+) False XLOC_021832
TCONS_00043286 mRNA downstream 39678 33991509 ~ 34005304 (+) False XLOC_021832
TCONS_00043276 other upstream 104038 33828665 ~ 33830190 (+) True XLOC_021826
TCONS_00043274 other upstream 173563 33759747 ~ 33760665 (+) True XLOC_021824
TCONS_00043271 other upstream 396059 33538051 ~ 33538169 (+) True XLOC_021821
TCONS_00043268 other upstream 513388 33381154 ~ 33420840 (+) False XLOC_021819
TCONS_00043266 other upstream 624643 33294633 ~ 33309585 (+) False XLOC_021818
TCONS_00043288 other downstream 50926 34002757 ~ 34002873 (+) True XLOC_021833
TCONS_00043293 other downstream 95585 34047416 ~ 34053709 (+) False XLOC_021835
TCONS_00043296 other downstream 95732 34047563 ~ 34185009 (+) False XLOC_021835
TCONS_00043297 other downstream 101675 34053506 ~ 34185014 (+) True XLOC_021835
TCONS_00043302 other downstream 1450866 35402697 ~ 35461009 (+) False XLOC_021842

Expression Profile

//