RNA id: TCONS_00043358



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00043358
length 110
RNA type miRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_021884
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 36790223 ~ 36790332 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GTGCCTTGCTCAAGGGTCTCACCTCTGCCATGGTATTGAAGGTGGTAGAGAGTGTTTGTACATTCACTCACACCTACAATCCCTGGCAGTACTGAGACTCAAACCTGCAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000119619

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00044684 lncRNA upstream 204472 36585179 ~ 36585751 (+) True XLOC_021878
TCONS_00044683 lncRNA upstream 318388 36460041 ~ 36471835 (+) False XLOC_021876
TCONS_00044682 lncRNA upstream 323780 36458347 ~ 36466443 (+) False XLOC_021876
TCONS_00043349 lncRNA upstream 369945 36418138 ~ 36420278 (+) False XLOC_021875
TCONS_00044876 lncRNA downstream 52300 36842632 ~ 36845980 (+) True XLOC_021885
TCONS_00043359 lncRNA downstream 101397 36891729 ~ 36895369 (+) True XLOC_021886
TCONS_00044877 lncRNA downstream 236018 37026350 ~ 37038409 (+) True XLOC_021887
TCONS_00044685 lncRNA downstream 322955 37113287 ~ 37118114 (+) True XLOC_021889
TCONS_00044878 lncRNA downstream 436849 37227181 ~ 37277704 (+) False XLOC_021891
TCONS_00043356 mRNA upstream 39922 36730713 ~ 36750301 (+) True XLOC_021882
TCONS_00043355 mRNA upstream 134583 36653376 ~ 36655640 (+) True XLOC_021881
TCONS_00043354 mRNA upstream 145088 36616717 ~ 36645135 (+) True XLOC_021880
TCONS_00043353 mRNA upstream 184386 36601984 ~ 36605837 (+) True XLOC_021879
TCONS_00043351 mRNA upstream 301594 36460239 ~ 36488629 (+) True XLOC_021876
TCONS_00043360 mRNA downstream 295827 37086159 ~ 37090181 (+) False XLOC_021888
TCONS_00043362 mRNA downstream 300557 37090889 ~ 37094205 (+) True XLOC_021888
TCONS_00043363 mRNA downstream 394915 37185247 ~ 37198890 (+) True XLOC_021890
TCONS_00043365 mRNA downstream 533630 37323962 ~ 37325961 (+) True XLOC_021893
TCONS_00043369 mRNA downstream 654601 37444933 ~ 37453984 (+) True XLOC_021895
TCONS_00043352 other upstream 298989 36491114 ~ 36491234 (+) True XLOC_021877
TCONS_00043345 other upstream 479805 36307661 ~ 36310418 (+) False XLOC_021870
TCONS_00043339 other upstream 660131 36130001 ~ 36130092 (+) True XLOC_021866
TCONS_00043331 other upstream 702027 36088091 ~ 36088196 (+) True XLOC_021861
TCONS_00043305 other upstream 1320364 35426577 ~ 35469859 (+) False XLOC_021842
TCONS_00043361 other downstream 295833 37086165 ~ 37093123 (+) False XLOC_021888
TCONS_00043368 other downstream 648502 37438834 ~ 37438950 (+) True XLOC_021894
TCONS_00043373 other downstream 702403 37492735 ~ 37492851 (+) True XLOC_021899
TCONS_00043375 other downstream 948531 37738863 ~ 37798412 (+) False XLOC_021904
TCONS_00043376 other downstream 960002 37750334 ~ 37768156 (+) True XLOC_021904

Expression Profile


//