RNA id: TCONS_00043359



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00043359
length 410
lncRNA type antisense
GC content 0.43
exon number 2
gene id XLOC_021886
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 36891729 ~ 36895369 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


CTTCTCCGCTTCAGCTTCTCCGGATTGTGGGATGCCATGTGGGAAAACTCTCGGAAAATATCCAGGGTATTTCTACTGTCTGGTAACCATGACAACAGTTGGAACTTCGCAGGGGACAAAAGGGGTTGCTCTGAACGCTCTGCCAAACTGTGCGAGTTTCTCATGCCTGATTTACAATGAAGAGACTGTCCCGTCAGCCCGCAGGCACTCATGCAGAAGAGCCGTTTAAAGAGATATTCACTTTTACATGGAGATGTGTTTTGTGAAACAGCTGTACTTCTTTTGTCAacactgtacatatatacatacagttgaagtcagaattattggcccccctgaattattagtcccctgtttgtttatttttttcccaatttctgttaaacagagaggaGATGTTtataatacat

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000156231

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00044876 lncRNA upstream 45749 36842632 ~ 36845980 (+) True XLOC_021885
TCONS_00044684 lncRNA upstream 305978 36585179 ~ 36585751 (+) True XLOC_021878
TCONS_00044683 lncRNA upstream 419894 36460041 ~ 36471835 (+) False XLOC_021876
TCONS_00044682 lncRNA upstream 425286 36458347 ~ 36466443 (+) False XLOC_021876
TCONS_00044875 lncRNA upstream 471451 36418149 ~ 36420278 (+) False XLOC_021875
TCONS_00044877 lncRNA downstream 130981 37026350 ~ 37038409 (+) True XLOC_021887
TCONS_00044685 lncRNA downstream 217918 37113287 ~ 37118114 (+) True XLOC_021889
TCONS_00044878 lncRNA downstream 331812 37227181 ~ 37277704 (+) False XLOC_021891
TCONS_00043364 lncRNA downstream 331837 37227206 ~ 37433229 (+) False XLOC_021891
TCONS_00044879 lncRNA downstream 331849 37227218 ~ 37297945 (+) False XLOC_021891
TCONS_00043357 mRNA upstream 93109 36771593 ~ 36798620 (+) True XLOC_021883
TCONS_00043356 mRNA upstream 141428 36730713 ~ 36750301 (+) True XLOC_021882
TCONS_00043355 mRNA upstream 236089 36653376 ~ 36655640 (+) True XLOC_021881
TCONS_00043354 mRNA upstream 246594 36616717 ~ 36645135 (+) True XLOC_021880
TCONS_00043353 mRNA upstream 285892 36601984 ~ 36605837 (+) True XLOC_021879
TCONS_00043360 mRNA downstream 190790 37086159 ~ 37090181 (+) False XLOC_021888
TCONS_00043362 mRNA downstream 195520 37090889 ~ 37094205 (+) True XLOC_021888
TCONS_00043363 mRNA downstream 289878 37185247 ~ 37198890 (+) True XLOC_021890
TCONS_00043365 mRNA downstream 428593 37323962 ~ 37325961 (+) True XLOC_021893
TCONS_00043369 mRNA downstream 549564 37444933 ~ 37453984 (+) True XLOC_021895
TCONS_00043358 other upstream 101397 36790223 ~ 36790332 (+) True XLOC_021884
TCONS_00043352 other upstream 400495 36491114 ~ 36491234 (+) True XLOC_021877
TCONS_00043345 other upstream 581311 36307661 ~ 36310418 (+) False XLOC_021870
TCONS_00043339 other upstream 761637 36130001 ~ 36130092 (+) True XLOC_021866
TCONS_00043331 other upstream 803533 36088091 ~ 36088196 (+) True XLOC_021861
TCONS_00043361 other downstream 190796 37086165 ~ 37093123 (+) False XLOC_021888
TCONS_00043368 other downstream 543465 37438834 ~ 37438950 (+) True XLOC_021894
TCONS_00043373 other downstream 597366 37492735 ~ 37492851 (+) True XLOC_021899
TCONS_00043375 other downstream 843494 37738863 ~ 37798412 (+) False XLOC_021904
TCONS_00043376 other downstream 854965 37750334 ~ 37768156 (+) True XLOC_021904

Expression Profile


//