RNA id: TCONS_00046142



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00046142
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_023326
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007135.7
NCBI id CM002908.2
chromosome length 42172926
location 11048446 ~ 11048560 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GCTGACAGATAGcattctgcaactctcacatggtcactcactgaagctgagcagggctgcacctggtcagtacctggataggagaccatatgggaaagctaggttgctgccagaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000186862

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00046847 lncRNA downstream 548544 10497369 ~ 10499902 (-) True XLOC_023320
TCONS_00047159 lncRNA downstream 772788 10269856 ~ 10275658 (-) True XLOC_023318
TCONS_00046846 lncRNA downstream 1051968 9995132 ~ 9996478 (-) True XLOC_023313
TCONS_00047158 lncRNA downstream 1064647 9982279 ~ 9983799 (-) False XLOC_023312
TCONS_00046845 lncRNA downstream 1070443 9976629 ~ 9978003 (-) False XLOC_023312
TCONS_00046143 lncRNA upstream 300 11048860 ~ 11051340 (-) True XLOC_023322
TCONS_00046848 lncRNA upstream 825777 11874337 ~ 11875212 (-) False XLOC_023335
TCONS_00047160 lncRNA upstream 825790 11874350 ~ 11874811 (-) True XLOC_023335
TCONS_00046160 lncRNA upstream 1079945 12128505 ~ 12129456 (-) True XLOC_023337
TCONS_00047161 lncRNA upstream 1547978 12596538 ~ 12601729 (-) True XLOC_023339
TCONS_00046138 mRNA downstream 128858 10907287 ~ 10919588 (-) False XLOC_023322
TCONS_00046139 mRNA downstream 131203 10907296 ~ 10917243 (-) False XLOC_023322
TCONS_00046128 mRNA downstream 150889 10792773 ~ 10897557 (-) False XLOC_023321
TCONS_00046144 mRNA upstream 9591 11058151 ~ 11068280 (-) False XLOC_023327
TCONS_00046145 mRNA upstream 9591 11058151 ~ 11069237 (-) True XLOC_023327
TCONS_00046146 mRNA upstream 21550 11070110 ~ 11076400 (-) True XLOC_023328
TCONS_00046147 mRNA upstream 63553 11112113 ~ 11325849 (-) False XLOC_023329
TCONS_00046148 mRNA upstream 75973 11124533 ~ 11127493 (-) False XLOC_023329
TCONS_00046141 other downstream 36895 11011436 ~ 11011551 (-) True XLOC_023325
TCONS_00046140 other downstream 100301 10948064 ~ 10948145 (-) True XLOC_023324
TCONS_00046137 other downstream 143160 10905172 ~ 10905286 (-) True XLOC_023323
TCONS_00046123 other downstream 671445 10349147 ~ 10377001 (-) False XLOC_023319
TCONS_00046122 other downstream 792416 10255914 ~ 10256030 (-) True XLOC_023317
TCONS_00046151 other upstream 363262 11411822 ~ 11411941 (-) True XLOC_023331
TCONS_00046161 other upstream 1106547 12155107 ~ 12156644 (-) True XLOC_023338
TCONS_00046184 other upstream 2561038 13609598 ~ 13609714 (-) True XLOC_023354
TCONS_00046187 other upstream 3485282 14533842 ~ 14536411 (-) True XLOC_023357
TCONS_00046200 other upstream 4165311 15213871 ~ 15213985 (-) True XLOC_023362

Expression Profile


//