RNA id: TCONS_00046386


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00046386
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.63
exon number 1
gene id XLOC_023450
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007135.7
NCBI id CM002908.2
chromosome length 42172926
location 23273242 ~ 23273359 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CTCGGCAGCAGCTAGCGCTGTGCAGCTCTCACACGGTCGTCCACTGAAGgcaagcagggctgcgcccggtcagttcctggatgggagaccacatggggaaGCTAGGTTGTTGCCGGAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000120189

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00047187 lncRNA downstream 55212 23145747 ~ 23218030 (-) False XLOC_023448
TCONS_00047182 lncRNA downstream 55223 22879860 ~ 23218019 (-) False XLOC_023448
TCONS_00047184 lncRNA downstream 55223 23024776 ~ 23218019 (-) False XLOC_023448
TCONS_00047186 lncRNA downstream 79569 23113605 ~ 23193673 (-) False XLOC_023448
TCONS_00047181 lncRNA downstream 79579 22879860 ~ 23193663 (-) False XLOC_023448
TCONS_00047188 lncRNA upstream 109753 23383112 ~ 23632901 (-) False XLOC_023451
TCONS_00047189 lncRNA upstream 193075 23466434 ~ 23642626 (-) False XLOC_023451
TCONS_00047190 lncRNA upstream 228585 23501944 ~ 23642626 (-) False XLOC_023451
TCONS_00047191 lncRNA upstream 316116 23589475 ~ 23642626 (-) False XLOC_023451
TCONS_00046387 lncRNA upstream 316386 23589745 ~ 23633052 (-) False XLOC_023451
TCONS_00046375 mRNA downstream 516676 22741533 ~ 22756566 (-) False XLOC_023447
TCONS_00046374 mRNA downstream 516734 22740543 ~ 22756508 (-) False XLOC_023447
TCONS_00046368 mRNA downstream 571225 22118804 ~ 22702017 (-) False XLOC_023444
TCONS_00046369 mRNA downstream 739283 22122237 ~ 22533959 (-) False XLOC_023444
TCONS_00046364 mRNA downstream 1169657 22070290 ~ 22103585 (-) False XLOC_023443
TCONS_00046390 mRNA upstream 373285 23646644 ~ 23671709 (-) False XLOC_023452
TCONS_00046391 mRNA upstream 374427 23647786 ~ 23671383 (-) False XLOC_023452
TCONS_00046392 mRNA upstream 374427 23647786 ~ 23675446 (-) True XLOC_023452
TCONS_00046394 mRNA upstream 414051 23687410 ~ 23716097 (-) False XLOC_023453
TCONS_00046393 mRNA upstream 414051 23687410 ~ 23716097 (-) True XLOC_023453
TCONS_00046372 other downstream 901142 22371986 ~ 22372100 (-) True XLOC_023446
TCONS_00046371 other downstream 964184 22308944 ~ 22309058 (-) True XLOC_023445
TCONS_00046365 other downstream 1175479 22071221 ~ 22097763 (-) True XLOC_023443
TCONS_00046358 other downstream 1305126 21964050 ~ 21968116 (-) False XLOC_023436
TCONS_00046357 other downstream 1310074 21963052 ~ 21963168 (-) True XLOC_023437
TCONS_00046400 other upstream 697697 23971056 ~ 23977285 (-) False XLOC_023458
TCONS_00046409 other upstream 829362 24102721 ~ 24118395 (-) False XLOC_023462
TCONS_00046414 other upstream 862543 24135902 ~ 24163110 (-) False XLOC_023462
TCONS_00046415 other upstream 862569 24135928 ~ 24146875 (-) True XLOC_023462
TCONS_00046441 other upstream 1734958 25008317 ~ 25024023 (-) False XLOC_023476