RNA id: TU1632249


Basic Information

Item Value
RNA id TU1632249
length 11349
lncRNA type antisense_over
GC content 0.43
exon number 5
gene id G1425681
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048581.1
NCBI id CM023235.2
chromosome length 95212422
location 18754565 ~ 18826674 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome
species rainbow trout
(Oncorhynchus mykiss)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU1632254 lncRNA downstream 290 18754565 ~ 18757825 (-) False G1425681
TU1632263 lncRNA downstream 8147 18743773 ~ 18749968 (-) True G1425685
TU1632258 lncRNA downstream 15422 18741816 ~ 18742693 (-) True G1425682
TU1632270 lncRNA downstream 55627 18701919 ~ 18702488 (-) True G1425692
TU1632246 lncRNA downstream 73857 18684039 ~ 18684258 (-) True G1425680
TU1632314 lncRNA upstream 58690 18829178 ~ 18829677 (-) True G1425731
TU1632316 lncRNA upstream 60622 18831110 ~ 18831329 (-) True G1425733
TU1632321 lncRNA upstream 67262 18837750 ~ 18838044 (-) False G1425738
TU1632322 lncRNA upstream 67262 18837750 ~ 18838044 (-) True G1425738
TU1632323 lncRNA upstream 68563 18839051 ~ 18839311 (-) True G1425739
XM_036949208.1 mRNA downstream 36198 18720958 ~ 18721917 (-) True LOC118940349
XM_036949209.1 mRNA downstream 41654 18713229 ~ 18716461 (-) False LOC110485574
XM_036949204.1 mRNA downstream 50989 18564334 ~ 18707126 (-) True LOC118940348
XM_036948345.1 mRNA downstream 263995 18361725 ~ 18494120 (-) False LOC110487190
XM_036949203.1 mRNA downstream 411607 18327660 ~ 18346508 (-) True LOC110511293
XM_036949219.1 mRNA upstream 178967 18949455 ~ 18980894 (-) True LOC110514184
XM_036949221.1 mRNA upstream 258590 19029078 ~ 19032029 (-) False LOC110485553
XM_021556652.2 mRNA upstream 258590 19029078 ~ 19032742 (-) True LOC110485553
XM_036949220.1 mRNA upstream 265337 19035825 ~ 19050381 (-) True LOC118940350
XM_036949222.1 mRNA upstream 280237 19050725 ~ 19093965 (-) False LOC110485549
TU1632273 other downstream 41731 18713229 ~ 18716384 (-) True LOC110485574
TU1632214 other downstream 131074 18625756 ~ 18627041 (-) True G1425652
TU1631967 other downstream 384413 18369450 ~ 18373702 (-) True LOC110487190
TU1631960 other downstream 394979 18359593 ~ 18363136 (-) False LOC110487190
TU1632337 other upstream 95702 18866190 ~ 18866932 (-) True G1425753
TU1632428 other upstream 283386 19053874 ~ 19061393 (-) True LOC110485549
TU1632630 other upstream 398892 19169380 ~ 19172677 (-) True G1425986
TU1633244 other upstream 1029221 19799709 ~ 19803564 (-) False G1426504
TU1633235 other upstream 1031340 19801828 ~ 19803564 (-) False G1426504

Expression Profile