RNA id: TCONS_00046765



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00046765
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.57
exon number 1
gene id XLOC_023717
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007135.7
NCBI id CM002908.2
chromosome length 42172926
location 41254874 ~ 41254989 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GACACAGCCGTATCCCCCAGCAGCCCAGCACCAGTCCCTCACTGAAGATGAGCAGGGCTGAGCTTGTTCAGTGTCTGGATGAGAGagcacatgggaaaactaggctgctgttggca

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000176955

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00047272 lncRNA downstream 102797 41133265 ~ 41152077 (-) True XLOC_023714
TCONS_00047271 lncRNA downstream 344333 40908525 ~ 40910541 (-) True XLOC_023713
TCONS_00047270 lncRNA downstream 379381 40873941 ~ 40875493 (-) True XLOC_023711
TCONS_00046887 lncRNA downstream 440594 40811531 ~ 40814280 (-) True XLOC_023708
TCONS_00046886 lncRNA downstream 554278 40698087 ~ 40700596 (-) True XLOC_023703
TCONS_00047273 lncRNA upstream 79077 41334066 ~ 41334636 (-) True XLOC_023720
TCONS_00046888 lncRNA upstream 83317 41338306 ~ 41343046 (-) True XLOC_023721
TCONS_00046889 lncRNA upstream 152043 41407032 ~ 41414837 (-) True XLOC_023722
TCONS_00046890 lncRNA upstream 191559 41446548 ~ 41460124 (-) True XLOC_023723
TCONS_00047274 lncRNA upstream 668797 41923786 ~ 41927167 (-) True XLOC_023729
TCONS_00046763 mRNA downstream 34336 41179940 ~ 41220538 (-) True XLOC_023715
TCONS_00046762 mRNA downstream 59806 41167269 ~ 41195068 (-) False XLOC_023715
TCONS_00046761 mRNA downstream 74725 41167269 ~ 41180149 (-) False XLOC_023715
TCONS_00046760 mRNA downstream 353464 40876247 ~ 40901410 (-) True XLOC_023712
TCONS_00046759 mRNA downstream 394271 40855741 ~ 40860603 (-) True XLOC_023710
TCONS_00046766 mRNA upstream 50402 41305391 ~ 41312459 (-) True XLOC_023718
TCONS_00046767 mRNA upstream 61725 41316714 ~ 41320037 (-) True XLOC_023719
TCONS_00046768 mRNA upstream 211852 41466841 ~ 41478917 (-) True XLOC_023724
TCONS_00046769 mRNA upstream 299624 41554613 ~ 41657005 (-) True XLOC_023725
TCONS_00046770 mRNA upstream 423268 41678257 ~ 41679356 (-) True XLOC_023726
TCONS_00046749 other downstream 1369089 39811071 ~ 39885785 (-) True XLOC_023700
TCONS_00046744 other downstream 1527896 39726846 ~ 39726978 (-) True XLOC_023698
TCONS_00046739 other downstream 1621611 39627620 ~ 39633263 (-) True XLOC_023693
TCONS_00046718 other downstream 2806916 38446880 ~ 38447958 (-) True XLOC_023674
TCONS_00046717 other downstream 2857386 38396572 ~ 38397488 (-) True XLOC_023673
TCONS_00046772 other upstream 571717 41826706 ~ 41826822 (-) True XLOC_023728
TCONS_00046777 other upstream 886395 42141384 ~ 42150116 (-) False XLOC_023736
TCONS_00046778 other upstream 891524 42146513 ~ 42149186 (-) True XLOC_023736