RNA id: TCONS_00049224


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00049224
length 5658
lncRNA type antisense_over
GC content 0.34
exon number 2
gene id XLOC_024040
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007136.7
NCBI id CM002909.2
chromosome length 37502051
location 19356344 ~ 19362087 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00049222 lncRNA upstream 431953 18920543 ~ 18924391 (+) False XLOC_024031
TCONS_00049223 lncRNA upstream 431953 18920621 ~ 18924391 (+) False XLOC_024031
TCONS_00047686 lncRNA upstream 431953 18921825 ~ 18924391 (+) True XLOC_024031
TCONS_00047684 lncRNA upstream 470775 18884678 ~ 18885569 (+) True XLOC_024029
TCONS_00049221 lncRNA upstream 611315 18744021 ~ 18745029 (+) True XLOC_024027
TCONS_00049225 lncRNA downstream 81864 19443951 ~ 19445512 (+) True XLOC_024041
TCONS_00047713 lncRNA downstream 190239 19552326 ~ 19556276 (+) True XLOC_024044
TCONS_00047728 lncRNA downstream 372073 19734160 ~ 19739965 (+) False XLOC_024051
TCONS_00047734 lncRNA downstream 508785 19870872 ~ 19883530 (+) False XLOC_024054
TCONS_00049226 lncRNA downstream 624981 19987068 ~ 19987387 (+) False XLOC_024057
TCONS_00047703 mRNA upstream 9267 19238175 ~ 19347077 (+) False XLOC_024039
TCONS_00047702 mRNA upstream 9267 19238175 ~ 19347077 (+) False XLOC_024039
TCONS_00047704 mRNA upstream 9337 19238180 ~ 19347007 (+) True XLOC_024039
TCONS_00047701 mRNA upstream 150469 19201231 ~ 19205875 (+) True XLOC_024038
TCONS_00047698 mRNA upstream 164041 19149241 ~ 19192303 (+) False XLOC_024036
TCONS_00047705 mRNA downstream 123111 19485198 ~ 19521245 (+) False XLOC_024042
TCONS_00047706 mRNA downstream 127283 19489370 ~ 19520589 (+) False XLOC_024042
TCONS_00047708 mRNA downstream 160867 19522954 ~ 19536331 (+) False XLOC_024043
TCONS_00047709 mRNA downstream 161012 19523099 ~ 19537323 (+) False XLOC_024043
TCONS_00047710 mRNA downstream 167930 19530017 ~ 19535811 (+) True XLOC_024043
TCONS_00047695 other upstream 244536 19095302 ~ 19111808 (+) False XLOC_024035
TCONS_00047675 other upstream 867338 18482906 ~ 18489006 (+) True XLOC_024022
TCONS_00047672 other upstream 1258483 18097747 ~ 18097861 (+) True XLOC_024017
TCONS_00047663 other upstream 1477712 17862368 ~ 17878632 (+) False XLOC_024013
TCONS_00047656 other upstream 1747613 17605479 ~ 17608731 (+) True XLOC_024009
TCONS_00047707 other downstream 127463 19489550 ~ 19492620 (+) True XLOC_024042
TCONS_00047732 other downstream 412472 19774559 ~ 19774675 (+) True XLOC_024053
TCONS_00047755 other downstream 1230396 20592483 ~ 20592597 (+) True XLOC_024066
TCONS_00047756 other downstream 1241809 20603896 ~ 20604012 (+) True XLOC_024067
TCONS_00047785 other downstream 2863715 22225802 ~ 22238992 (+) True XLOC_024087

Expression Profile

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