RNA id: TCONS_00047732


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00047732
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.44
exon number 1
gene id XLOC_024053
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007136.7
NCBI id CM002909.2
chromosome length 37502051
location 19774559 ~ 19774675 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TCCAAAGCCATATCATCCTGGAGCCCAGGACTTCGTCACTCACTGAAGCTTAGTAGAATTAAGACTAGTCAgttcctggatgggagaccacatgtgaAAATtaagttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000174688

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00047728 lncRNA upstream 34594 19734160 ~ 19739965 (+) False XLOC_024051
TCONS_00047713 lncRNA upstream 218283 19552326 ~ 19556276 (+) True XLOC_024044
TCONS_00049225 lncRNA upstream 329047 19443951 ~ 19445512 (+) True XLOC_024041
TCONS_00049224 lncRNA upstream 412472 19356344 ~ 19362087 (+) True XLOC_024040
TCONS_00049222 lncRNA upstream 850168 18920543 ~ 18924391 (+) False XLOC_024031
TCONS_00047734 lncRNA downstream 96197 19870872 ~ 19883530 (+) False XLOC_024054
TCONS_00049226 lncRNA downstream 212393 19987068 ~ 19987387 (+) False XLOC_024057
TCONS_00049039 lncRNA downstream 212404 19987079 ~ 19997540 (+) False XLOC_024057
TCONS_00049040 lncRNA downstream 212404 19987079 ~ 19998226 (+) True XLOC_024057
TCONS_00049229 lncRNA downstream 328590 20103265 ~ 20109429 (+) False XLOC_024061
TCONS_00047729 mRNA upstream 22414 19739665 ~ 19752145 (+) True XLOC_024051
TCONS_00047727 mRNA upstream 34593 19734038 ~ 19739966 (+) False XLOC_024051
TCONS_00047726 mRNA upstream 35055 19733751 ~ 19739504 (+) False XLOC_024051
TCONS_00047724 mRNA upstream 35202 19733704 ~ 19739357 (+) False XLOC_024051
TCONS_00047725 mRNA upstream 37489 19733727 ~ 19737070 (+) False XLOC_024051
TCONS_00047733 mRNA downstream 95928 19870603 ~ 19936598 (+) False XLOC_024054
TCONS_00047735 mRNA downstream 138936 19913611 ~ 19924012 (+) True XLOC_024054
TCONS_00047736 mRNA downstream 172421 19947096 ~ 19951331 (+) False XLOC_024055
TCONS_00047737 mRNA downstream 172623 19947298 ~ 19948767 (+) True XLOC_024055
TCONS_00047738 mRNA downstream 179901 19954576 ~ 19958278 (+) False XLOC_024056
TCONS_00047707 other upstream 281939 19489550 ~ 19492620 (+) True XLOC_024042
TCONS_00047695 other upstream 662751 19095302 ~ 19111808 (+) False XLOC_024035
TCONS_00047675 other upstream 1285553 18482906 ~ 18489006 (+) True XLOC_024022
TCONS_00047672 other upstream 1676698 18097747 ~ 18097861 (+) True XLOC_024017
TCONS_00047663 other upstream 1895927 17862368 ~ 17878632 (+) False XLOC_024013
TCONS_00047755 other downstream 817808 20592483 ~ 20592597 (+) True XLOC_024066
TCONS_00047756 other downstream 829221 20603896 ~ 20604012 (+) True XLOC_024067
TCONS_00047785 other downstream 2451127 22225802 ~ 22238992 (+) True XLOC_024087
TCONS_00047798 other downstream 2812621 22587296 ~ 22594781 (+) False XLOC_024094
TCONS_00047805 other downstream 2955732 22730407 ~ 22849186 (+) False XLOC_024096