RNA id: TCONS_00047756


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00047756
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_024067
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007136.7
NCBI id CM002909.2
chromosome length 37502051
location 20603896 ~ 20604012 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

AtaagcagctagctctctgcaactttcacatggtcgcccactgaagctaagcaggactgagTACCTGGTCAGTAcatggatggaagaccacatgggaaaactaggttgctgttggta

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000179427

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00049229 lncRNA upstream 494467 20103265 ~ 20109429 (+) False XLOC_024061
TCONS_00049228 lncRNA upstream 494467 20103265 ~ 20109429 (+) False XLOC_024061
TCONS_00049227 lncRNA upstream 494467 20103265 ~ 20109429 (+) False XLOC_024061
TCONS_00049230 lncRNA upstream 494467 20103324 ~ 20109429 (+) True XLOC_024061
TCONS_00049040 lncRNA upstream 605670 19987079 ~ 19998226 (+) True XLOC_024057
TCONS_00047760 lncRNA downstream 112214 20716226 ~ 20716965 (+) True XLOC_024069
TCONS_00049231 lncRNA downstream 249188 20853200 ~ 20870875 (+) True XLOC_024070
TCONS_00049232 lncRNA downstream 355171 20959183 ~ 20959582 (+) True XLOC_024071
TCONS_00049233 lncRNA downstream 393667 20997679 ~ 20998615 (+) True XLOC_024072
TCONS_00049041 lncRNA downstream 488231 21092243 ~ 21092575 (+) True XLOC_024074
TCONS_00047754 mRNA upstream 248413 20272145 ~ 20355483 (+) True XLOC_024065
TCONS_00047752 mRNA upstream 377312 20215964 ~ 20226584 (+) False XLOC_024064
TCONS_00047753 mRNA upstream 377494 20216159 ~ 20226402 (+) True XLOC_024064
TCONS_00047750 mRNA upstream 392065 20140926 ~ 20211831 (+) False XLOC_024063
TCONS_00047757 mRNA downstream 90165 20694177 ~ 20701924 (+) True XLOC_024068
TCONS_00047758 mRNA downstream 111938 20715950 ~ 20726785 (+) False XLOC_024069
TCONS_00047759 mRNA downstream 112164 20716176 ~ 20726987 (+) False XLOC_024069
TCONS_00047761 mRNA downstream 442844 21046856 ~ 21061911 (+) False XLOC_024073
TCONS_00047762 mRNA downstream 450053 21054065 ~ 21057378 (+) True XLOC_024073
TCONS_00047755 other upstream 11299 20592483 ~ 20592597 (+) True XLOC_024066
TCONS_00047732 other upstream 829221 19774559 ~ 19774675 (+) True XLOC_024053
TCONS_00047707 other upstream 1111276 19489550 ~ 19492620 (+) True XLOC_024042
TCONS_00047695 other upstream 1492088 19095302 ~ 19111808 (+) False XLOC_024035
TCONS_00047675 other upstream 2114890 18482906 ~ 18489006 (+) True XLOC_024022
TCONS_00047785 other downstream 1621790 22225802 ~ 22238992 (+) True XLOC_024087
TCONS_00047798 other downstream 1983284 22587296 ~ 22594781 (+) False XLOC_024094
TCONS_00047805 other downstream 2126395 22730407 ~ 22849186 (+) False XLOC_024096
TCONS_00047842 other downstream 2942567 23546579 ~ 23546696 (+) True XLOC_024119
TCONS_00047848 other downstream 3447036 24051048 ~ 24052227 (+) True XLOC_024124