RNA id: TCONS_00047841


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00047841
length 186
RNA type mRNA
GC content 0.30
exon number 9
gene id XLOC_024118
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007136.7
NCBI id CM002909.2
chromosome length 37502051
location 23513713 ~ 23544998 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CTTACAGGAAGGAACTTGTCAAAAATTTTCAAATCAGGCGACGTAGTGGCACAGTACGATAATTTTTTGACAGCAATTAAAGTTAAGTTGTGCTCTGTCACAAGATGtaaattaaatatgtacacaaaacaaactaaaaaaaaaaagtcaaaacaaacaaaagcacaaacaaTTAAAAAGCTTGAT

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000183794

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00047835 lncRNA upstream 247781 23252369 ~ 23265932 (+) False XLOC_024113
TCONS_00047836 lncRNA upstream 247781 23252821 ~ 23265932 (+) False XLOC_024113
TCONS_00049046 lncRNA upstream 248084 23263655 ~ 23265629 (+) True XLOC_024113
TCONS_00049045 lncRNA upstream 251843 23251788 ~ 23261870 (+) False XLOC_024113
TCONS_00047834 lncRNA upstream 269302 23230158 ~ 23244411 (+) True XLOC_024112
TCONS_00049047 lncRNA downstream 170367 23715365 ~ 23717669 (+) False XLOC_024122
TCONS_00049048 lncRNA downstream 170813 23715811 ~ 23717433 (+) True XLOC_024122
TCONS_00049240 lncRNA downstream 588856 24133854 ~ 24271786 (+) True XLOC_024126
TCONS_00049049 lncRNA downstream 2006463 25551461 ~ 25554635 (+) False XLOC_024142
TCONS_00049241 lncRNA downstream 2006486 25551484 ~ 25554204 (+) True XLOC_024142
TCONS_00047840 mRNA upstream 18265 23489979 ~ 23495448 (+) True XLOC_024117
TCONS_00047839 mRNA upstream 62751 23358924 ~ 23450962 (+) True XLOC_024116
TCONS_00047838 mRNA upstream 166036 23336310 ~ 23347677 (+) True XLOC_024115
TCONS_00047837 mRNA upstream 217189 23280220 ~ 23296524 (+) True XLOC_024114
TCONS_00047808 mRNA upstream 658850 22853718 ~ 22854863 (+) True XLOC_024097
TCONS_00047843 mRNA downstream 46992 23591990 ~ 23644184 (+) False XLOC_024120
TCONS_00047844 mRNA downstream 46992 23591990 ~ 23645806 (+) True XLOC_024120
TCONS_00047845 mRNA downstream 157412 23702410 ~ 23707090 (+) False XLOC_024121
TCONS_00047846 mRNA downstream 157436 23702434 ~ 23706100 (+) True XLOC_024121
TCONS_00047847 mRNA downstream 232471 23777469 ~ 23815949 (+) True XLOC_024123
TCONS_00047805 other upstream 664527 22730407 ~ 22849186 (+) False XLOC_024096
TCONS_00047798 other upstream 918932 22587296 ~ 22594781 (+) False XLOC_024094
TCONS_00047785 other upstream 1274721 22225802 ~ 22238992 (+) True XLOC_024087
TCONS_00047756 other upstream 2909701 20603896 ~ 20604012 (+) True XLOC_024067
TCONS_00047755 other upstream 2921116 20592483 ~ 20592597 (+) True XLOC_024066
TCONS_00047842 other downstream 1581 23546579 ~ 23546696 (+) True XLOC_024119
TCONS_00047848 other downstream 506050 24051048 ~ 24052227 (+) True XLOC_024124
TCONS_00047852 other downstream 822978 24367976 ~ 24368090 (+) True XLOC_024129
TCONS_00047853 other downstream 1053778 24598776 ~ 24608014 (+) True XLOC_024128
TCONS_00047862 other downstream 1661627 25206625 ~ 25206753 (+) True XLOC_024136