RNA id: TU1791820


Basic Information

Item Value
RNA id TU1791820
length 11688
RNA type TUCP
GC content 0.42
exon number 2
gene id LOC110496591
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048582.1
NCBI id CM023236.2
chromosome length 74657750
location 57851179 ~ 57870361 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome
species rainbow trout
(Oncorhynchus mykiss)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU1791837 lncRNA upstream 1264 57846829 ~ 57849957 (+) True G1566217
TU1791768 lncRNA upstream 82085 57768386 ~ 57769136 (+) True G1566158
TU1791718 lncRNA upstream 195727 57655273 ~ 57655494 (+) True G1566109
TU1791622 lncRNA upstream 330354 57520038 ~ 57520867 (+) True G1566024
TU1791525 lncRNA upstream 409981 57439717 ~ 57441240 (+) True G1565938
TU1791892 lncRNA downstream 110358 57973404 ~ 57976373 (+) True G1566267
TU1791894 lncRNA downstream 118553 57981599 ~ 57981812 (+) True G1566269
TU1791904 lncRNA downstream 133929 57996975 ~ 57997466 (+) True G1566278
TU1791905 lncRNA downstream 135393 57998439 ~ 57999085 (+) True G1566279
TU1791910 lncRNA downstream 136216 57999262 ~ 57999524 (+) True G1566281
XM_036953377.1 mRNA upstream 90805 57744249 ~ 57760416 (+) False oxnad1
XM_036953378.1 mRNA upstream 90805 57744253 ~ 57760416 (+) False oxnad1
XM_036953379.1 mRNA upstream 90805 57745515 ~ 57760416 (+) False oxnad1
XM_036953380.1 mRNA upstream 90805 57745515 ~ 57760416 (+) True oxnad1
XM_021572568.2 mRNA upstream 108534 57729944 ~ 57742687 (+) True LOC110496589
XM_021572575.2 mRNA downstream 30808 57893854 ~ 57935297 (+) False LOC110496592
XM_021572574.2 mRNA downstream 30809 57893855 ~ 57935297 (+) False LOC110496592
XM_021572577.2 mRNA downstream 43840 57906886 ~ 57935297 (+) False LOC110496592
XM_036953387.1 mRNA downstream 202438 58065484 ~ 58140619 (+) True LOC110496868
XM_021572579.2 mRNA downstream 319431 58182477 ~ 58187784 (+) False LOC110496594
TU1791304 other upstream 739258 57109333 ~ 57111963 (+) False LOC110496571
TU1791310 other upstream 739381 57109128 ~ 57111840 (+) False LOC110496571
TU1791300 other upstream 739381 57109333 ~ 57111840 (+) False LOC110496571
TU1791219 other upstream 819258 57031621 ~ 57031963 (+) True G1565672
TU1790095 other upstream 1682018 56028938 ~ 56169203 (+) False LOC110496862
TU1791842 other downstream 53569 57916615 ~ 57920646 (+) True LOC110496592
TU1791846 other downstream 78051 57941097 ~ 57946763 (+) True G1566224
TU1792104 other downstream 501210 58364256 ~ 58377006 (+) True G1566445
TU1793356 other downstream 1007853 58870899 ~ 58873690 (+) True LOC110496618
TU1793432 other downstream 1094075 58957121 ~ 58958851 (+) True dlx5a

Expression Profile