RNA id: XM_036953556.1


Basic Information

Item Value
RNA id XM_036953556.1
length 1497
RNA type mRNA
GC content 0.72
exon number 4
gene id LOC118941204
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048582.1
NCBI id CM023236.2
chromosome length 74657750
location 66113617 ~ 66117779 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome
species rainbow trout
(Oncorhynchus mykiss)

Sequence

cctcctccacctccacctcctcctcctcctcctccctctcctcctcctcccgctccacctcctccccctcctcctcctccccctccacctcctccacctccacctcctcctccccctcctcctcctccacctcctcctcctcctccctctccacctcctcctccaccttctccacctcctccccctcctcctccctctcctcctccacctcctccacctcctccccctccccctcctccacctccccctcctccccccccccctcctcctcctcctcctcctcctcctcctcctcctccacctcctccccctcctccccctccccctcctcctcctccacctcctccccctcctcctccccctccccctcctcctcctcctcctccacctccttcccctccccctcctcctccacctcctccccctcctcctccacctccacctcctccccctcctcctccacctcctccccctccccctcctccacctccacctccaccttctccacctcctccccctcctccacctccacctcctccccctcctcctccctctcctcctccccctcctcctcctccacctcctccccctcctccacctcctcctccccctcctccccctccccctccacctcctccccctcctcctcctcctccccccccccctcctcctcctcctcctcctcctcctccacctcctccccctcctccccctccccctcctcctcctccacctcctccccctcctcctccccctccccctcctccccctcctcctcctcctcctccacctccttcccctccccctcctcctccacctcctccccctcctcctccacctccacctcctccccctcctcctccacctcctccccctccccctcctccacctccacctcctccccctcctcctcaccctcctccccctcctcctcctccacctccttcccctccccctcctcctccacctcctccccctcctcctcctcctcctccccctcctcctcctcctcctcctcctcctccccctccccctcctccccctcctcctcctcctcctccacctcctccccctcctccacctcctcctccccctcctcctcctcctcctccccctcctcctcctcctccctctccacctcctccccctccccctcctccccctcctccacctcctcctccccctccccctcctcctcctcctccacctcctccccctcctcctccccctccccctcctcccccttctcctcctccccctccccctcctcctcctcctcctccacctcctccccctcctcctccacctccttcccctcctcctcctccacctccacctcctccccctcctcctccacctcctccccctccccctcctcctcctcctcctccacctccacctcctccccctcctcctccccctcctcctccacctcctccccctcctcctcctcctcctccacctcctcctcctccctctccacctcctccccctccc

Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU1802632 lncRNA downstream 36222 66077196 ~ 66077395 (-) True G1575480
TU1802630 lncRNA downstream 37579 66075830 ~ 66076038 (-) True G1575478
TU1802622 lncRNA downstream 65201 66046470 ~ 66048416 (-) False G1575472
TU1802621 lncRNA downstream 65798 66046470 ~ 66047819 (-) False G1575472
TU1802663 lncRNA upstream 16102 66133881 ~ 66134171 (-) True G1575510
TU1802549 lncRNA upstream 17044 66134823 ~ 66135289 (-) True G1575413
TU1802548 lncRNA upstream 18929 66136708 ~ 66137973 (-) True LOC110496715
TU1802667 lncRNA upstream 34594 66152373 ~ 66152767 (-) True G1575514
TU1802545 lncRNA upstream 62617 66180396 ~ 66182213 (-) False LOC110496716
XR_005037534.1 mRNA downstream 19068 66080454 ~ 66094549 (-) True LOC118941206
XM_036953555.1 mRNA downstream 45521 66051635 ~ 66068096 (-) True LOC110496714
XM_036953554.1 mRNA downstream 45524 66051635 ~ 66068093 (-) False LOC110496714
XM_036953525.1 mRNA downstream 74146 65894984 ~ 66039471 (-) False epb41a
XM_036953562.1 mRNA upstream 19669 66137448 ~ 66167665 (-) False LOC110496715
XM_036953563.1 mRNA upstream 19669 66137448 ~ 66167665 (-) False LOC110496715
XM_036953564.1 mRNA upstream 21475 66139254 ~ 66167669 (-) False LOC110496715
XM_036953565.1 mRNA upstream 22040 66139819 ~ 66167671 (-) False LOC110496715
XM_036953561.1 mRNA upstream 52917 66170696 ~ 66179524 (-) False LOC110496892
TU1802627 other downstream 57378 66055682 ~ 66056239 (-) True G1575475
TU1802602 other downstream 59882 66014469 ~ 66053735 (-) True G1575457
TU1802374 other downstream 314942 65797630 ~ 65798675 (-) True G1575282
TU1802126 other downstream 802566 65310043 ~ 65311051 (-) True G1575088
TU1800648 other downstream 1142450 64970367 ~ 64971167 (-) False G1573887
TU1802672 other upstream 120319 66238098 ~ 66242696 (-) False ppp1r11
TU1802673 other upstream 120319 66238098 ~ 66242696 (-) True ppp1r11
TU1802697 other upstream 183636 66301415 ~ 66305176 (-) True G1575541
TU1802943 other upstream 685645 66803424 ~ 66810064 (-) False LOC110496725
TU1802944 other upstream 685645 66803424 ~ 66810466 (-) True LOC110496725

Expression Profile