RNA id: TCONS_00048845


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00048845
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.54
exon number 1
gene id XLOC_024783
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007136.7
NCBI id CM002909.2
chromosome length 37502051
location 31678079 ~ 31678193 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

aaccacagccatgtcaccctgcagcctagACCGGTTGCTCACTGCTGCTAAGCTGCGCTGAGTCTgattagtacctggatgggagaccacatggaaaactaggctgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000192108

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00049408 lncRNA downstream 174610 31500307 ~ 31503469 (-) False XLOC_024780
TCONS_00049407 lncRNA downstream 174659 31500307 ~ 31503420 (-) False XLOC_024780
TCONS_00048840 lncRNA downstream 174689 31501833 ~ 31503390 (-) True XLOC_024780
TCONS_00049406 lncRNA downstream 2123863 29549404 ~ 29554216 (-) True XLOC_024765
TCONS_00048806 lncRNA downstream 2508818 29167487 ~ 29169261 (-) True XLOC_024757
TCONS_00048853 lncRNA upstream 226563 31904756 ~ 31907603 (-) True XLOC_024787
TCONS_00048864 lncRNA upstream 840206 32518399 ~ 32530719 (-) False XLOC_024794
TCONS_00049106 lncRNA upstream 840206 32518399 ~ 32530868 (-) False XLOC_024794
TCONS_00049105 lncRNA upstream 840206 32518399 ~ 32530868 (-) False XLOC_024794
TCONS_00049107 lncRNA upstream 842786 32520979 ~ 32530729 (-) False XLOC_024794
TCONS_00048841 mRNA downstream 48984 31546828 ~ 31629095 (-) False XLOC_024781
TCONS_00048842 mRNA downstream 48984 31595096 ~ 31629095 (-) True XLOC_024781
TCONS_00048839 mRNA downstream 244567 31424850 ~ 31433512 (-) True XLOC_024779
TCONS_00048838 mRNA downstream 254586 31421253 ~ 31423493 (-) True XLOC_024778
TCONS_00048837 mRNA downstream 281600 31388899 ~ 31396479 (-) True XLOC_024777
TCONS_00048846 mRNA upstream 36142 31714335 ~ 31739309 (-) True XLOC_024784
TCONS_00048847 mRNA upstream 65458 31743651 ~ 31763897 (-) True XLOC_024785
TCONS_00048848 mRNA upstream 159035 31837228 ~ 31863374 (-) True XLOC_024786
TCONS_00048849 mRNA upstream 212063 31890256 ~ 31898552 (-) False XLOC_024787
TCONS_00048851 mRNA upstream 222632 31900825 ~ 31907672 (-) False XLOC_024787
TCONS_00048836 other downstream 359951 31318012 ~ 31318128 (-) True XLOC_024776
TCONS_00048832 other downstream 633872 31044110 ~ 31044207 (-) True XLOC_024773
TCONS_00048831 other downstream 838816 30839147 ~ 30839263 (-) True XLOC_024772
TCONS_00048820 other downstream 2214128 29430345 ~ 29463951 (-) True XLOC_024764
TCONS_00048813 other downstream 2282873 29393632 ~ 29395206 (-) True XLOC_024762
TCONS_00048850 other upstream 212080 31890273 ~ 31907584 (-) False XLOC_024787
TCONS_00048855 other upstream 342688 32020881 ~ 32020995 (-) True XLOC_024789
TCONS_00048871 other upstream 2576952 34255145 ~ 34255273 (-) True XLOC_024807
TCONS_00048891 other upstream 3413719 35091912 ~ 35095112 (-) False XLOC_024824
TCONS_00048937 other upstream 4279961 35958154 ~ 35963205 (-) True XLOC_024864