RNA id: TCONS_00048855


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00048855
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.57
exon number 1
gene id XLOC_024789
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007136.7
NCBI id CM002909.2
chromosome length 37502051
location 32020881 ~ 32020995 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GCCGggagctagctctctgcaactctcacatggtcacccgcTGAAGCAAAGCAGGGCTGTGCCGGGTCAGTTCCTAGATGGGAGACtacatggaaaagctaggttgctgccggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000191349

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00048853 lncRNA downstream 113278 31904756 ~ 31907603 (-) True XLOC_024787
TCONS_00049408 lncRNA downstream 517412 31500307 ~ 31503469 (-) False XLOC_024780
TCONS_00049407 lncRNA downstream 517461 31500307 ~ 31503420 (-) False XLOC_024780
TCONS_00048840 lncRNA downstream 517491 31501833 ~ 31503390 (-) True XLOC_024780
TCONS_00049406 lncRNA downstream 2466665 29549404 ~ 29554216 (-) True XLOC_024765
TCONS_00048864 lncRNA upstream 497404 32518399 ~ 32530719 (-) False XLOC_024794
TCONS_00049106 lncRNA upstream 497404 32518399 ~ 32530868 (-) False XLOC_024794
TCONS_00049105 lncRNA upstream 497404 32518399 ~ 32530868 (-) False XLOC_024794
TCONS_00049107 lncRNA upstream 499984 32520979 ~ 32530729 (-) False XLOC_024794
TCONS_00049409 lncRNA upstream 501678 32522673 ~ 32526933 (-) False XLOC_024794
TCONS_00048854 mRNA downstream 67365 31944165 ~ 31953516 (-) True XLOC_024788
TCONS_00048851 mRNA downstream 113209 31900825 ~ 31907672 (-) False XLOC_024787
TCONS_00048852 mRNA downstream 113291 31901839 ~ 31907590 (-) False XLOC_024787
TCONS_00048849 mRNA downstream 122329 31890256 ~ 31898552 (-) False XLOC_024787
TCONS_00048848 mRNA downstream 157507 31837228 ~ 31863374 (-) True XLOC_024786
TCONS_00048856 mRNA upstream 273724 32294719 ~ 32311056 (-) False XLOC_024790
TCONS_00048857 mRNA upstream 275081 32296076 ~ 32311048 (-) True XLOC_024790
TCONS_00048858 mRNA upstream 294324 32315319 ~ 32363341 (-) False XLOC_024791
TCONS_00048859 mRNA upstream 300218 32321213 ~ 32363351 (-) True XLOC_024791
TCONS_00048860 mRNA upstream 345076 32366071 ~ 32381663 (-) False XLOC_024792
TCONS_00048850 other downstream 113297 31890273 ~ 31907584 (-) False XLOC_024787
TCONS_00048845 other downstream 342688 31678079 ~ 31678193 (-) True XLOC_024783
TCONS_00048836 other downstream 702753 31318012 ~ 31318128 (-) True XLOC_024776
TCONS_00048832 other downstream 976674 31044110 ~ 31044207 (-) True XLOC_024773
TCONS_00048831 other downstream 1181618 30839147 ~ 30839263 (-) True XLOC_024772
TCONS_00048871 other upstream 2234150 34255145 ~ 34255273 (-) True XLOC_024807
TCONS_00048891 other upstream 3070917 35091912 ~ 35095112 (-) False XLOC_024824
TCONS_00048937 other upstream 3937159 35958154 ~ 35963205 (-) True XLOC_024864
TCONS_00048942 other upstream 4037525 36058520 ~ 36058655 (-) True XLOC_024867
TCONS_00048949 other upstream 4233334 36254329 ~ 36263112 (-) False XLOC_024872