RNA id: TCONS_00048942


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00048942
length 136
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_024867
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007136.7
NCBI id CM002909.2
chromosome length 37502051
location 36058520 ~ 36058655 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

tccaatccagttctatgactCTGAGTCCTCCATTACCCTGCAGcctaagaccggttactcactgaagctaagcagggctgagcctggtcagtacctggaagggagaccacttgggaacattaggttgctgttggca

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000120298

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00048936 lncRNA downstream 95279 35958078 ~ 35963241 (-) False XLOC_024864
TCONS_00049442 lncRNA downstream 146323 35905691 ~ 35912197 (-) True XLOC_024862
TCONS_00049441 lncRNA downstream 146324 35905691 ~ 35912196 (-) False XLOC_024862
TCONS_00049440 lncRNA downstream 146325 35905691 ~ 35912195 (-) False XLOC_024862
TCONS_00049434 lncRNA downstream 147321 35905691 ~ 35911199 (-) False XLOC_024862
TCONS_00049443 lncRNA upstream 81188 36139843 ~ 36142321 (-) False XLOC_024868
TCONS_00049444 lncRNA upstream 81188 36139843 ~ 36144733 (-) False XLOC_024868
TCONS_00049445 lncRNA upstream 81188 36139843 ~ 36144932 (-) False XLOC_024868
TCONS_00049446 lncRNA upstream 81188 36139843 ~ 36150447 (-) False XLOC_024868
TCONS_00049447 lncRNA upstream 81188 36139843 ~ 36152385 (-) True XLOC_024868
TCONS_00048940 mRNA downstream 13937 36011470 ~ 36044583 (-) False XLOC_024866
TCONS_00048941 mRNA downstream 14226 36022385 ~ 36044294 (-) True XLOC_024866
TCONS_00048939 mRNA downstream 38176 36010815 ~ 36020344 (-) False XLOC_024866
TCONS_00048938 mRNA downstream 62379 35986345 ~ 35996141 (-) True XLOC_024865
TCONS_00048934 mRNA downstream 95362 35957603 ~ 35963158 (-) False XLOC_024864
TCONS_00048943 mRNA upstream 139078 36197733 ~ 36217563 (-) False XLOC_024870
TCONS_00048944 mRNA upstream 139081 36197736 ~ 36217563 (-) True XLOC_024870
TCONS_00048945 mRNA upstream 160781 36219436 ~ 36248053 (-) True XLOC_024871
TCONS_00048946 mRNA upstream 190624 36249279 ~ 36261836 (-) False XLOC_024872
TCONS_00048947 mRNA upstream 191020 36249675 ~ 36263125 (-) False XLOC_024872
TCONS_00048937 other downstream 95315 35958154 ~ 35963205 (-) True XLOC_024864
TCONS_00048891 other downstream 963408 35091912 ~ 35095112 (-) False XLOC_024824
TCONS_00048871 other downstream 1803247 34255145 ~ 34255273 (-) True XLOC_024807
TCONS_00048855 other downstream 4037525 32020881 ~ 32020995 (-) True XLOC_024789
TCONS_00048850 other downstream 4150936 31890273 ~ 31907584 (-) False XLOC_024787
TCONS_00048949 other upstream 195674 36254329 ~ 36263112 (-) False XLOC_024872
TCONS_00048967 other upstream 902069 36960724 ~ 36975214 (-) False XLOC_024886
TCONS_00048972 other upstream 1086313 37144968 ~ 37145083 (-) True XLOC_024891