RNA id: TCONS_00049659



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00049659
length 393
RNA type mRNA
GC content 0.52
exon number 3
gene id XLOC_025127
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 13332870 ~ 13347096 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ATGAGGCACGCTGAGGTTGTGGCCTTCATCAAGAACGGCGGGAAAGAAACCCGTTTGCTGGTGGTAGATCCAGATACAGACGAGCATTTCAAGAAGATGAACATCACTCCTACCAGCATCCACGTCAAAGATTTTGATGAGTCTATAACGAACGGCTCCTCCAGCCCTCATGTAAACGGGACGTCCTCGCGATCCACACATTCAGATGGCAGCAGTCAGGACAACAACGTACAGTACTCGAGCAGTCACCTCCTGGACCCGTTTGAAGAAACAGGTCTGAATCTGAGCCCCACGGCGGCCGAGGCTAAAGAGAAAGCCCACGCCAAACGCGCCAGAAAGAGAGCGCCGCAGATGGACTGGAACAAGAAACATGAGATCTTCAGCAATTTCTGA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000113878

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00049655 lncRNA upstream 165542 13149550 ~ 13167328 (+) True XLOC_025125
TCONS_00052615 lncRNA upstream 478391 12838694 ~ 12854479 (+) False XLOC_025122
TCONS_00052616 lncRNA upstream 489940 12839025 ~ 12842930 (+) True XLOC_025122
TCONS_00052614 lncRNA upstream 1068412 12239692 ~ 12264458 (+) True XLOC_025107
TCONS_00052613 lncRNA upstream 1251497 12076852 ~ 12081373 (+) True XLOC_025106
TCONS_00052617 lncRNA downstream 13607 13360703 ~ 13367508 (+) True XLOC_025128
TCONS_00052328 lncRNA downstream 42766 13389862 ~ 13390838 (+) False XLOC_025129
TCONS_00052618 lncRNA downstream 42848 13389944 ~ 13406082 (+) True XLOC_025129
TCONS_00052619 lncRNA downstream 59441 13406537 ~ 13413213 (+) True XLOC_025131
TCONS_00052620 lncRNA downstream 129776 13476872 ~ 13477873 (+) True XLOC_025134
TCONS_00049657 mRNA upstream 73972 13190028 ~ 13258898 (+) False XLOC_025126
TCONS_00049658 mRNA upstream 73972 13242690 ~ 13258898 (+) True XLOC_025126
TCONS_00049656 mRNA upstream 74767 13190012 ~ 13258103 (+) False XLOC_025126
TCONS_00049654 mRNA upstream 470390 12861158 ~ 12862480 (+) True XLOC_025124
TCONS_00049653 mRNA upstream 482473 12848123 ~ 12850397 (+) True XLOC_025123
TCONS_00049662 mRNA downstream 93804 13440900 ~ 13446085 (+) True XLOC_025132
TCONS_00049663 mRNA downstream 122608 13469704 ~ 13473197 (+) True XLOC_025133
TCONS_00049664 mRNA downstream 135446 13482542 ~ 13489945 (+) True XLOC_025135
TCONS_00049665 mRNA downstream 164888 13511984 ~ 13521115 (+) True XLOC_025136
TCONS_00049666 mRNA downstream 212103 13559199 ~ 13567762 (+) True XLOC_025137
TCONS_00049628 other upstream 1385913 11943549 ~ 11946957 (+) True XLOC_025104
TCONS_00049621 other upstream 3169309 10152138 ~ 10163561 (+) True XLOC_025087
TCONS_00049609 other upstream 4290775 9041989 ~ 9042095 (+) True XLOC_025081
TCONS_00049608 other upstream 4291302 9041462 ~ 9041568 (+) True XLOC_025080
TCONS_00049607 other upstream 4291817 9040947 ~ 9041053 (+) True XLOC_025079
TCONS_00049660 other downstream 59130 13406226 ~ 13406323 (+) True XLOC_025130
TCONS_00049661 other downstream 59355 13406451 ~ 13406538 (+) False XLOC_025131
TCONS_00049675 other downstream 501130 13848226 ~ 13857716 (+) False XLOC_025143
TCONS_00049684 other downstream 897570 14244666 ~ 14244784 (+) True XLOC_025148
TCONS_00049690 other downstream 1052129 14399225 ~ 14399652 (+) True XLOC_025154

Expression Profile


//