RNA id: TCONS_00049666



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00049666
length 507
RNA type mRNA
GC content 0.44
exon number 7
gene id XLOC_025137
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 13559199 ~ 13567762 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TAAGAGTGCTTCACGGTTTGCTTTCTGATGCTTCAAGATGAACACGACGACCCAAAACATTACTACAgGTGTGTTCCACAGCAAACCTGATCTCAAACCAGTCAAAACCAATTCAAATAACACAGCATCTCGGCCGGATTGGTTACTCTACTCTGTTCCTGTATCAGCTTTTGTGATTGGGATTGTCCTGTTCACAACCATCTGCAAAACACAGCGGCAGAGAAATGGCAATCGTCAACACACAGccACTGCAAAGAAGAGGCCACAAACAAATGGAAACGCGGTCACTGTTAACAACTTTGGCAGCAGCACTCAGAGATACATGGAGAAACCTCAAAACAACAAGAAGGATGAGACTCAGTCCTATGAGAATGTGGAGGCAGCAATCTACAACAACCAGGACAAGATCACATTTTATGTTTCTCCAGATGAAGATTATCTGAACCCAGATGCAACTGGAGAAGAGGAAATGATGAGGACAGAGGAACAACTAAACACCCTGCAGCT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000166547

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00052620 lncRNA upstream 81326 13476872 ~ 13477873 (+) True XLOC_025134
TCONS_00052619 lncRNA upstream 145986 13406537 ~ 13413213 (+) True XLOC_025131
TCONS_00052618 lncRNA upstream 153117 13389944 ~ 13406082 (+) True XLOC_025129
TCONS_00052328 lncRNA upstream 168361 13389862 ~ 13390838 (+) False XLOC_025129
TCONS_00052617 lncRNA upstream 191691 13360703 ~ 13367508 (+) True XLOC_025128
TCONS_00052621 lncRNA downstream 460481 14028243 ~ 14073770 (+) True XLOC_025145
TCONS_00052329 lncRNA downstream 633281 14201043 ~ 14202519 (+) True XLOC_025147
TCONS_00049683 lncRNA downstream 674357 14242119 ~ 14248150 (+) False XLOC_025148
TCONS_00052330 lncRNA downstream 676436 14244198 ~ 14248538 (+) False XLOC_025148
TCONS_00052331 lncRNA downstream 683482 14251244 ~ 14254765 (+) True XLOC_025149
TCONS_00049665 mRNA upstream 38084 13511984 ~ 13521115 (+) True XLOC_025136
TCONS_00049664 mRNA upstream 69254 13482542 ~ 13489945 (+) True XLOC_025135
TCONS_00049663 mRNA upstream 86002 13469704 ~ 13473197 (+) True XLOC_025133
TCONS_00049662 mRNA upstream 113114 13440900 ~ 13446085 (+) True XLOC_025132
TCONS_00049659 mRNA upstream 212103 13332870 ~ 13347096 (+) True XLOC_025127
TCONS_00049667 mRNA downstream 2044 13569806 ~ 13576052 (+) True XLOC_025138
TCONS_00049668 mRNA downstream 32952 13600714 ~ 13618382 (+) False XLOC_025139
TCONS_00049669 mRNA downstream 35510 13603272 ~ 13617734 (+) True XLOC_025139
TCONS_00049670 mRNA downstream 57053 13624815 ~ 13633331 (+) True XLOC_025140
TCONS_00049671 mRNA downstream 69621 13637383 ~ 13684397 (+) True XLOC_025141
TCONS_00049661 other upstream 152661 13406451 ~ 13406538 (+) False XLOC_025131
TCONS_00049660 other upstream 152876 13406226 ~ 13406323 (+) True XLOC_025130
TCONS_00049628 other upstream 1612242 11943549 ~ 11946957 (+) True XLOC_025104
TCONS_00049621 other upstream 3395638 10152138 ~ 10163561 (+) True XLOC_025087
TCONS_00049609 other upstream 4517104 9041989 ~ 9042095 (+) True XLOC_025081
TCONS_00049675 other downstream 280464 13848226 ~ 13857716 (+) False XLOC_025143
TCONS_00049684 other downstream 676904 14244666 ~ 14244784 (+) True XLOC_025148
TCONS_00049690 other downstream 831463 14399225 ~ 14399652 (+) True XLOC_025154
TCONS_00049704 other downstream 1107007 14674769 ~ 14684603 (+) True XLOC_025161
TCONS_00049719 other downstream 2123541 15691303 ~ 15719823 (+) True XLOC_025174

Expression Profile


//