RNA id: TCONS_00049854



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00049854
length 99
RNA type snoRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_025243
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 19349719 ~ 19349817 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


CTGTGCTGATGAGCTGTGATTGTGTCTGACCTGGTATTGCTGTTCCTCCGGGAGTAACTCTGACCAGGGTCTGAAGACTGTAATCTTCTCTCTGAGCAG

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000118771

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00049852 lncRNA upstream 8678 19336525 ~ 19341041 (+) False XLOC_025242
TCONS_00049829 lncRNA upstream 561234 18771528 ~ 18788485 (+) True XLOC_025229
TCONS_00052636 lncRNA upstream 677428 18670824 ~ 18672291 (+) True XLOC_025227
TCONS_00049812 lncRNA upstream 949876 18399317 ~ 18399843 (+) True XLOC_025220
TCONS_00049807 lncRNA upstream 1152593 18189685 ~ 18197126 (+) True XLOC_025218
TCONS_00049856 lncRNA downstream 6116 19355933 ~ 19360577 (+) True XLOC_025244
TCONS_00052334 lncRNA downstream 123146 19472963 ~ 19473197 (+) True XLOC_025248
TCONS_00049864 lncRNA downstream 315523 19665340 ~ 19677031 (+) True XLOC_025251
TCONS_00052637 lncRNA downstream 709861 20059678 ~ 20064732 (+) False XLOC_025257
TCONS_00049871 lncRNA downstream 713692 20063509 ~ 20064130 (+) True XLOC_025257
TCONS_00049849 mRNA upstream 26030 19299309 ~ 19323689 (+) True XLOC_025240
TCONS_00049848 mRNA upstream 28315 19299309 ~ 19321404 (+) False XLOC_025240
TCONS_00049847 mRNA upstream 67194 19248973 ~ 19282525 (+) True XLOC_025239
TCONS_00049846 mRNA upstream 67841 19245804 ~ 19281878 (+) False XLOC_025239
TCONS_00049845 mRNA upstream 111325 19216567 ~ 19238394 (+) True XLOC_025238
TCONS_00049855 mRNA downstream 6052 19355869 ~ 19363981 (+) False XLOC_025244
TCONS_00049857 mRNA downstream 97180 19446997 ~ 19457773 (+) True XLOC_025245
TCONS_00049858 mRNA downstream 111174 19460991 ~ 19466015 (+) True XLOC_025246
TCONS_00049859 mRNA downstream 118960 19468777 ~ 19477473 (+) True XLOC_025247
TCONS_00049860 mRNA downstream 259821 19609638 ~ 19610990 (+) True XLOC_025249
TCONS_00049850 other upstream 36612 19312991 ~ 19313107 (+) True XLOC_025241
TCONS_00049840 other upstream 382274 18936006 ~ 18967445 (+) False XLOC_025236
TCONS_00049843 other upstream 408005 18936080 ~ 18941714 (+) True XLOC_025236
TCONS_00049842 other upstream 410019 18936046 ~ 18939700 (+) False XLOC_025236
TCONS_00049839 other upstream 432136 18917461 ~ 18917583 (+) True XLOC_025235
TCONS_00049874 other downstream 1330106 20679923 ~ 20680038 (+) True XLOC_025262
TCONS_00049876 other downstream 1675336 21025153 ~ 21030871 (+) False XLOC_025264
TCONS_00049877 other downstream 1675336 21025153 ~ 21030873 (+) True XLOC_025264
TCONS_00049893 other downstream 2709496 22059313 ~ 22061088 (+) False XLOC_025275
TCONS_00049913 other downstream 3219170 22568987 ~ 22569106 (+) True XLOC_025283

Expression Profile


//