RNA id: TCONS_00050060



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00050060
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_025374
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 26194344 ~ 26194459 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GGCCACAGCCATattaccctgcagcccaagaccagttattCACTGAAGCGAAGcaaggctgagcctggttagtattggatgggagatcacatgggaaacttaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000175956

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00050054 lncRNA upstream 46911 26144765 ~ 26147433 (+) False XLOC_025372
TCONS_00052340 lncRNA upstream 113944 26076494 ~ 26080400 (+) True XLOC_025371
TCONS_00052675 lncRNA upstream 207400 25985339 ~ 25986944 (+) True XLOC_025364
TCONS_00050036 lncRNA upstream 349016 25844151 ~ 25845328 (+) True XLOC_025360
TCONS_00050034 lncRNA upstream 440795 25752221 ~ 25753549 (+) True XLOC_025358
TCONS_00050064 lncRNA downstream 66069 26260528 ~ 26260981 (+) True XLOC_025376
TCONS_00050066 lncRNA downstream 86028 26280487 ~ 26281561 (+) True XLOC_025377
TCONS_00050070 lncRNA downstream 100909 26295368 ~ 26303657 (+) False XLOC_025378
TCONS_00050076 lncRNA downstream 155196 26349655 ~ 26351463 (+) True XLOC_025381
TCONS_00052676 lncRNA downstream 160835 26355294 ~ 26361798 (+) True XLOC_025382
TCONS_00050059 mRNA upstream 37278 26145034 ~ 26157066 (+) True XLOC_025372
TCONS_00050057 mRNA upstream 37281 26144782 ~ 26157063 (+) False XLOC_025372
TCONS_00050058 mRNA upstream 39450 26145013 ~ 26154894 (+) False XLOC_025372
TCONS_00050051 mRNA upstream 46869 26081343 ~ 26147475 (+) False XLOC_025372
TCONS_00050055 mRNA upstream 46869 26144765 ~ 26147475 (+) False XLOC_025372
TCONS_00050061 mRNA downstream 28917 26223376 ~ 26232773 (+) True XLOC_025375
TCONS_00050062 mRNA downstream 49894 26244353 ~ 26266464 (+) False XLOC_025376
TCONS_00050063 mRNA downstream 51272 26245731 ~ 26266167 (+) False XLOC_025376
TCONS_00050065 mRNA downstream 73266 26267725 ~ 26281264 (+) False XLOC_025377
TCONS_00050067 mRNA downstream 94522 26288981 ~ 26319752 (+) False XLOC_025378
TCONS_00050056 other upstream 42784 26144765 ~ 26151560 (+) False XLOC_025372
TCONS_00050021 other upstream 1062113 25126456 ~ 25132231 (+) True XLOC_025346
TCONS_00049977 other upstream 2056436 24134557 ~ 24137908 (+) True XLOC_025318
TCONS_00049974 other upstream 2093262 24095160 ~ 24101082 (+) True XLOC_025315
TCONS_00049975 other upstream 2098308 24095957 ~ 24096036 (+) True XLOC_025316
TCONS_00050071 other downstream 116035 26310494 ~ 26319054 (+) True XLOC_025378
TCONS_00050085 other downstream 877314 27071773 ~ 27074132 (+) True XLOC_025389
TCONS_00050090 other downstream 1212637 27407096 ~ 27407211 (+) True XLOC_025392
TCONS_00050119 other downstream 2637059 28831518 ~ 28850434 (+) False XLOC_025404
TCONS_00050124 other downstream 2666717 28861176 ~ 28866082 (+) True XLOC_025405