RNA id: TCONS_00050573



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00050573
length 137
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_025709
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 49132341 ~ 49132477 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TTTAGGCTATTACCTAAACTGGCCCCAAAGGTGAAGAGATACTCTCTCTGTATGGTCAcgcactgaagccaagcagggctgtgcctggtcagttcCTGAATGGGAGACTacataggaaagctaggttgctgctggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000122039

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00052373 lncRNA upstream 125676 48998891 ~ 49006665 (+) False XLOC_025704
TCONS_00052785 lncRNA upstream 125676 49005459 ~ 49006665 (+) True XLOC_025704
TCONS_00052784 lncRNA upstream 224511 48894467 ~ 48907830 (+) True XLOC_025703
TCONS_00052782 lncRNA upstream 502570 48618161 ~ 48629771 (+) False XLOC_025701
TCONS_00052783 lncRNA upstream 502570 48621120 ~ 48629771 (+) True XLOC_025701
TCONS_00052374 lncRNA downstream 1905 49134382 ~ 49134743 (+) True XLOC_025710
TCONS_00052786 lncRNA downstream 323285 49455762 ~ 49459924 (+) False XLOC_025712
TCONS_00052787 lncRNA downstream 323356 49455833 ~ 49459924 (+) True XLOC_025712
TCONS_00052788 lncRNA downstream 358077 49490554 ~ 49506172 (+) True XLOC_025713
TCONS_00052789 lncRNA downstream 432780 49565257 ~ 49577267 (+) False XLOC_025715
TCONS_00050572 mRNA upstream 31885 49097775 ~ 49100456 (+) True XLOC_025708
TCONS_00050571 mRNA upstream 53023 49074008 ~ 49079318 (+) True XLOC_025707
TCONS_00050570 mRNA upstream 74015 49043917 ~ 49058326 (+) True XLOC_025706
TCONS_00050569 mRNA upstream 107771 49021079 ~ 49024570 (+) True XLOC_025705
TCONS_00050568 mRNA upstream 262709 48842918 ~ 48869632 (+) True XLOC_025702
TCONS_00050574 mRNA downstream 264638 49397115 ~ 49421274 (+) True XLOC_025711
TCONS_00050575 mRNA downstream 388629 49521106 ~ 49548229 (+) True XLOC_025714
TCONS_00050576 mRNA downstream 444185 49576662 ~ 49624678 (+) True XLOC_025715
TCONS_00050577 mRNA downstream 936727 50069204 ~ 50075029 (+) False XLOC_025717
TCONS_00050580 mRNA downstream 937133 50069610 ~ 50075188 (+) True XLOC_025717
TCONS_00050561 other upstream 1671738 47460488 ~ 47460603 (+) True XLOC_025690
TCONS_00050528 other upstream 3497155 45635077 ~ 45635186 (+) True XLOC_025668
TCONS_00050515 other upstream 4244188 44888037 ~ 44888153 (+) True XLOC_025662
TCONS_00050507 other upstream 5415426 43716827 ~ 43716915 (+) True XLOC_025656
TCONS_00050506 other upstream 5417558 43714699 ~ 43714783 (+) True XLOC_025655
TCONS_00050578 other downstream 937118 50069595 ~ 50075190 (+) False XLOC_025717
TCONS_00050613 other downstream 3487581 52620058 ~ 52620175 (+) True XLOC_025746
TCONS_00050620 other downstream 3696435 52828912 ~ 52829006 (+) True XLOC_025751
TCONS_00050635 other downstream 4935046 54067523 ~ 54067639 (+) True XLOC_025764
TCONS_00050662 other downstream 6166566 55299043 ~ 55299158 (+) True XLOC_025787