RNA id: TCONS_00050635



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00050635
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_025764
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 54067523 ~ 54067639 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GGCAACTGCtgtagctctctgcaactctcacatggttacCAACTgcagctaagcagggctgcgtccAGGctgtacctggatggaagaccacataggaaagctaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000177673

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00052799 lncRNA upstream 415122 53526965 ~ 53652401 (+) False XLOC_025761
TCONS_00052382 lncRNA upstream 417897 53632118 ~ 53649626 (+) True XLOC_025761
TCONS_00052381 lncRNA upstream 435176 53606166 ~ 53632347 (+) False XLOC_025761
TCONS_00052380 lncRNA upstream 1257813 52806272 ~ 52809710 (+) False XLOC_025750
TCONS_00052379 lncRNA upstream 1675318 52390252 ~ 52392205 (+) True XLOC_025739
TCONS_00052383 lncRNA downstream 43750 54111389 ~ 54111972 (+) True XLOC_025765
TCONS_00050637 lncRNA downstream 155686 54223325 ~ 54226528 (+) True XLOC_025763
TCONS_00052800 lncRNA downstream 203064 54270703 ~ 54271345 (+) True XLOC_025766
TCONS_00052384 lncRNA downstream 216128 54283767 ~ 54284185 (+) True XLOC_025767
TCONS_00052801 lncRNA downstream 222039 54289678 ~ 54303624 (+) True XLOC_025768
TCONS_00050632 mRNA upstream 148060 53773256 ~ 53919463 (+) True XLOC_025762
TCONS_00050631 mRNA upstream 545315 53511936 ~ 53522208 (+) True XLOC_025760
TCONS_00050630 mRNA upstream 618086 53352018 ~ 53449437 (+) True XLOC_025759
TCONS_00050629 mRNA upstream 716976 53317040 ~ 53350547 (+) True XLOC_025758
TCONS_00050628 mRNA upstream 793238 53240562 ~ 53274285 (+) True XLOC_025757
TCONS_00050636 mRNA downstream 100368 54168007 ~ 54237556 (+) False XLOC_025763
TCONS_00050638 mRNA downstream 486292 54553931 ~ 54567961 (+) True XLOC_025770
TCONS_00050639 mRNA downstream 505086 54572725 ~ 54577985 (+) True XLOC_025771
TCONS_00050640 mRNA downstream 514348 54581987 ~ 54589823 (+) True XLOC_025772
TCONS_00050641 mRNA downstream 676430 54744069 ~ 54752364 (+) False XLOC_025773
TCONS_00050620 other upstream 1238517 52828912 ~ 52829006 (+) True XLOC_025751
TCONS_00050613 other upstream 1447348 52620058 ~ 52620175 (+) True XLOC_025746
TCONS_00050578 other upstream 3992333 50069595 ~ 50075190 (+) False XLOC_025717
TCONS_00050573 other upstream 4935046 49132341 ~ 49132477 (+) True XLOC_025709
TCONS_00050561 other upstream 6606920 47460488 ~ 47460603 (+) True XLOC_025690
TCONS_00050662 other downstream 1231404 55299043 ~ 55299158 (+) True XLOC_025787
TCONS_00050664 other downstream 1415874 55483513 ~ 55483647 (+) True XLOC_025789
TCONS_00050682 other downstream 3568735 57636374 ~ 57639448 (+) False XLOC_025808
TCONS_00050688 other downstream 3758300 57825939 ~ 57829919 (+) True XLOC_025812
TCONS_00050692 other downstream 3930351 57997990 ~ 57998559 (+) False XLOC_025817