RNA id: TCONS_00050662



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00050662
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_025787
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 55299043 ~ 55299158 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


AgctacagccatatcaccctgcagcccaagaccagtaaCTCACTGAGCTtaacagggctgagcctggtcagaacctggatgggagaccacagggCAAAAtttggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000176204

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00050657 lncRNA upstream 175721 55122662 ~ 55123322 (+) False XLOC_025784
TCONS_00050655 lncRNA upstream 184286 55114097 ~ 55114757 (+) False XLOC_025783
TCONS_00052804 lncRNA upstream 462526 54834509 ~ 54836517 (+) True XLOC_025776
TCONS_00052802 lncRNA upstream 962404 54332726 ~ 54336639 (+) False XLOC_025769
TCONS_00052803 lncRNA upstream 962404 54332747 ~ 54336639 (+) True XLOC_025769
TCONS_00052805 lncRNA downstream 87057 55386215 ~ 55387657 (+) True XLOC_025788
TCONS_00052806 lncRNA downstream 182962 55482120 ~ 55488241 (+) False XLOC_025789
TCONS_00050663 lncRNA downstream 182983 55482141 ~ 55488241 (+) False XLOC_025789
TCONS_00052807 lncRNA downstream 183020 55482178 ~ 55488241 (+) False XLOC_025789
TCONS_00052808 lncRNA downstream 347715 55646873 ~ 55654264 (+) True XLOC_025790
TCONS_00050661 mRNA upstream 8406 55288202 ~ 55290637 (+) True XLOC_025786
TCONS_00050660 mRNA upstream 8413 55288200 ~ 55290630 (+) False XLOC_025786
TCONS_00050659 mRNA upstream 166991 55131289 ~ 55132052 (+) True XLOC_025785
TCONS_00050658 mRNA upstream 175604 55122662 ~ 55123439 (+) True XLOC_025784
TCONS_00050656 mRNA upstream 184169 55114097 ~ 55114874 (+) True XLOC_025783
TCONS_00050667 mRNA downstream 864118 56163276 ~ 56342119 (+) False XLOC_025792
TCONS_00050666 mRNA downstream 864118 56163276 ~ 56342119 (+) False XLOC_025792
TCONS_00050668 mRNA downstream 977188 56276346 ~ 56284122 (+) True XLOC_025792
TCONS_00050669 mRNA downstream 1067237 56366395 ~ 56394018 (+) False XLOC_025794
TCONS_00050670 mRNA downstream 1078168 56377326 ~ 56393599 (+) True XLOC_025794
TCONS_00050635 other upstream 1231404 54067523 ~ 54067639 (+) True XLOC_025764
TCONS_00050620 other upstream 2470037 52828912 ~ 52829006 (+) True XLOC_025751
TCONS_00050613 other upstream 2678868 52620058 ~ 52620175 (+) True XLOC_025746
TCONS_00050578 other upstream 5223853 50069595 ~ 50075190 (+) False XLOC_025717
TCONS_00050573 other upstream 6166566 49132341 ~ 49132477 (+) True XLOC_025709
TCONS_00050664 other downstream 184355 55483513 ~ 55483647 (+) True XLOC_025789
TCONS_00050682 other downstream 2337216 57636374 ~ 57639448 (+) False XLOC_025808
TCONS_00050688 other downstream 2526781 57825939 ~ 57829919 (+) True XLOC_025812
TCONS_00050692 other downstream 2698832 57997990 ~ 57998559 (+) False XLOC_025817
TCONS_00050699 other downstream 2869365 58168523 ~ 58170414 (+) False XLOC_025821