RNA id: TCONS_00006005


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00006005
length 4752
lncRNA type antisense_over
GC content 0.37
exon number 2
gene id XLOC_002622
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007121.7
NCBI id CM002894.2
chromosome length 45420867
location 10273729 ~ 10278533 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00004878 lncRNA downstream 257381 9915408 ~ 10016348 (-) True XLOC_002620
TCONS_00006003 lncRNA downstream 612037 9646362 ~ 9661692 (-) True XLOC_002619
TCONS_00004873 lncRNA downstream 735394 9537688 ~ 9538335 (-) True XLOC_002618
TCONS_00004871 lncRNA downstream 735429 9536076 ~ 9538300 (-) False XLOC_002618
TCONS_00006006 lncRNA upstream 8922 10287455 ~ 10288683 (-) True XLOC_002621
TCONS_00006007 lncRNA upstream 45976 10324509 ~ 10330620 (-) False XLOC_002623
TCONS_00006008 lncRNA upstream 48634 10327167 ~ 10331131 (-) False XLOC_002623
TCONS_00004881 lncRNA upstream 285728 10564261 ~ 10578832 (-) False XLOC_002624
TCONS_00004883 lncRNA upstream 433645 10712178 ~ 10714221 (-) False XLOC_002625
TCONS_00004875 mRNA downstream 254935 9835679 ~ 10018794 (-) False XLOC_002620
TCONS_00004877 mRNA downstream 255609 9884403 ~ 10018120 (-) False XLOC_002620
TCONS_00004876 mRNA downstream 257381 9837292 ~ 10016348 (-) False XLOC_002620
TCONS_00004874 mRNA downstream 312241 9834896 ~ 9961488 (-) False XLOC_002620
TCONS_00004866 mRNA downstream 863661 9397305 ~ 9410068 (-) True XLOC_002617
TCONS_00004882 mRNA upstream 285914 10564447 ~ 10607118 (-) True XLOC_002624
TCONS_00004884 mRNA upstream 582226 10860759 ~ 10863936 (-) False XLOC_002627
TCONS_00004885 mRNA upstream 582226 10860759 ~ 10864331 (-) True XLOC_002627
TCONS_00004886 mRNA upstream 601004 10879537 ~ 10969444 (-) False XLOC_002628
TCONS_00004887 mRNA upstream 602132 10880665 ~ 10969596 (-) True XLOC_002628
TCONS_00004869 other downstream 735403 9534782 ~ 9538326 (-) False XLOC_002618
TCONS_00004859 other downstream 1132050 9141565 ~ 9141679 (-) True XLOC_002611
TCONS_00004856 other downstream 1184093 9037358 ~ 9089636 (-) False XLOC_002608
TCONS_00004855 other downstream 1256892 9016721 ~ 9016837 (-) True XLOC_002609
TCONS_00004848 other downstream 1595901 8675890 ~ 8677828 (-) True XLOC_002605
TCONS_00004879 other upstream 40775 10319308 ~ 10332427 (-) False XLOC_002623
TCONS_00004880 other upstream 50931 10329464 ~ 10329554 (-) True XLOC_002623
TCONS_00004903 other upstream 1482847 11761380 ~ 11764439 (-) True XLOC_002636
TCONS_00004913 other upstream 3026532 13305065 ~ 13305183 (-) True XLOC_002643
TCONS_00004918 other upstream 3328494 13607027 ~ 13607143 (-) True XLOC_002646

Expression Profile

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