RNA id: TCONS_00051287


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00051287
length 121
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_026301
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 21616920 ~ 21617040 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGCCACAGCCTTAtgaccctgcagcccaagaccggttacacactgaagctaagcagggtcagTACCAGGATGGGAGTACCTGAAtggtagaccacatgggaaaactaggttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000117591

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00051278 lncRNA downstream 409974 21201428 ~ 21206946 (-) True XLOC_026295
TCONS_00051269 lncRNA downstream 554161 21056731 ~ 21062759 (-) True XLOC_026290
TCONS_00052998 lncRNA downstream 701210 20901066 ~ 20915710 (-) True XLOC_026285
TCONS_00052997 lncRNA downstream 1215196 20130274 ~ 20401724 (-) True XLOC_026283
TCONS_00052996 lncRNA downstream 1215300 20130274 ~ 20401620 (-) False XLOC_026283
TCONS_00052999 lncRNA upstream 535567 22152607 ~ 22155523 (-) True XLOC_026303
TCONS_00053000 lncRNA upstream 791750 22408790 ~ 22421923 (-) True XLOC_026308
TCONS_00053001 lncRNA upstream 1422468 23039508 ~ 23042675 (-) False XLOC_026310
TCONS_00053002 lncRNA upstream 1422468 23039508 ~ 23045222 (-) False XLOC_026310
TCONS_00053003 lncRNA upstream 1422468 23039508 ~ 23069636 (-) True XLOC_026310
TCONS_00051286 mRNA downstream 214641 21385251 ~ 21402279 (-) True XLOC_026300
TCONS_00051285 mRNA downstream 219616 21385251 ~ 21397304 (-) False XLOC_026300
TCONS_00051284 mRNA downstream 234429 21350509 ~ 21382491 (-) True XLOC_026299
TCONS_00051281 mRNA downstream 268442 21280658 ~ 21348478 (-) False XLOC_026298
TCONS_00051283 mRNA downstream 328718 21282477 ~ 21288202 (-) False XLOC_026298
TCONS_00051288 mRNA upstream 381966 21999006 ~ 22000986 (-) True XLOC_026302
TCONS_00051289 mRNA upstream 540984 22158024 ~ 22212764 (-) False XLOC_026304
TCONS_00051291 mRNA upstream 544549 22161589 ~ 22191132 (-) False XLOC_026304
TCONS_00051292 mRNA upstream 544867 22161907 ~ 22191132 (-) False XLOC_026304
TCONS_00051294 mRNA upstream 544966 22162006 ~ 22213558 (-) False XLOC_026304
TCONS_00051260 other downstream 618560 20994504 ~ 20998360 (-) True XLOC_026288
TCONS_00051258 other downstream 634214 20972019 ~ 20982706 (-) True XLOC_026287
TCONS_00051254 other downstream 823264 20720840 ~ 20793656 (-) True XLOC_026284
TCONS_00051249 other downstream 1510687 20104059 ~ 20106233 (-) True XLOC_026281
TCONS_00051231 other downstream 2283289 19333504 ~ 19333631 (-) True XLOC_026269
TCONS_00051290 other upstream 544411 22161451 ~ 22177128 (-) False XLOC_026304
TCONS_00051313 other upstream 1765452 23382492 ~ 23382608 (-) True XLOC_026314
TCONS_00051315 other upstream 1813205 23430245 ~ 23435001 (-) True XLOC_026315
TCONS_00051337 other upstream 2200882 23817922 ~ 23818046 (-) True XLOC_026325
TCONS_00051343 other upstream 2786109 24403149 ~ 24403269 (-) True XLOC_026329