RNA id: TCONS_00051337


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00051337
length 125
RNA type rRNA
GC content 0.45
exon number 1
gene id XLOC_026325
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 23817922 ~ 23818046 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

cagcaaaacactTACTGACCACATGATCATCATAAAAACAGTGCAATGCGTCaatctgaagctaagcagagctgtgcccagtcagtacctggatgggagataaCATGAGAAAGCTAAGTTGCTGC

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000170137

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00053018 lncRNA downstream 65650 23750161 ~ 23752272 (-) False XLOC_026322
TCONS_00053017 lncRNA downstream 66608 23747574 ~ 23751314 (-) False XLOC_026322
TCONS_00053016 lncRNA downstream 73643 23740351 ~ 23744279 (-) False XLOC_026324
TCONS_00051334 lncRNA downstream 77257 23740362 ~ 23740665 (-) True XLOC_026324
TCONS_00053011 lncRNA downstream 107348 23701286 ~ 23710574 (-) False XLOC_026322
TCONS_00051338 lncRNA upstream 116836 23934882 ~ 24050083 (-) True XLOC_026322
TCONS_00051360 lncRNA upstream 1313974 25132020 ~ 25135109 (-) True XLOC_026339
TCONS_00051366 lncRNA upstream 1452673 25270719 ~ 25273434 (-) False XLOC_026342
TCONS_00051380 lncRNA upstream 1864838 25682884 ~ 25699598 (-) False XLOC_026348
TCONS_00051379 lncRNA upstream 1864838 25682884 ~ 25701218 (-) False XLOC_026348
TCONS_00051330 mRNA downstream 174092 23641938 ~ 23643830 (-) True XLOC_026321
TCONS_00051329 mRNA downstream 174171 23641935 ~ 23643751 (-) False XLOC_026321
TCONS_00051328 mRNA downstream 213526 23599290 ~ 23604396 (-) True XLOC_026320
TCONS_00051326 mRNA downstream 221113 23584663 ~ 23596809 (-) False XLOC_026319
TCONS_00051325 mRNA downstream 221390 23581614 ~ 23596532 (-) False XLOC_026319
TCONS_00051339 mRNA upstream 254674 24072720 ~ 24093144 (-) True XLOC_026326
TCONS_00051340 mRNA upstream 383910 24201956 ~ 24205339 (-) True XLOC_026327
TCONS_00051341 mRNA upstream 496651 24314697 ~ 24338163 (-) False XLOC_026328
TCONS_00051342 mRNA upstream 500097 24318143 ~ 24337814 (-) True XLOC_026328
TCONS_00051344 mRNA upstream 619317 24437363 ~ 24456538 (-) False XLOC_026330
TCONS_00051315 other downstream 382921 23430245 ~ 23435001 (-) True XLOC_026315
TCONS_00051313 other downstream 435314 23382492 ~ 23382608 (-) True XLOC_026314
TCONS_00051290 other downstream 1640794 22161451 ~ 22177128 (-) False XLOC_026304
TCONS_00051287 other downstream 2200882 21616920 ~ 21617040 (-) True XLOC_026301
TCONS_00051260 other downstream 2819562 20994504 ~ 20998360 (-) True XLOC_026288
TCONS_00051343 other upstream 585103 24403149 ~ 24403269 (-) True XLOC_026329
TCONS_00051348 other upstream 927720 24745766 ~ 24745881 (-) True XLOC_026332
TCONS_00051354 other upstream 1261403 25079449 ~ 25086951 (-) True XLOC_026336
TCONS_00051368 other upstream 1456096 25274142 ~ 25275351 (-) True XLOC_026342
TCONS_00051408 other upstream 2845002 26663048 ~ 26663165 (-) True XLOC_026371